162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_2673 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_2673  DSBA oxidoreductase  100 
 
 		 217 aa  434  1e-121  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2816  DSBA oxidoreductase  88.02 
 
 		 217 aa  364  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.610355 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2145  DSBA oxidoreductase  42.92 
 
 		 232 aa  162  4.0000000000000004e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3104  thioredoxin domain-containing protein  38.79 
 
 		 240 aa  122  5e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1444  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  38.97 
 
 		 240 aa  121  7e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4948  DSBA oxidoreductase  35.67 
 
 		 221 aa  106  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.576797 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0796  DSBA oxidoreductase  35.22 
 
 		 221 aa  103  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.861655 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0641  DSBA oxidoreductase  33.04 
 
 		 220 aa  103  3e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.109842 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1700  DSBA oxidoreductase  32.86 
 
 		 227 aa  100  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1922  DSBA oxidoreductase  36.84 
 
 		 218 aa  99.4  4e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.65395  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2391  putative DSBA oxidoreductase  32.7 
 
 		 217 aa  99.4  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1034  DSBA oxidoreductase  32.41 
 
 		 215 aa  99  5e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1441  DSBA oxidoreductase  36.75 
 
 		 214 aa  98.6  6e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0402577 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1347  DSBA oxidoreductase  33.12 
 
 		 233 aa  98.2  8e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1732  DSBA oxidoreductase  30.32 
 
 		 223 aa  97.4  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.474005 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2369  polyketide biosynthesis associated protein  30.73 
 
 		 223 aa  97.1  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0577  frnE protein, putative  32.05 
 
 		 224 aa  96.3  3e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1502  DSBA oxidoreductase  34.34 
 
 		 214 aa  96.3  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0283596 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0543  dsba oxidoreductase  32.05 
 
 		 224 aa  96.3  3e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1916  DSBA oxidoreductase  29.41 
 
 		 223 aa  95.9  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.093015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3639  DSBA oxidoreductase  29.38 
 
 		 224 aa  95.9  4e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5468  hypothetical protein  31.8 
 
 		 221 aa  95.5  5e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2316  DSBA oxidoreductase  31.02 
 
 		 221 aa  94  1e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.132325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1937  DSBA oxidoreductase  31.74 
 
 		 222 aa  93.6  2e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2709  DSBA oxidoreductase  33.53 
 
 		 214 aa  93.6  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.111017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1398  DSBA oxidoreductase  34.19 
 
 		 221 aa  92.4  5e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.928742 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2852  polyketide biosynthesis associated protein  36.75 
 
 		 214 aa  92  6e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.456513  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1557  putative DSBA oxidoreductase  31.33 
 
 		 222 aa  92  6e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.455666  normal  0.262117 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2508  DSBA oxidoreductase  33.49 
 
 		 225 aa  91.7  9e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00396553  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5763  DSBA oxidoreductase  33.64 
 
 		 218 aa  90.9  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.47977  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1542  DSBA oxidoreductase  31.8 
 
 		 224 aa  90.9  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.208286 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1717  DSBA oxidoreductase  32.11 
 
 		 221 aa  91.3  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4177  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase family protein  31.08 
 
 		 215 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.743231  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2493  dithiol-disulfide isomerase  29.15 
 
 		 242 aa  90.5  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.138653 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3082  DSBA oxidoreductase  31.71 
 
 		 216 aa  90.1  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.275459  normal  0.192023 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5500  DSBA oxidoreductase  35.71 
 
 		 217 aa  89  5e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.790496  normal  0.0537626 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4389  DSBA oxidoreductase  30 
 
 		 221 aa  89  5e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0887682  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0746  DSBA oxidoreductase  27.93 
 
 		 215 aa  87.8  1e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0622  DSBA oxidoreductase  30.12 
 
 		 217 aa  87  2e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2969  DSBA oxidoreductase  27.73 
 
 		 231 aa  87  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0234378  hitchhiker  0.0000221384 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2718  DSBA oxidoreductase  28.44 
 
 		 209 aa  86.7  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0752849  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01056  probable DSBA oxidoreductase  31.33 
 
 		 211 aa  86.3  3e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01681  hypothetical protein  34.3 
 
 		 222 aa  85.9  4e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.793044 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3756  DSBA oxidoreductase  32.29 
 
 		 221 aa  85.9  5e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.734213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1583  DSBA oxidoreductase  35.4 
 
 		 210 aa  85.5  6e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3914  DSBA oxidoreductase  30.18 
 
 		 215 aa  85.5  6e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.216529 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1174  DSBA oxidoreductase  30.19 
 
 		 239 aa  85.1  6e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.196548 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5014  FrnE protein  26.94 
 
 		 243 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0127936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1488  DSBA oxidoreductase  29.91 
 
 		 234 aa  84.3  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0767657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0515  DSBA oxidoreductase  29.02 
 
 		 221 aa  83.2  0.000000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.727593  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0246  protein disulfide isomerase (S-S rearrangase)  26.94 
 
 		 243 aa  82  0.000000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0249  protein disulfide isomerase (S-S rearrangase)  26.94 
 
 		 243 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0768855  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2296  DSBA oxidoreductase  32.44 
 
 		 221 aa  81.3  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00720993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1261  DSBA oxidoreductase  32.03 
 
 		 235 aa  81.3  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.432726  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7204  DSBA oxidoreductase  30 
 
 		 221 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3389  DSBA oxidoreductase  27.85 
 
 		 235 aa  80.5  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.354876  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0967  DSBA oxidoreductase  35.71 
 
 		 220 aa  80.5  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.431519  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3598  DSBA oxidoreductase  31.76 
 
 		 220 aa  80.5  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.432657 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3961  DSBA oxidoreductase  36.18 
 
 		 222 aa  79.7  0.00000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0301  protein disulfide isomerase  26.94 
 
 		 243 aa  79.7  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0308  FrnE protein  26.48 
 
 		 243 aa  79.3  0.00000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00686429  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12093  hypothetical protein  25.56 
 
 		 214 aa  79.3  0.00000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0329  protein disulfide isomerase  26.48 
 
 		 243 aa  79  0.00000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00387004  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2832  DSBA oxidoreductase  23.81 
 
 		 213 aa  79  0.00000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.84064  normal  0.0678708 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2061  DSBA oxidoreductase  34.59 
 
 		 215 aa  79  0.00000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.16033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3441  DSBA oxidoreductase  30.45 
 
 		 215 aa  79  0.00000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.486771  normal  0.667437 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2795  DSBA oxidoreductase  31.71 
 
 		 207 aa  79  0.00000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0115  DSBA oxidoreductase  33.72 
 
 		 232 aa  78.6  0.00000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.133072  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0704  DSBA oxidoreductase  27.19 
 
 		 235 aa  78.2  0.00000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3987  DSBA oxidoreductase  36.99 
 
 		 228 aa  78.2  0.00000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1917  DSBA oxidoreductase  31.29 
 
 		 217 aa  77.8  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2107  DSBA oxidoreductase  29.21 
 
 		 226 aa  76.6  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2720  thiol:disulfide interchange protein DsbA  26.7 
 
 		 219 aa  77.4  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.162153 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0258  DSBA oxidoreductase  25.94 
 
 		 208 aa  75.9  0.0000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.494343  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0252  DSBA oxidoreductase  26.03 
 
 		 243 aa  75.5  0.0000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4436  DSBA oxidoreductase  28.25 
 
 		 239 aa  75.1  0.0000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.106658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0567  DSBA oxidoreductase  26.15 
 
 		 244 aa  74.3  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0301  DSBA oxidoreductase  28.82 
 
 		 214 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.220851  normal  0.256868 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0416  putative dithiol-disulfide isomerase  27.73 
 
 		 221 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22550  predicted dithiol-disulfide isomerase involved in polyketide biosynthesis  37.74 
 
 		 227 aa  73.6  0.000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0952  DSBA oxidoreductase  27.91 
 
 		 219 aa  73.6  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.440606  normal  0.83484 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1948  DSBA oxidoreductase  31.11 
 
 		 216 aa  73.2  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3008  DSBA oxidoreductase  29.65 
 
 		 248 aa  73.2  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.533985  normal  0.21554 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2195  DSBA oxidoreductase  29.03 
 
 		 215 aa  72.8  0.000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3825  DSBA oxidoreductase  30.63 
 
 		 217 aa  72.4  0.000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0328358 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0261  DSBA oxidoreductase  30.66 
 
 		 213 aa  72  0.000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0132035 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0363  DSBA oxidoreductase  29.28 
 
 		 243 aa  71.6  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0846  DSBA oxidoreductase  29.28 
 
 		 243 aa  71.6  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.96876  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0970  DSBA oxidoreductase  25.49 
 
 		 216 aa  71.2  0.00000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00227612 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4898  DSBA oxidoreductase  26.39 
 
 		 226 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4753  DSBA oxidoreductase  27.88 
 
 		 219 aa  70.9  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.803331  normal  0.448098 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01724  polyketide synthase  31.25 
 
 		 213 aa  70.9  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3265  DSBA oxidoreductase  26.39 
 
 		 226 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.22208 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6909  DSBA oxidoreductase  26.39 
 
 		 226 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6638  DsbA oxidoreductase  27.78 
 
 		 231 aa  70.9  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0963  DSBA oxidoreductase  30.43 
 
 		 230 aa  70.5  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0391729  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3318  DSBA oxidoreductase  31.98 
 
 		 227 aa  70.1  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1083  DSBA oxidoreductase  26.24 
 
 		 216 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.979731  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0654  DSBA oxidoreductase  30.59 
 
 		 220 aa  70.5  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0818  DSBA oxidoreductase  29.73 
 
 		 243 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.115857  normal  0.905369 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>