More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2384 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012917  PC1_2384  lactoylglutathione lyase  100 
 
 
135 aa  276  1e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0115374  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2668  lactoylglutathione lyase  99.25 
 
 
135 aa  273  7e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000837248  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2200  lactoylglutathione lyase  84.44 
 
 
135 aa  244  4e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.351573  hitchhiker  0.00000414723 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1869  lactoylglutathione lyase  82.84 
 
 
135 aa  242  9.999999999999999e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.189976  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1760  lactoylglutathione lyase  82.84 
 
 
135 aa  242  9.999999999999999e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000424118  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1688  lactoylglutathione lyase  85.82 
 
 
135 aa  241  3e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.900233  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2567  lactoylglutathione lyase  82.09 
 
 
135 aa  239  9e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000056884  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1720  lactoylglutathione lyase  83.58 
 
 
135 aa  238  2e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000901416  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01621  glyoxalase I, Ni-dependent  80.6 
 
 
135 aa  227  4e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00282129  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1989  lactoylglutathione lyase  80.6 
 
 
135 aa  227  4e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000656309  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1978  glyoxalase I  80.6 
 
 
135 aa  227  4e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.077498  hitchhiker  0.00100198 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2363  glyoxalase I  80.6 
 
 
135 aa  227  4e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0314391  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01611  hypothetical protein  80.6 
 
 
135 aa  227  4e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00318347  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1728  glyoxalase I  80.6 
 
 
135 aa  227  4e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1547  glyoxalase I  80.6 
 
 
135 aa  227  4e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.726295  normal  0.763196 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1843  glyoxalase I  80.6 
 
 
135 aa  227  5e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.816118  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1532  glyoxalase I  80.6 
 
 
135 aa  226  7e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.178368  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1908  glyoxalase I  79.85 
 
 
135 aa  226  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1605  glyoxalase I  79.85 
 
 
135 aa  226  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1862  glyoxalase I  79.85 
 
 
135 aa  225  1e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.144052  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1545  glyoxalase I  79.85 
 
 
135 aa  226  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.408301  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1739  glyoxalase I  79.85 
 
 
135 aa  226  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00795001  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1795  glyoxalase I  80.6 
 
 
135 aa  222  1e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.118408  normal  0.0275652 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2984  lactoylglutathione lyase  76.87 
 
 
136 aa  217  3.9999999999999997e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.150551  normal  0.040699 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2552  glyoxalase I  74.63 
 
 
136 aa  212  9.999999999999999e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3549  glyoxalase I  76.12 
 
 
136 aa  212  9.999999999999999e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.231932  normal  0.149195 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0503  glyoxalase I  80.8 
 
 
135 aa  210  4.9999999999999996e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.457828  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0502  lactoylglutathione lyase (glyoxalase I)  70.9 
 
 
136 aa  210  5.999999999999999e-54  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3703  lactoylglutathione lyase  75.56 
 
 
146 aa  209  1e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0169  lactoylglutathione lyase  70.9 
 
 
137 aa  208  2e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0442  glyoxalase I  80.16 
 
 
135 aa  207  5e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1870  lactoylglutathione lyase  74.45 
 
 
138 aa  205  2e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0531  lactoylglutathione lyase  74.81 
 
 
138 aa  205  2e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000101735  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2047  lactoylglutathione lyase  74.45 
 
 
138 aa  205  2e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.050639  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2791  lactoylglutathione lyase  73.72 
 
 
138 aa  204  3e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3939  lactoylglutathione lyase  72.39 
 
 
158 aa  202  1e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0338387  normal  0.236164 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0396  lactoylglutathione lyase  69.7 
 
 
135 aa  202  2e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.789224  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0520  lactoylglutathione lyase  73.6 
 
 
135 aa  200  4e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0107856 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0411  lactoylglutathione lyase  69.7 
 
 
135 aa  199  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.208299  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2360  lactoylglutathione lyase  71.64 
 
 
136 aa  199  9.999999999999999e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.452951  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02988  hypothetical protein  71.65 
 
 
129 aa  198  1.9999999999999998e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2179  lactoylglutathione lyase  68.66 
 
 
136 aa  196  7.999999999999999e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.894872  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1867  lactoylglutathione lyase  70.9 
 
 
136 aa  196  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0466217  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1865  lactoylglutathione lyase  68.18 
 
 
138 aa  194  2.0000000000000003e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.296961  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2232  lactoylglutathione lyase  70.15 
 
 
136 aa  195  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00348977  normal  0.524619 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2044  lactoylglutathione lyase  70.15 
 
 
136 aa  194  3e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2107  lactoylglutathione lyase  70.15 
 
 
136 aa  194  3e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.201436  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2101  lactoylglutathione lyase  67.91 
 
 
165 aa  194  5.000000000000001e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0339497  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002942  lactoylglutathione lyase  69.29 
 
 
129 aa  192  1e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000118696  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3896  lactoylglutathione lyase  69.6 
 
 
143 aa  190  7e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0883965 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3847  lactoylglutathione lyase  69.6 
 
 
143 aa  190  7e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2925  lactoylglutathione lyase  70.23 
 
 
131 aa  186  1e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2413  response regulator receiver domain-containing protein  72.58 
 
 
127 aa  185  1e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1873  glyoxalase I  65.67 
 
 
136 aa  186  1e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0139  glyoxalase I  68 
 
 
145 aa  185  2e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00128753  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0401  lactoylglutathione lyase  66.67 
 
 
128 aa  185  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.742989  normal  0.222386 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1648  lactoylglutathione lyase  66.92 
 
 
130 aa  184  3e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.137836  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0593  lactoylglutathione lyase  68.25 
 
 
129 aa  184  3e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2623  lactoylglutathione lyase  68.25 
 
 
129 aa  184  4e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.39889  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2037  lactoylglutathione lyase  61.94 
 
 
136 aa  183  6e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6033  glyoxalase I  67.46 
 
 
129 aa  183  6e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.705909  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2563  lactoylglutathione lyase  62.69 
 
 
136 aa  183  6e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.023799 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1402  lactoylglutathione lyase  64.8 
 
 
127 aa  183  9e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00101008  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3491  lactoylglutathione lyase  67.2 
 
 
142 aa  182  9e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2758  lactoylglutathione lyase  67.46 
 
 
129 aa  183  9e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.394957  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4951  lactoylglutathione lyase  66.4 
 
 
135 aa  182  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.78148 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1182  lactoylglutathione lyase  67.46 
 
 
128 aa  182  1.0000000000000001e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2073  lactoylglutathione lyase  63.43 
 
 
136 aa  182  1.0000000000000001e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0739  glyoxalase I  68.25 
 
 
132 aa  182  1.0000000000000001e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.871991  normal  0.556357 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0638  glyoxalase I  63.08 
 
 
137 aa  182  2.0000000000000003e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.144519  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19190  lactoylglutathione lyase  63.57 
 
 
129 aa  181  2.0000000000000003e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1837  lactoylglutathione lyase  64.18 
 
 
136 aa  181  4.0000000000000006e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.429943  normal  0.179306 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4555  hypothetical protein  67.16 
 
 
136 aa  179  1e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2269  lactoylglutathione lyase  67.16 
 
 
136 aa  179  1e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000151296  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2915  lactoylglutathione lyase  66.92 
 
 
132 aa  179  1e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.401625 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000260  lactoylglutathione lyase  64.06 
 
 
128 aa  179  2e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2057  lactoylglutathione lyase  67.16 
 
 
136 aa  179  2e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000866783  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2104  lactoylglutathione lyase  67.16 
 
 
136 aa  179  2e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00629536  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2098  lactoylglutathione lyase  65.6 
 
 
128 aa  178  2e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.913757  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2281  lactoylglutathione lyase  67.16 
 
 
136 aa  179  2e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00527881  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1536  glyoxalase I  64.84 
 
 
131 aa  177  4.999999999999999e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18750  lactoylglutathione lyase  63.78 
 
 
128 aa  176  7e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000523182  normal  0.0730899 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2709  lactoylglutathione lyase  64.8 
 
 
127 aa  176  7e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0566  lactoylglutathione lyase  66.4 
 
 
135 aa  176  9e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1623  lactoylglutathione lyase  62.99 
 
 
130 aa  176  9e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.0000216677  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0402  lactoylglutathione lyase  66.4 
 
 
135 aa  176  9e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.69151  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02261  putative lactoylglutathione lyase  64 
 
 
132 aa  176  1e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0600753  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0876  lactoylglutathione lyase  64.34 
 
 
238 aa  175  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1202  lactoylglutathione lyase  64.57 
 
 
144 aa  176  1e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0213  lactoylglutathione lyase  64.34 
 
 
129 aa  175  2e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.473875  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0712  lactoylglutathione lyase  64.34 
 
 
129 aa  175  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2625  glyoxalase I  62.79 
 
 
129 aa  175  2e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.738569  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2426  lactoylglutathione lyase  64.34 
 
 
129 aa  175  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.792679  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2346  lactoylglutathione lyase  64.34 
 
 
129 aa  175  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.546588  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05640  lactoylglutathione lyase  62.2 
 
 
128 aa  175  2e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2732  lactoylglutathione lyase  64.34 
 
 
129 aa  175  2e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0697  lactoylglutathione lyase  64.34 
 
 
129 aa  175  2e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4018  glyoxalase I  63.49 
 
 
128 aa  174  4e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000451487  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2475  glyoxalase I  62.88 
 
 
132 aa  173  6e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.505304  normal  0.0351257 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1395  lactoylglutathione lyase  64.52 
 
 
130 aa  173  6e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.55095 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>