More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1990 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1990  lactoylglutathione lyase  100 
 
 		 163 aa  332  2e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.323356  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0139  glyoxalase I  49.25 
 
 		 145 aa  136  1e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00128753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000260  lactoylglutathione lyase  48.44 
 
 		 128 aa  133  9.999999999999999e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3847  lactoylglutathione lyase  45.11 
 
 		 143 aa  131  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3896  lactoylglutathione lyase  45.11 
 
 		 143 aa  131  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0883965 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0531  lactoylglutathione lyase  46.97 
 
 		 138 aa  130  1.0000000000000001e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000101735  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0502  lactoylglutathione lyase (glyoxalase I)  44.78 
 
 		 136 aa  128  4.0000000000000003e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4951  lactoylglutathione lyase  48.8 
 
 		 135 aa  127  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.78148 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0638  glyoxalase I  46.51 
 
 		 137 aa  125  2.0000000000000002e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.144519  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1510  lactoylglutathione lyase  48.03 
 
 		 127 aa  125  2.0000000000000002e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000345652  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1202  lactoylglutathione lyase  46.4 
 
 		 144 aa  124  5e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1865  lactoylglutathione lyase  47.29 
 
 		 138 aa  124  7e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.296961  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27731  lactoylglutathione lyase  46.4 
 
 		 133 aa  123  1e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1395  lactoylglutathione lyase  46.15 
 
 		 130 aa  122  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.55095 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1870  lactoylglutathione lyase  49.63 
 
 		 138 aa  122  3e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2047  lactoylglutathione lyase  49.63 
 
 		 138 aa  122  3e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.050639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2413  response regulator receiver domain-containing protein  48.39 
 
 		 127 aa  121  5e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2567  lactoylglutathione lyase  45.74 
 
 		 135 aa  121  5e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000056884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002942  lactoylglutathione lyase  46.77 
 
 		 129 aa  120  6e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000118696  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1760  lactoylglutathione lyase  45.74 
 
 		 135 aa  120  6e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000424118  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1869  lactoylglutathione lyase  45.74 
 
 		 135 aa  120  6e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.189976  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3491  lactoylglutathione lyase  41.22 
 
 		 142 aa  120  6e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4246  lactoylglutathione lyase  43.31 
 
 		 128 aa  120  7e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00000558126  hitchhiker  0.000000049378 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2709  lactoylglutathione lyase  43.31 
 
 		 127 aa  120  8e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2179  lactoylglutathione lyase  44.12 
 
 		 136 aa  120  8e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.894872  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1477  lactoylglutathione lyase  45.8 
 
 		 136 aa  120  9e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2200  lactoylglutathione lyase  45.74 
 
 		 135 aa  120  9.999999999999999e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.351573  hitchhiker  0.00000414723 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2984  lactoylglutathione lyase  47.01 
 
 		 136 aa  119  9.999999999999999e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.150551  normal  0.040699 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1688  lactoylglutathione lyase  46.27 
 
 		 135 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.900233  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02988  hypothetical protein  46.77 
 
 		 129 aa  119  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6549  lactoylglutathione lyase  48.41 
 
 		 130 aa  118  3.9999999999999996e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.46236 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05640  lactoylglutathione lyase  44.53 
 
 		 128 aa  118  3.9999999999999996e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2360  lactoylglutathione lyase  45.59 
 
 		 136 aa  118  3.9999999999999996e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.452951  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1648  lactoylglutathione lyase  46.46 
 
 		 130 aa  118  4.9999999999999996e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.137836  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2384  lactoylglutathione lyase  45.24 
 
 		 135 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0115374  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2791  lactoylglutathione lyase  48.06 
 
 		 138 aa  117  4.9999999999999996e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2098  lactoylglutathione lyase  42.19 
 
 		 128 aa  117  6e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.913757  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3939  lactoylglutathione lyase  49.22 
 
 		 158 aa  117  6e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0338387  normal  0.236164 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3549  glyoxalase I  48 
 
 		 136 aa  117  7e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.231932  normal  0.149195 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2668  lactoylglutathione lyase  45.24 
 
 		 135 aa  117  7e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000837248  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0401  lactoylglutathione lyase  43.31 
 
 		 128 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.742989  normal  0.222386 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2563  lactoylglutathione lyase  41.18 
 
 		 136 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.023799 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2426  lactoylglutathione lyase  45.6 
 
 		 129 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.792679  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0681  lactoylglutathione lyase  43.75 
 
 		 128 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.553347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0402  lactoylglutathione lyase  44.09 
 
 		 135 aa  116  1.9999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.69151  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0213  lactoylglutathione lyase  45.6 
 
 		 129 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.473875  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2346  lactoylglutathione lyase  45.6 
 
 		 129 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.546588  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0566  lactoylglutathione lyase  44.09 
 
 		 135 aa  116  1.9999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0876  lactoylglutathione lyase  45.6 
 
 		 238 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0593  lactoylglutathione lyase  44.09 
 
 		 129 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1532  glyoxalase I  45.67 
 
 		 135 aa  115  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.178368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0697  lactoylglutathione lyase  45.6 
 
 		 129 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0580  lactoylglutathione lyase  44.09 
 
 		 129 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02739  glyoxalase I, nickel isomerase (Lactoylglutathione lyase)  42.86 
 
 		 133 aa  115  1.9999999999999998e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.206063  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0712  lactoylglutathione lyase  45.6 
 
 		 129 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2732  lactoylglutathione lyase  45.6 
 
 		 129 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1908  glyoxalase I  45.67 
 
 		 135 aa  115  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1605  glyoxalase I  45.67 
 
 		 135 aa  115  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2044  lactoylglutathione lyase  45.38 
 
 		 136 aa  115  3e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1545  glyoxalase I  45.67 
 
 		 135 aa  115  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.408301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6033  glyoxalase I  44.88 
 
 		 129 aa  115  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.705909  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1720  lactoylglutathione lyase  44.78 
 
 		 135 aa  115  3e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000901416  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1739  glyoxalase I  45.67 
 
 		 135 aa  115  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00795001  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4018  glyoxalase I  44.53 
 
 		 128 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000451487  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3703  lactoylglutathione lyase  47.66 
 
 		 146 aa  114  3.9999999999999997e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2037  lactoylglutathione lyase  43.31 
 
 		 136 aa  114  5e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0169  lactoylglutathione lyase  44.09 
 
 		 137 aa  114  6e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2232  lactoylglutathione lyase  44.62 
 
 		 136 aa  114  6e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00348977  normal  0.524619 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2758  lactoylglutathione lyase  44.09 
 
 		 129 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.394957  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01621  glyoxalase I, Ni-dependent  44.88 
 
 		 135 aa  113  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00282129  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1989  lactoylglutathione lyase  44.88 
 
 		 135 aa  113  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000656309  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2363  glyoxalase I  44.88 
 
 		 135 aa  113  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0314391  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19190  lactoylglutathione lyase  43.41 
 
 		 129 aa  113  1.0000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1728  glyoxalase I  44.88 
 
 		 135 aa  113  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1547  glyoxalase I  44.88 
 
 		 135 aa  113  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.726295  normal  0.763196 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1873  glyoxalase I  42.22 
 
 		 136 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1862  glyoxalase I  44.88 
 
 		 135 aa  113  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.144052  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2450  lactoylglutathione lyase  43.2 
 
 		 130 aa  113  1.0000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00862071  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2073  lactoylglutathione lyase  41.22 
 
 		 136 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1978  glyoxalase I  44.88 
 
 		 135 aa  113  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.077498  hitchhiker  0.00100198 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01611  hypothetical protein  44.88 
 
 		 135 aa  113  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00318347  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18750  lactoylglutathione lyase  45.6 
 
 		 128 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000523182  normal  0.0730899 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2623  lactoylglutathione lyase  44.09 
 
 		 129 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.39889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2475  glyoxalase I  43.2 
 
 		 132 aa  112  2.0000000000000002e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.505304  normal  0.0351257 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1623  lactoylglutathione lyase  45.6 
 
 		 130 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.0000216677  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1867  lactoylglutathione lyase  43.85 
 
 		 136 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0466217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1182  lactoylglutathione lyase  43.31 
 
 		 128 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2101  lactoylglutathione lyase  42.34 
 
 		 165 aa  112  3e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0339497  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2160  glyoxalase I  44 
 
 		 132 aa  112  3e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.889809  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2625  glyoxalase I  42.52 
 
 		 129 aa  112  3e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.738569  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2107  lactoylglutathione lyase  43.85 
 
 		 136 aa  112  3e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.201436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07081  glyoxalase I  41.27 
 
 		 129 aa  111  4.0000000000000004e-24  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.199659  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1402  lactoylglutathione lyase  42.86 
 
 		 127 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00101008  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1843  glyoxalase I  44.09 
 
 		 135 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.816118  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06791  glyoxalase I  41.27 
 
 		 129 aa  110  6e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0508996  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0652  glyoxalase I  40.48 
 
 		 129 aa  110  8.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3539  glyoxalase I  44.8 
 
 		 127 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.344703  normal  0.0683463 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0739  glyoxalase I  43.2 
 
 		 132 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.871991  normal  0.556357 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2733  lactoylglutathione lyase  46.09 
 
 		 127 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1795  glyoxalase I  43.31 
 
 		 135 aa  109  2.0000000000000002e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.118408  normal  0.0275652 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>