18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_19460 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_1226  hydrolase, putative  61.92 
 
 		 826 aa  970    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19460  Agarase  100 
 
 		 801 aa  1634    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1147  Beta-agarase  59.83 
 
 		 755 aa  965    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.821905  normal  0.315056 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4289  Beta-agarase  60.47 
 
 		 744 aa  960    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1162  Beta-agarase  60.7 
 
 		 744 aa  962    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50830  hypothetical protein  55.39 
 
 		 757 aa  836    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00861457 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1126  Beta-agarase  60.7 
 
 		 782 aa  962    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000931505 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1971  agarase  29.46 
 
 		 793 aa  352  2e-95  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0111275  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1176  agarase  31.76 
 
 		 777 aa  349  1e-94  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000515097  unclonable  0.0000000139638 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2644  GTPase EngC  29.57 
 
 		 793 aa  336  7.999999999999999e-91  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.489396  normal  0.285653 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2640  agarase  29.24 
 
 		 813 aa  320  9e-86  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.503821  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2642  agarase  29.47 
 
 		 782 aa  318  3e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2702  Beta-agarase  32.09 
 
 		 475 aa  158  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0145383  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3029  agarase  31.23 
 
 		 451 aa  150  7e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.933436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2419  agarase  32.17 
 
 		 450 aa  148  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.720611  normal  0.0278267 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4624  agarase  27.86 
 
 		 456 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3553  hypothetical protein  30.22 
 
 		 658 aa  131  5.0000000000000004e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2081  hypothetical protein  24.86 
 
 		 471 aa  94  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.40014  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>