More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_2552 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_2552  glyoxalase I  100 
 
 		 136 aa  285  2e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2984  lactoylglutathione lyase  83.09 
 
 		 136 aa  244  3e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.150551  normal  0.040699 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3549  glyoxalase I  81.62 
 
 		 136 aa  236  8e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.231932  normal  0.149195 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2791  lactoylglutathione lyase  81.88 
 
 		 138 aa  232  1.0000000000000001e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2047  lactoylglutathione lyase  81.16 
 
 		 138 aa  231  2.0000000000000002e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.050639  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1870  lactoylglutathione lyase  81.16 
 
 		 138 aa  231  2.0000000000000002e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3703  lactoylglutathione lyase  80.74 
 
 		 146 aa  226  5e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3939  lactoylglutathione lyase  78.63 
 
 		 158 aa  220  4e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0338387  normal  0.236164 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01621  glyoxalase I, Ni-dependent  75.37 
 
 		 135 aa  214  4e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00282129  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1989  lactoylglutathione lyase  75.37 
 
 		 135 aa  214  4e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000656309  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1547  glyoxalase I  75.37 
 
 		 135 aa  214  4e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.726295  normal  0.763196 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1728  glyoxalase I  75.37 
 
 		 135 aa  214  4e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2363  glyoxalase I  75.37 
 
 		 135 aa  214  4e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0314391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1978  glyoxalase I  75.37 
 
 		 135 aa  214  4e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.077498  hitchhiker  0.00100198 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01611  hypothetical protein  75.37 
 
 		 135 aa  214  4e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00318347  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1843  glyoxalase I  74.63 
 
 		 135 aa  213  9e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.816118  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1862  glyoxalase I  74.63 
 
 		 135 aa  212  9.999999999999999e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.144052  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2384  lactoylglutathione lyase  74.63 
 
 		 135 aa  212  9.999999999999999e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0115374  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2668  lactoylglutathione lyase  73.88 
 
 		 135 aa  211  1.9999999999999998e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000837248  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1532  glyoxalase I  74.63 
 
 		 135 aa  211  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.178368  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1720  lactoylglutathione lyase  74.63 
 
 		 135 aa  211  1.9999999999999998e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000901416  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1908  glyoxalase I  73.88 
 
 		 135 aa  211  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1605  glyoxalase I  73.88 
 
 		 135 aa  211  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1545  glyoxalase I  73.88 
 
 		 135 aa  211  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.408301  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1739  glyoxalase I  73.88 
 
 		 135 aa  211  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00795001  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1795  glyoxalase I  74.63 
 
 		 135 aa  211  3.9999999999999995e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.118408  normal  0.0275652 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2200  lactoylglutathione lyase  74.63 
 
 		 135 aa  210  7e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.351573  hitchhiker  0.00000414723 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1688  lactoylglutathione lyase  73.88 
 
 		 135 aa  209  9e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.900233  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1869  lactoylglutathione lyase  73.13 
 
 		 135 aa  208  2e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.189976  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1760  lactoylglutathione lyase  73.13 
 
 		 135 aa  208  2e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000424118  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2567  lactoylglutathione lyase  76.8 
 
 		 135 aa  206  1e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000056884  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0442  glyoxalase I  76.19 
 
 		 135 aa  204  3e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0396  lactoylglutathione lyase  71.21 
 
 		 135 aa  202  1e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.789224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0503  glyoxalase I  74.6 
 
 		 135 aa  200  4e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.457828  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2925  lactoylglutathione lyase  72.52 
 
 		 131 aa  201  4e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0520  lactoylglutathione lyase  71.21 
 
 		 135 aa  200  6e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0107856 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0411  lactoylglutathione lyase  71.21 
 
 		 135 aa  199  7e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.208299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0169  lactoylglutathione lyase  64.18 
 
 		 137 aa  190  5e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2232  lactoylglutathione lyase  68.66 
 
 		 136 aa  187  5e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00348977  normal  0.524619 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2915  lactoylglutathione lyase  66.92 
 
 		 132 aa  187  5.999999999999999e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.401625 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1867  lactoylglutathione lyase  67.91 
 
 		 136 aa  186  1e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0466217  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19190  lactoylglutathione lyase  65.87 
 
 		 129 aa  184  2e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2101  lactoylglutathione lyase  66.42 
 
 		 165 aa  185  2e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0339497  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0823  lactoylglutathione lyase  69.53 
 
 		 128 aa  184  3e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.457459  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2179  lactoylglutathione lyase  66.42 
 
 		 136 aa  184  3e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.894872  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1623  lactoylglutathione lyase  64.57 
 
 		 130 aa  184  3e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.0000216677  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1873  glyoxalase I  66.42 
 
 		 136 aa  184  4e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2107  lactoylglutathione lyase  67.16 
 
 		 136 aa  184  4e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.201436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2364  lactoylglutathione lyase  67.46 
 
 		 128 aa  184  5e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000749149 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0502  lactoylglutathione lyase (glyoxalase I)  63.43 
 
 		 136 aa  184  5e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18750  lactoylglutathione lyase  64.57 
 
 		 128 aa  184  5e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000523182  normal  0.0730899 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0531  lactoylglutathione lyase  65.65 
 
 		 138 aa  182  1.0000000000000001e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000101735  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0712  lactoylglutathione lyase  67.46 
 
 		 129 aa  182  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2044  lactoylglutathione lyase  66.42 
 
 		 136 aa  182  1.0000000000000001e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2732  lactoylglutathione lyase  67.46 
 
 		 129 aa  182  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0213  lactoylglutathione lyase  67.46 
 
 		 129 aa  182  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.473875  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0580  lactoylglutathione lyase  66.67 
 
 		 129 aa  182  1.0000000000000001e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0697  lactoylglutathione lyase  67.46 
 
 		 129 aa  182  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2426  lactoylglutathione lyase  67.46 
 
 		 129 aa  182  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.792679  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1402  lactoylglutathione lyase  65.6 
 
 		 127 aa  182  1.0000000000000001e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00101008  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1865  lactoylglutathione lyase  64.12 
 
 		 138 aa  182  1.0000000000000001e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.296961  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2346  lactoylglutathione lyase  67.46 
 
 		 129 aa  182  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.546588  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0876  lactoylglutathione lyase  67.46 
 
 		 238 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2098  lactoylglutathione lyase  65.6 
 
 		 128 aa  181  3e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.913757  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6033  glyoxalase I  66.67 
 
 		 129 aa  180  6e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.705909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02988  hypothetical protein  66.67 
 
 		 129 aa  180  7e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2360  lactoylglutathione lyase  64.93 
 
 		 136 aa  178  2e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.452951  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1182  lactoylglutathione lyase  64.29 
 
 		 128 aa  178  2e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4951  lactoylglutathione lyase  62.6 
 
 		 135 aa  178  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.78148 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0401  lactoylglutathione lyase  65.08 
 
 		 128 aa  177  4.999999999999999e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.742989  normal  0.222386 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2758  lactoylglutathione lyase  66.67 
 
 		 129 aa  177  5.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.394957  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2623  lactoylglutathione lyase  66.67 
 
 		 129 aa  176  9e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.39889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0593  lactoylglutathione lyase  65.87 
 
 		 129 aa  175  2e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1837  lactoylglutathione lyase  61.94 
 
 		 136 aa  174  3e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.429943  normal  0.179306 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002942  lactoylglutathione lyase  64.29 
 
 		 129 aa  174  4e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000118696  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3491  lactoylglutathione lyase  60.61 
 
 		 142 aa  174  4e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2073  lactoylglutathione lyase  63.43 
 
 		 136 aa  174  5e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0139  glyoxalase I  60.77 
 
 		 145 aa  173  6e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00128753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0739  glyoxalase I  62.7 
 
 		 132 aa  173  6e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.871991  normal  0.556357 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2281  lactoylglutathione lyase  66.42 
 
 		 136 aa  173  7e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00527881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1536  glyoxalase I  62.1 
 
 		 131 aa  173  7e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2057  lactoylglutathione lyase  66.42 
 
 		 136 aa  173  7e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000866783  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2104  lactoylglutathione lyase  66.42 
 
 		 136 aa  173  7e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00629536  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1765  lactoylglutathione lyase  65.08 
 
 		 128 aa  173  9e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3539  glyoxalase I  61.9 
 
 		 127 aa  172  9.999999999999999e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.344703  normal  0.0683463 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3896  lactoylglutathione lyase  61.07 
 
 		 143 aa  172  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0883965 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3847  lactoylglutathione lyase  61.07 
 
 		 143 aa  172  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1845  lactoylglutathione lyase  64.29 
 
 		 128 aa  172  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1202  lactoylglutathione lyase  59.54 
 
 		 144 aa  172  1.9999999999999998e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2709  lactoylglutathione lyase  64 
 
 		 127 aa  170  5e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4018  glyoxalase I  64.29 
 
 		 128 aa  170  5e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000451487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2563  lactoylglutathione lyase  61.94 
 
 		 136 aa  170  5e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.023799 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2269  lactoylglutathione lyase  65.67 
 
 		 136 aa  170  5.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000151296  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4555  hypothetical protein  65.67 
 
 		 136 aa  170  5.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05640  lactoylglutathione lyase  62.2 
 
 		 128 aa  170  6.999999999999999e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1648  lactoylglutathione lyase  62.7 
 
 		 130 aa  170  7.999999999999999e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.137836  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0681  lactoylglutathione lyase  63.49 
 
 		 128 aa  168  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.553347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2475  glyoxalase I  59.23 
 
 		 132 aa  168  2e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.505304  normal  0.0351257 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000260  lactoylglutathione lyase  64 
 
 		 128 aa  168  2e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0402  lactoylglutathione lyase  63.49 
 
 		 135 aa  167  3e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.69151  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>