218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_2999 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_2999  peptidase M42 family protein  100 
 
 		 351 aa  721    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36500  hypothetical protein  60.47 
 
 		 358 aa  411  1e-114  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0413589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3132  hypothetical protein  59.59 
 
 		 358 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0718  peptidase M42 family protein  42.36 
 
 		 363 aa  242  6e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3182  peptidases M20 and M42  34.02 
 
 		 346 aa  199  6e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0675112 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1087  peptidase M42  34.29 
 
 		 349 aa  196  6e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4635  peptidase M42 family protein  35.09 
 
 		 348 aa  190  2.9999999999999997e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0148815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2270  glucanase  34.49 
 
 		 344 aa  182  8.000000000000001e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0950  cellulase  29.94 
 
 		 384 aa  99.8  7e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.374031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0452  cellulase  32.34 
 
 		 362 aa  99  1e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.547156  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0542  cellulase  30.9 
 
 		 362 aa  97.1  4e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.192278  hitchhiker  0.00117454 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0313  Cellulase  26.86 
 
 		 342 aa  96.7  5e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1432  cellulase  29.01 
 
 		 362 aa  94.4  3e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.26952  normal  0.0787337 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0842  cellulase  28.77 
 
 		 362 aa  90.5  3e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1761  peptidase M42 family protein  26.51 
 
 		 348 aa  90.5  4e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0680  peptidase M42 family protein  24.57 
 
 		 336 aa  87.8  3e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2478  Cellulase  27.56 
 
 		 359 aa  87.8  3e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1401  M42 glutamyl aminopeptidase  28.49 
 
 		 350 aa  85.5  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.413323  normal  0.234564 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1758  peptidase M42 family protein  24.86 
 
 		 331 aa  83.2  0.000000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0724  peptidase M42 family protein  29.43 
 
 		 350 aa  82  0.00000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.143036  normal  0.785387 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0712  cellulase  25.14 
 
 		 350 aa  82  0.00000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1701  peptidase M42 family protein  24.86 
 
 		 331 aa  81.6  0.00000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0609  peptidase M42 family protein  26.63 
 
 		 316 aa  80.9  0.00000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.467193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1077  cellulase  27.22 
 
 		 336 aa  80.5  0.00000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0394198  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0208  peptidase M42 family protein  24.43 
 
 		 334 aa  80.1  0.00000000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.53357  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0378  peptidase M42 family protein  25.71 
 
 		 327 aa  80.1  0.00000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1785  peptidase M42 family protein  24.29 
 
 		 343 aa  78.2  0.0000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0709  cellulase  23.81 
 
 		 351 aa  78.6  0.0000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.000744044  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1324  peptidase M42 family protein  27.55 
 
 		 333 aa  77.8  0.0000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.229406  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1121  peptidase M42 family protein  23.62 
 
 		 334 aa  77.8  0.0000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0867  peptidase M42 family protein  25.5 
 
 		 382 aa  77.8  0.0000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.937418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0608  peptidase M42  24.77 
 
 		 349 aa  77  0.0000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0364864  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2766  peptidase M42 family protein  26.15 
 
 		 336 aa  76.3  0.0000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1676  peptidase M42 family protein  27.12 
 
 		 346 aa  76.6  0.0000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1702  peptidase M42 family protein  24.56 
 
 		 341 aa  75.5  0.000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0214  cellulase  23.73 
 
 		 357 aa  75.9  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.880444  normal  0.715084 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1433  Cellulase  25.93 
 
 		 340 aa  75.1  0.000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0815  peptidase M42 family protein  28.09 
 
 		 316 aa  75.1  0.000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2346  peptidase M42 family protein  23.66 
 
 		 366 aa  74.7  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.917875  normal  0.728573 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1201  peptidase M42 family protein  24.85 
 
 		 345 aa  74.3  0.000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.214071  normal  0.0232682 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0820  peptidase M42 family protein  25.21 
 
 		 357 aa  73.9  0.000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.898697  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0738  peptidase M42  28.3 
 
 		 353 aa  73.9  0.000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.511886  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0590  hypothetical protein  25.82 
 
 		 352 aa  73.9  0.000000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0441  cellulase  23.03 
 
 		 350 aa  73.2  0.000000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.174946  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3752  peptidase M42 family protein  23.4 
 
 		 366 aa  72.4  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0468  cellulase  24.55 
 
 		 350 aa  71.6  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0307085  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1760  peptidase M42 family protein  24.72 
 
 		 328 aa  70.9  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0368  cellulase  24.78 
 
 		 350 aa  70.5  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0158908 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1551  cellulase  24.25 
 
 		 350 aa  70.5  0.00000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3257  cellulase  26.87 
 
 		 361 aa  70.1  0.00000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0039122  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0814  peptidase M42 family protein  23.3 
 
 		 371 aa  70.1  0.00000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0829922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0895  Cellulase  25.98 
 
 		 355 aa  69.7  0.00000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0602  peptidase M42 family protein  25.29 
 
 		 316 aa  69.7  0.00000000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1571  peptidase M42 family protein  23.24 
 
 		 317 aa  68.9  0.0000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0349  peptidase M42 family protein  26.61 
 
 		 352 aa  68.9  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.326281 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34980  Glutamyl aminopeptidase familiy M42  25.65 
 
 		 405 aa  68.2  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4313  glucanase/ deblocking aminopeptidase  26.97 
 
 		 361 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.230763  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0995  inositol phosphatase/fructose-1,6-bisphosphatase  25.45 
 
 		 349 aa  67.8  0.0000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.383048 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0097  cellulase  23.01 
 
 		 334 aa  66.6  0.0000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.609306  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4695  peptidase, M42 family  26.69 
 
 		 361 aa  66.2  0.0000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000157013  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4702  M42 family peptidase  26.69 
 
 		 361 aa  66.2  0.0000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00201284  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4302  glucanase/ deblocking aminopeptidase  26.69 
 
 		 361 aa  66.2  0.0000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000481551  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4686  peptidase, M42 family  26.69 
 
 		 361 aa  66.2  0.0000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.124679999999999e-51 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0558  peptidase, M42 family  26.76 
 
 		 361 aa  65.9  0.0000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000121832  hitchhiker  5.5021500000000004e-18 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4679  peptidase, M42 family  26.76 
 
 		 361 aa  65.9  0.0000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000338182  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4467  M42 family peptidase  26.4 
 
 		 361 aa  65.9  0.0000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0619409  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4815  M42 family peptidase  26.4 
 
 		 361 aa  65.9  0.0000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000499602  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1376  peptidase M42 family protein  24.3 
 
 		 354 aa  65.9  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0376322  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0232  peptidase M42 family protein  25.07 
 
 		 352 aa  65.9  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0109  peptidase M42 family protein  22.61 
 
 		 340 aa  65.5  0.000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000430902  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2745  Glutamyl aminopeptidase  23.3 
 
 		 358 aa  65.5  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000840882  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1213  peptidase M42 family protein  23.16 
 
 		 344 aa  65.9  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0763  peptidase M42 family protein  26.77 
 
 		 356 aa  65.9  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.776489  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0779  peptidase M42 family protein  26.38 
 
 		 356 aa  65.1  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0315  aminopeptidase  26.64 
 
 		 359 aa  64.7  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2678  peptidase M42 family hydrolase  23.17 
 
 		 394 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.899426 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0803  Cellulase  24.36 
 
 		 362 aa  64.7  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1139  peptidase M42 family protein  25.56 
 
 		 356 aa  65.1  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.246502  normal  0.743458 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0952  peptidase M42 family protein  23.25 
 
 		 353 aa  64.7  0.000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00111271  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2409  Cellulase  23.4 
 
 		 348 aa  64.3  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0376  peptidase M42 family protein  23.96 
 
 		 346 aa  64.3  0.000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4402  cellulase  27.35 
 
 		 361 aa  64.3  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.078585  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2957  peptidase M42 family protein  25.42 
 
 		 399 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.705814  normal  0.012913 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3646  peptidase M42 family protein  24.42 
 
 		 381 aa  63.9  0.000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0943449  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0377  cellulase  24.7 
 
 		 340 aa  63.5  0.000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3665  peptidase M42 family protein  23.03 
 
 		 392 aa  63.2  0.000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00161837 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1273  Cellulase  23.96 
 
 		 345 aa  62.8  0.000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.758281  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2655  Cellulase  25.35 
 
 		 361 aa  62.8  0.000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000026647  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2521  exoaminopeptidase  23.96 
 
 		 345 aa  62.8  0.000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0177  cellulase  25.45 
 
 		 339 aa  62.8  0.000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1285  exoaminopeptidase  23.96 
 
 		 345 aa  62.8  0.000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.836873 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1994  peptidase M42  27.07 
 
 		 354 aa  62.8  0.000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.0000914633  normal  0.691904 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0934  peptidase M42 family protein  25 
 
 		 349 aa  62.8  0.000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3616  exoaminopeptidase  23.32 
 
 		 345 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.874424 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2674  exoaminopeptidase  23.32 
 
 		 345 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2536  exoaminopeptidase  24.28 
 
 		 345 aa  62  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0140  hydrolase, peptidase M42 family  23.01 
 
 		 399 aa  62  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.138245  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2234  peptidase M42 family protein  28.26 
 
 		 354 aa  62.4  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.323516 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0912  peptidase M42  24.79 
 
 		 345 aa  61.2  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.273667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1677  peptidase M42 family protein  26.82 
 
 		 353 aa  62  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>