197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_3966 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1748  hypothetical protein  98.48 
 
 		 394 aa  792    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1631  hypothetical protein  87.08 
 
 		 398 aa  698    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34980  Glutamyl aminopeptidase familiy M42  79.9 
 
 		 405 aa  635    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3749  peptidase M42  85.9 
 
 		 398 aa  695    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0267864 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4102  peptidase M42  86.01 
 
 		 396 aa  698    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.727152 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1298  peptidase M42 family hydrolase  96.44 
 
 		 394 aa  744    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1340  peptidase M42 family hydrolase  98.48 
 
 		 394 aa  792    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2957  peptidase M42 family protein  83.46 
 
 		 399 aa  681    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.705814  normal  0.012913 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3966  peptidase M42 family protein  100 
 
 		 394 aa  799    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.123914 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19350  hypothetical protein  79.53 
 
 		 398 aa  616  1e-175  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0348157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1666  hypothetical protein  79.02 
 
 		 398 aa  614  1e-175  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.669233  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0140  hydrolase, peptidase M42 family  51.97 
 
 		 399 aa  409  1e-113  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.138245  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2678  peptidase M42 family hydrolase  51.32 
 
 		 394 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.899426 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0112  hydrolase, peptidase M42 family  56.57 
 
 		 372 aa  398  1e-109  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.294228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0814  peptidase M42 family protein  54.99 
 
 		 371 aa  393  1e-108  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0829922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1987  peptidase M42  54.14 
 
 		 387 aa  390  1e-107  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2956  peptidase M42 family protein  51.08 
 
 		 387 aa  383  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.730035  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3665  peptidase M42 family protein  49.19 
 
 		 392 aa  368  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00161837 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0220  peptidase M42 family protein  51.9 
 
 		 363 aa  353  2.9999999999999997e-96  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0858  peptidase M42 family protein  52.45 
 
 		 397 aa  348  1e-94  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.967973  normal  0.0317113 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0915  peptidase M42 family protein  52.17 
 
 		 397 aa  344  2e-93  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3392  peptidase M42 family protein  49.57 
 
 		 402 aa  297  2e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.13042  normal  0.889959 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0017  hypothetical protein  42.47 
 
 		 342 aa  245  9.999999999999999e-64  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000301485  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1427  peptidase M42 family protein  36.89 
 
 		 343 aa  243  3e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1456  peptidase M42 family protein  36.89 
 
 		 343 aa  243  3e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1078  Peptidase, family M20/M25/M40 protein  35.5 
 
 		 349 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0754256  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0850  M20/M25/M40 family peptidase  35.4 
 
 		 349 aa  243  6e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0897  M20/M25/M40 family peptidase  35.4 
 
 		 349 aa  243  6e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.058165  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0723  peptidase M42 family protein  36.39 
 
 		 349 aa  242  7e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000063382  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0983  M20/M25/M40 family peptidase  35.1 
 
 		 349 aa  241  1e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0064567  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0795  glucanase; deblocking aminopeptidase  35.1 
 
 		 349 aa  241  1e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0139828  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0985  Peptidase, family M20/M25/M40 protein  35.1 
 
 		 349 aa  241  1e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.14885e-38 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0799  glucanase; deblocking aminopeptidase  35.1 
 
 		 349 aa  241  2e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.650698  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0298  peptidase M42  39.41 
 
 		 357 aa  237  2e-61  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0939  deblocking aminopeptidase  34.81 
 
 		 349 aa  236  4e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0018694  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1943  hypothetical protein  35.63 
 
 		 345 aa  234  2.0000000000000002e-60  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.643032  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4392  deblocking aminopeptidase  34.51 
 
 		 349 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000145821  hitchhiker  1.52043e-22 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0790  peptidase M42 family protein  34.02 
 
 		 349 aa  229  9e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1785  peptidase M42 family protein  36.45 
 
 		 343 aa  223  4e-57  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1100  peptidase M42 family protein  35.8 
 
 		 340 aa  217  2.9999999999999998e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1252  aminopeptidase  33.14 
 
 		 344 aa  194  2e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0654379  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0109  peptidase M42 family protein  34.31 
 
 		 340 aa  192  7e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000430902  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2439  hypothetical protein  33.92 
 
 		 363 aa  191  2e-47  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0671697  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0952  peptidase M42 family protein  31.88 
 
 		 353 aa  170  4e-41  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00111271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1087  peptidase M42  27.76 
 
 		 349 aa  97.4  4e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3182  peptidases M20 and M42  26.78 
 
 		 346 aa  97.1  5e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0675112 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2270  glucanase  29.19 
 
 		 344 aa  92  1e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4635  peptidase M42 family protein  28.41 
 
 		 348 aa  87.4  4e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0148815  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1759  cellulase  29.58 
 
 		 339 aa  80.5  0.00000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0820  peptidase M42 family protein  27.17 
 
 		 357 aa  80.1  0.00000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.898697  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1702  cellulase  29.11 
 
 		 339 aa  78.2  0.0000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0681  Cellulase  26.11 
 
 		 332 aa  75.9  0.000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2259  Cellulase  23.05 
 
 		 358 aa  73.6  0.000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0943649  unclonable  0.0000000415481 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0441  cellulase  25.11 
 
 		 350 aa  73.2  0.000000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.174946  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1077  cellulase  25.63 
 
 		 336 aa  72  0.00000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0394198  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0002  cellulase  24.91 
 
 		 365 aa  71.2  0.00000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0842  cellulase  23.23 
 
 		 362 aa  71.2  0.00000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1761  peptidase M42 family protein  23.69 
 
 		 348 aa  71.2  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0214  cellulase  25.47 
 
 		 357 aa  70.9  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.880444  normal  0.715084 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2098  peptidase M42 family protein  25.4 
 
 		 353 aa  69.7  0.00000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.940358 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2196  hydrolase, putative  28.23 
 
 		 354 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.84144  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1385  peptidase M42 family protein  27.73 
 
 		 357 aa  68.6  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0718  peptidase M42 family protein  25.82 
 
 		 363 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0278  endo-1,4-beta-glucanase  23.05 
 
 		 363 aa  68.2  0.0000000002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1076  peptidase M42 family protein  22.85 
 
 		 347 aa  68.6  0.0000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.189287  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0377  cellulase  25.82 
 
 		 340 aa  67.8  0.0000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0313  Cellulase  23.63 
 
 		 342 aa  67  0.0000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2294  peptidase M42  26.4 
 
 		 356 aa  66.6  0.0000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.365569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0867  peptidase M42 family protein  22.79 
 
 		 382 aa  66.2  0.0000000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.937418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0950  cellulase  21.26 
 
 		 384 aa  65.9  0.000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.374031  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1216  putative lyase/synthase  27 
 
 		 356 aa  65.5  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0144913  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0177  cellulase  27.48 
 
 		 339 aa  65.1  0.000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2478  Cellulase  24.86 
 
 		 359 aa  65.1  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0208  peptidase M42 family protein  22.32 
 
 		 334 aa  65.5  0.000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.53357  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1703  peptidase M42 family protein  22.84 
 
 		 332 aa  64.7  0.000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2999  peptidase M42 family protein  26.21 
 
 		 351 aa  64.3  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0452  cellulase  23.26 
 
 		 362 aa  64.3  0.000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.547156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0097  cellulase  21.53 
 
 		 334 aa  63.5  0.000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.609306  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0712  cellulase  26.05 
 
 		 350 aa  63.5  0.000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1551  cellulase  22.98 
 
 		 350 aa  63.5  0.000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2043  M42 family peptidase  22.9 
 
 		 358 aa  63.5  0.000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1433  Cellulase  24.15 
 
 		 340 aa  63.2  0.000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1120  cellulase  20 
 
 		 340 aa  63.2  0.000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0779  peptidase M42 family protein  27.27 
 
 		 356 aa  63.2  0.000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0368  cellulase  22.98 
 
 		 350 aa  62.8  0.000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0158908 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4119  putative fructose-specific phosphotransferase system protein FrvX  26.88 
 
 		 356 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0763  peptidase M42 family protein  27.27 
 
 		 356 aa  62.8  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.776489  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1760  peptidase M42 family protein  22.22 
 
 		 332 aa  62.4  0.00000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0468  cellulase  22.98 
 
 		 350 aa  62.4  0.00000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0307085  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4126  putative fructose-specific phosphotransferase system protein FrvX  26.88 
 
 		 356 aa  62  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4086  Cellulase  26.88 
 
 		 356 aa  62  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4838  M42 family peptidase  22.29 
 
 		 357 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03732  hypothetical protein  26.88 
 
 		 356 aa  62  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0724  peptidase M42 family protein  29.41 
 
 		 350 aa  62  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.143036  normal  0.785387 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0738  peptidase M42  27.31 
 
 		 353 aa  62  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.511886  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4428  putative fructose-specific phosphotransferase system protein FrvX  27.27 
 
 		 356 aa  62  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1432  cellulase  21.93 
 
 		 362 aa  61.6  0.00000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.26952  normal  0.0787337 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0608  peptidase M42  23.89 
 
 		 349 aa  61.6  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0364864  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4829  peptidase, M42 family  22.29 
 
 		 357 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0253333  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0709  cellulase  22.32 
 
 		 351 aa  61.6  0.00000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.000744044  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>