36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0255 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0255  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
389 aa  798    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00641296  hitchhiker  0.00158849 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2266  alpha/beta hydrolase fold  44.74 
 
 
322 aa  324  1e-87  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00219689 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0314  alpha/beta hydrolase fold  23.85 
 
 
303 aa  60.5  0.00000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.000332733  normal  0.010488 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4368  alpha/beta hydrolase fold  37.31 
 
 
277 aa  51.6  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000918416  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0135  alpha/beta hydrolase fold  32.26 
 
 
265 aa  50.8  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4002  alpha/beta hydrolase fold protein  33.78 
 
 
266 aa  48.9  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2417  Alpha/beta hydrolase fold  29.66 
 
 
302 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0271863 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0914  alpha/beta hydrolase fold protein  32.85 
 
 
255 aa  48.5  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3257  alpha/beta hydrolase fold protein  29.27 
 
 
302 aa  47.8  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3581  alpha/beta hydrolase fold  29.27 
 
 
302 aa  47.4  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.950076 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2613  alpha/beta hydrolase  20.66 
 
 
270 aa  46.6  0.0008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.101876  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2410  alpha/beta hydrolase fold protein  28.37 
 
 
265 aa  45.8  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.991498  normal  0.124354 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1232  alpha/beta hydrolase fold protein  29.27 
 
 
277 aa  45.4  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3219  alpha/beta hydrolase fold protein  35.29 
 
 
270 aa  45.8  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.910977  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3689  alpha/beta hydrolase fold protein  26.55 
 
 
302 aa  45.8  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1552  alpha/beta hydrolase fold protein  29.57 
 
 
329 aa  45.4  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.116512  hitchhiker  0.00140159 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0572  alpha/beta hydrolase fold  30.23 
 
 
266 aa  45.8  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13192  non-heme haloperoxidase hpx  28.36 
 
 
299 aa  45.4  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.305997 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3108  alpha/beta hydrolase fold protein  26.83 
 
 
248 aa  45.1  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000000962894  hitchhiker  0.00443199 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0843  Alpha/beta hydrolase fold  30.43 
 
 
272 aa  44.3  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4362  alpha/beta hydrolase fold protein  33.75 
 
 
272 aa  44.3  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3245  alpha/beta hydrolase fold  34.85 
 
 
271 aa  43.9  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6373  alpha/beta hydrolase fold protein  25.64 
 
 
303 aa  43.9  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5034  alpha/beta hydrolase fold  29.41 
 
 
245 aa  43.5  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.246074  normal  0.671643 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0258  alpha/beta hydrolase fold protein  26.09 
 
 
283 aa  43.5  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1760  alpha/beta hydrolase fold  28.83 
 
 
302 aa  43.5  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176394  normal  0.0428772 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8806  hydrolase  28 
 
 
254 aa  43.5  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0017  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 
327 aa  43.1  0.008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0512561 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3042  Alpha/beta hydrolase  27.38 
 
 
380 aa  43.1  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.440112  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1154  hydrolase, alpha/beta fold family  35.42 
 
 
259 aa  43.1  0.009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0115  alpha/beta hydrolase fold protein  23.36 
 
 
267 aa  42.7  0.01  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3896  alpha/beta hydrolase fold protein  29.59 
 
 
263 aa  42.7  0.01  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.407554  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  29.9 
 
 
264 aa  42.7  0.01  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1509  alpha/beta hydrolase fold  31.34 
 
 
287 aa  42.7  0.01  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4227  alpha/beta hydrolase fold protein  30.77 
 
 
266 aa  42.7  0.01  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3959  alpha/beta hydrolase fold  27.55 
 
 
264 aa  42.7  0.01  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.166818 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>