19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_1162 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_1226  hydrolase, putative  67.61 
 
 		 826 aa  1082    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19460  Agarase  60.7 
 
 		 801 aa  963    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1147  Beta-agarase  87.33 
 
 		 755 aa  1339    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.821905  normal  0.315056 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4289  Beta-agarase  93.68 
 
 		 744 aa  1440    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1162  Beta-agarase  100 
 
 		 744 aa  1522    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1126  Beta-agarase  99.06 
 
 		 782 aa  1511    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000931505 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50830  hypothetical protein  58.5 
 
 		 757 aa  855    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00861457 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2644  GTPase EngC  30.53 
 
 		 793 aa  357  5.999999999999999e-97  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.489396  normal  0.285653 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1176  agarase  30.63 
 
 		 777 aa  335  1e-90  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000515097  unclonable  0.0000000139638 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1971  agarase  30.38 
 
 		 793 aa  334  4e-90  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0111275  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2642  agarase  29.86 
 
 		 782 aa  319  1e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2640  agarase  30.21 
 
 		 813 aa  308  3e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.503821  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2702  Beta-agarase  28.6 
 
 		 475 aa  166  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0145383  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3029  agarase  32.22 
 
 		 451 aa  157  6e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.933436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2419  agarase  30.3 
 
 		 450 aa  155  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.720611  normal  0.0278267 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4624  agarase  26.6 
 
 		 456 aa  130  7.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3553  hypothetical protein  28.57 
 
 		 658 aa  123  9.999999999999999e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2081  hypothetical protein  24.84 
 
 		 471 aa  104  6e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.40014  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3892  Beta-galactosidase  30.3 
 
 		 669 aa  45.8  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.113241  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>