277 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2635 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_2635  lactoylglutathione lyase  100 
 
 		 180 aa  379  1e-104  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00930  Lactoylglutathione lyase  79.44 
 
 		 182 aa  309  1e-83  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3005  lactoylglutathione lyase  64.53 
 
 		 182 aa  222  2e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.530682  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0906  lactoylglutathione lyase  61.54 
 
 		 181 aa  220  8e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5844  lactoylglutathione lyase  56.4 
 
 		 176 aa  194  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67500  lactoylglutathione lyase  56.4 
 
 		 176 aa  194  8.000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00410673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3617  lactoylglutathione lyase  51.43 
 
 		 180 aa  184  4e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00824672  normal  0.114242 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2703  lactoylglutathione lyase  51.19 
 
 		 184 aa  183  1.0000000000000001e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.373713 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3496  lactoylglutathione lyase  55.97 
 
 		 171 aa  179  2e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.146711  normal  0.38901 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0217  glyoxalase I  55.19 
 
 		 205 aa  178  4e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.464629  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0016  lactoylglutathione lyase  50.87 
 
 		 179 aa  176  1e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2137  lactoylglutathione lyase  52.41 
 
 		 175 aa  175  2e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000106217  hitchhiker  0.00000256832 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3106  lactoylglutathione lyase  52.66 
 
 		 173 aa  175  3e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00041709  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03130  lactoylglutathione lyase  57.33 
 
 		 185 aa  175  4e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4207  lactoylglutathione lyase  52.12 
 
 		 175 aa  174  6e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1997  lactoylglutathione lyase  51.81 
 
 		 175 aa  173  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.119068  hitchhiker  0.0000431423 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3766  lactoylglutathione lyase  51.81 
 
 		 175 aa  173  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.22051  normal  0.0297507 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0662  lactoylglutathione lyase  55.33 
 
 		 175 aa  173  9.999999999999999e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.795377  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0747  lactoylglutathione lyase  54.67 
 
 		 175 aa  172  2.9999999999999996e-42  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.639705  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2973  glyoxalase I  51.48 
 
 		 173 aa  171  5e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0205699 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2101  lactoylglutathione lyase  49.43 
 
 		 175 aa  170  1e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.407196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2923  glyoxalase I  54.09 
 
 		 173 aa  169  2e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.563927  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1047  lactoylglutathione lyase  50.93 
 
 		 166 aa  164  9e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.812371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0406  lactoylglutathione lyase  53.25 
 
 		 181 aa  161  4.0000000000000004e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0941783  normal  0.0136284 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0218  lactoylglutathione lyase  50.9 
 
 		 189 aa  157  6e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0840592 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0241  glyoxalase I  50.3 
 
 		 188 aa  155  3e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0180963  normal  0.955249 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04174  glyoxalase (Eurofung)  44.38 
 
 		 318 aa  136  2e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI03610  lactoylglutathione lyase, putative  47.74 
 
 		 166 aa  134  9.999999999999999e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.300105  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_64811  glyoxalase I  40 
 
 		 321 aa  112  2.0000000000000002e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.17903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12663  lactyolglutathione lyase  46.9 
 
 		 310 aa  111  7.000000000000001e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.176815  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3703  lactoylglutathione lyase  37.66 
 
 		 146 aa  94.7  6e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1845  lactoylglutathione lyase  38.89 
 
 		 128 aa  93.6  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3539  glyoxalase I  37.5 
 
 		 127 aa  92.8  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.344703  normal  0.0683463 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1648  lactoylglutathione lyase  38.1 
 
 		 130 aa  92.4  3e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.137836  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2791  lactoylglutathione lyase  37.01 
 
 		 138 aa  92  4e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6033  glyoxalase I  40.28 
 
 		 129 aa  91.7  5e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.705909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2111  glyoxalase I  40.14 
 
 		 122 aa  91.3  6e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1765  lactoylglutathione lyase  37.24 
 
 		 128 aa  91.3  7e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000260  lactoylglutathione lyase  37.5 
 
 		 128 aa  90.9  9e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05640  lactoylglutathione lyase  36 
 
 		 128 aa  90.9  9e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2984  lactoylglutathione lyase  36.55 
 
 		 136 aa  90.9  9e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.150551  normal  0.040699 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2413  response regulator receiver domain-containing protein  38.19 
 
 		 127 aa  90.5  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3939  lactoylglutathione lyase  38.26 
 
 		 158 aa  90.5  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0338387  normal  0.236164 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1040  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.91 
 
 		 147 aa  90.1  1e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.130409 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55130  lactoylglutathione lyase  34.72 
 
 		 131 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  4.39349e-16 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0213  lactoylglutathione lyase  36.05 
 
 		 129 aa  89.7  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.473875  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0876  lactoylglutathione lyase  36.05 
 
 		 238 aa  90.1  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2426  lactoylglutathione lyase  36.05 
 
 		 129 aa  89.7  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.792679  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0712  lactoylglutathione lyase  36.05 
 
 		 129 aa  89.7  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2552  glyoxalase I  36.77 
 
 		 136 aa  89.7  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3549  glyoxalase I  37.41 
 
 		 136 aa  89.7  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.231932  normal  0.149195 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0442  glyoxalase I  35.86 
 
 		 135 aa  90.1  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0697  lactoylglutathione lyase  36.05 
 
 		 129 aa  89.7  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1720  lactoylglutathione lyase  35.14 
 
 		 135 aa  89.7  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000901416  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2623  lactoylglutathione lyase  40.85 
 
 		 129 aa  89.4  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.39889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0531  lactoylglutathione lyase  36.11 
 
 		 138 aa  90.1  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000101735  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0593  lactoylglutathione lyase  40.14 
 
 		 129 aa  89.7  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1795  glyoxalase I  35.62 
 
 		 135 aa  89.7  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.118408  normal  0.0275652 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2346  lactoylglutathione lyase  36.05 
 
 		 129 aa  89.7  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.546588  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2732  lactoylglutathione lyase  36.05 
 
 		 129 aa  89.7  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2364  lactoylglutathione lyase  38.89 
 
 		 128 aa  89.4  3e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000749149 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1532  glyoxalase I  35.62 
 
 		 135 aa  88.6  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.178368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2047  lactoylglutathione lyase  36.36 
 
 		 138 aa  88.2  5e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.050639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02988  hypothetical protein  34.44 
 
 		 129 aa  88.2  5e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1870  lactoylglutathione lyase  36.36 
 
 		 138 aa  88.2  5e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2758  lactoylglutathione lyase  40.14 
 
 		 129 aa  88.6  5e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.394957  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1605  glyoxalase I  35.62 
 
 		 135 aa  88.2  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1739  glyoxalase I  35.62 
 
 		 135 aa  88.2  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00795001  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0580  lactoylglutathione lyase  37.32 
 
 		 129 aa  88.2  6e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1908  glyoxalase I  35.62 
 
 		 135 aa  88.2  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1545  glyoxalase I  35.62 
 
 		 135 aa  88.2  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.408301  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01621  glyoxalase I, Ni-dependent  34.48 
 
 		 135 aa  87.8  7e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00282129  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1989  lactoylglutathione lyase  34.48 
 
 		 135 aa  87.8  7e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000656309  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01611  hypothetical protein  34.48 
 
 		 135 aa  87.8  7e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00318347  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2363  glyoxalase I  34.48 
 
 		 135 aa  87.8  7e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0314391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1547  glyoxalase I  34.48 
 
 		 135 aa  87.8  7e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.726295  normal  0.763196 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1728  glyoxalase I  34.48 
 
 		 135 aa  87.8  7e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1395  lactoylglutathione lyase  35.33 
 
 		 130 aa  87.8  7e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.55095 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1978  glyoxalase I  34.48 
 
 		 135 aa  87.8  7e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.077498  hitchhiker  0.00100198 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0169  lactoylglutathione lyase  35.26 
 
 		 137 aa  87.8  8e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1182  lactoylglutathione lyase  35.86 
 
 		 128 aa  86.7  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1862  glyoxalase I  34.48 
 
 		 135 aa  87  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.144052  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1843  glyoxalase I  34.48 
 
 		 135 aa  86.7  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.816118  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4018  glyoxalase I  39.86 
 
 		 128 aa  86.7  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000451487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27731  lactoylglutathione lyase  36.3 
 
 		 133 aa  85.5  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19190  lactoylglutathione lyase  35.14 
 
 		 129 aa  85.5  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2384  lactoylglutathione lyase  34.48 
 
 		 135 aa  85.9  3e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0115374  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0152  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.62 
 
 		 146 aa  85.1  4e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0386322  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2709  lactoylglutathione lyase  34.46 
 
 		 127 aa  85.5  4e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2475  glyoxalase I  35.37 
 
 		 132 aa  85.5  4e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.505304  normal  0.0351257 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1623  lactoylglutathione lyase  36.11 
 
 		 130 aa  85.5  4e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.0000216677  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06791  glyoxalase I  34.48 
 
 		 129 aa  85.1  5e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0508996  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2668  lactoylglutathione lyase  33.79 
 
 		 135 aa  85.1  5e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000837248  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0396  lactoylglutathione lyase  34.9 
 
 		 135 aa  85.1  5e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.789224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2200  lactoylglutathione lyase  35.1 
 
 		 135 aa  85.1  5e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.351573  hitchhiker  0.00000414723 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18750  lactoylglutathione lyase  35.42 
 
 		 128 aa  85.1  5e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000523182  normal  0.0730899 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002942  lactoylglutathione lyase  33.77 
 
 		 129 aa  84.7  6e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000118696  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0401  lactoylglutathione lyase  35.92 
 
 		 128 aa  84.7  6e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.742989  normal  0.222386 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1843  hypothetical protein  34.72 
 
 		 146 aa  84.7  7e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0503  glyoxalase I  35.17 
 
 		 135 aa  84.7  7e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.457828  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>