109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_4791 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_4791  ISPsy5, transposase  100 
 
 		 51 aa  108  3e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0522  transposase IS66  100 
 
 		 506 aa  101  4e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.117674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1719  transposase IS66  100 
 
 		 506 aa  101  4e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.702381  hitchhiker  0.0000463056 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4792  transposase IS66  100 
 
 		 506 aa  101  4e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0637  ISPpu15, transposase Orf2  95.65 
 
 		 510 aa  98.6  3e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4025  ISPpu15, transposase Orf2  95.65 
 
 		 510 aa  98.6  3e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.358489 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4091  ISPpu15, transposase Orf2  95.65 
 
 		 510 aa  98.6  3e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0162386 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4745  ISPpu15, transposase Orf2  95.65 
 
 		 510 aa  98.6  3e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.551625  hitchhiker  0.00865323 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0035  ISPsy5, transposase  95.65 
 
 		 517 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.701861  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0039  ISPsy5, transposase  95.65 
 
 		 517 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0196  ISPsy5, transposase  95.65 
 
 		 517 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.904246  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0670  ISPsy5, transposase  95.65 
 
 		 517 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1020  ISPsy5, transposase  95.65 
 
 		 517 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1098  ISPsy5, transposase  95.65 
 
 		 517 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1189  ISPsy5, transposase  95.65 
 
 		 517 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.633516  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1227  ISPsy5, transposase  95.65 
 
 		 517 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2437  ISPsy5, transposase  95.65 
 
 		 517 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.713289  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2460  ISPsy5, transposase  95.65 
 
 		 517 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.333191  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2840  ISPsy5, transposase  95.65 
 
 		 517 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0352443  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2971  ISPsy5, transposase  95.65 
 
 		 517 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3213  ISPsy5, transposase  95.65 
 
 		 517 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.256774  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3216  ISPsy5, transposase  95.65 
 
 		 517 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.727249  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3613  ISPsy5, transposase  95.65 
 
 		 517 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.935909  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3651  ISPsy5, transposase  95.65 
 
 		 517 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.151984  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3996  ISPsy5, transposase  95.65 
 
 		 517 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0222693  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3999  ISPsy5, transposase  95.65 
 
 		 517 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00912569  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4251  ISPsy5, transposase  95.65 
 
 		 517 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4389  ISPsy5, transposase  95.65 
 
 		 517 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4567  ISPsy5, transposase  95.65 
 
 		 517 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4693  ISPsy5, transposase  95.65 
 
 		 517 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4737  ISPsy5, transposase  95.65 
 
 		 517 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.39192  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4764  ISPsy5, transposase  95.65 
 
 		 517 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4994  ISPsy5, transposase  95.65 
 
 		 517 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5212  ISPsy5, transposase  95.65 
 
 		 517 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5215  ISPsy5, transposase  95.65 
 
 		 517 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5304  ISPsy5, transposase  95.65 
 
 		 517 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5368  ISPsy5, transposase  95.65 
 
 		 517 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.403464  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5411  ISPsy5, transposase  95.65 
 
 		 517 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5443  ISPsy5, transposase  95.65 
 
 		 517 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5445  ISPsy5, transposase  95.65 
 
 		 517 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5543  ISPsy5, transposase  95.65 
 
 		 517 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5591  ISPsy5, transposase  95.65 
 
 		 517 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0036  transposase IS66  83.33 
 
 		 524 aa  80.1  0.000000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0160  transposase IS66  83.33 
 
 		 522 aa  80.1  0.000000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.328115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0431  transposase IS66  83.33 
 
 		 520 aa  80.1  0.000000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0434  transposase IS66  83.33 
 
 		 520 aa  80.1  0.000000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.543739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1050  transposase IS66  83.33 
 
 		 520 aa  80.1  0.000000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.103704 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1163  transposase IS66  83.33 
 
 		 520 aa  80.1  0.000000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.230902  normal  0.467895 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1548  transposase IS66  83.33 
 
 		 520 aa  80.1  0.000000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.446339 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1988  transposase IS66  83.33 
 
 		 520 aa  80.1  0.000000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.317222 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3084  transposase IS66  83.33 
 
 		 520 aa  80.1  0.000000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.280234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3638  transposase IS66  83.33 
 
 		 520 aa  80.1  0.000000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4114  transposase IS66  83.33 
 
 		 520 aa  80.1  0.000000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3114  ISPpu13, transposase Orf2  79.55 
 
 		 510 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.90064  normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3985  ISPpu13, transposase Orf2  79.55 
 
 		 510 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.757297  hitchhiker  0.00792894 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3220  ISPsy5, transposase  79.55 
 
 		 503 aa  78.2  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.221861  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1270  ISPsy5, transposase  74.36 
 
 		 68 aa  63.5  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.187104  normal  0.0424234 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1616  transposase IS66  67.44 
 
 		 581 aa  60.8  0.000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.772385  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1003  transposase IS66  67.44 
 
 		 581 aa  60.8  0.000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2620  transposase IS66  48.78 
 
 		 515 aa  53.5  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0332564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2650  transposase IS66  48.78 
 
 		 515 aa  53.5  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.956476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6379  transposase IS66  54.76 
 
 		 531 aa  51.6  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.220092  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0642  transposase IS66  50 
 
 		 516 aa  50.4  0.000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.153379  normal  0.0230063 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0929  transposase IS66  50 
 
 		 516 aa  50.4  0.000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0524356  normal  0.567979 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6577  transposase IS66  50 
 
 		 518 aa  49.7  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.154417  normal  0.0136754 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0657  transposase IS66  52.5 
 
 		 62 aa  48.9  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.109964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1412  transposase IS66  57.89 
 
 		 531 aa  49.3  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3092  transposase IS66  57.89 
 
 		 531 aa  49.3  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0318  transposase IS66  52.5 
 
 		 156 aa  48.5  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000306018  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0321  transposase IS66  53.85 
 
 		 526 aa  48.1  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000571248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0474  transposase IS66  53.85 
 
 		 526 aa  48.1  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.215591  normal  0.330634 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0656  transposase IS66  53.85 
 
 		 526 aa  48.1  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.762551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0662  transposase IS66  53.85 
 
 		 526 aa  48.1  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0971394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0677  transposase IS66  53.85 
 
 		 526 aa  48.1  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00607766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1790  transposase IS66  53.85 
 
 		 526 aa  48.1  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0368561  normal  0.562655 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1976  transposase IS66  53.85 
 
 		 526 aa  48.1  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.212724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1982  transposase IS66  52.5 
 
 		 302 aa  48.9  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.583264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1984  transposase IS66  53.85 
 
 		 526 aa  48.5  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.547689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2184  transposase IS66  53.85 
 
 		 526 aa  48.5  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000882375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2190  transposase IS66  53.85 
 
 		 526 aa  48.1  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000183407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3292  transposase IS66  53.85 
 
 		 526 aa  48.1  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.118311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6840  transposase IS66  52.38 
 
 		 518 aa  47.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4919  transposase IS66  53.85 
 
 		 526 aa  47.4  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.73176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0383  integron integrase  56.41 
 
 		 694 aa  47  0.00008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.241301 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2596  transposase IS66  51.28 
 
 		 381 aa  47  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0682749  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2630  transposase IS66  51.28 
 
 		 526 aa  46.6  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00176311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2663  transposase IS66  51.28 
 
 		 526 aa  46.6  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1536  transposase IS66  56.41 
 
 		 530 aa  46.2  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.881033  normal  0.856435 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1783  transposase IS66  56.41 
 
 		 530 aa  46.2  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6183  transposase IS66  48.72 
 
 		 532 aa  44.7  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7339  hypothetical protein  52.63 
 
 		 93 aa  44.3  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.387256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2521  transposase IS66  50 
 
 		 536 aa  43.9  0.0007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.538642  normal  0.424177 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4534  transposase IS66  50 
 
 		 532 aa  43.9  0.0008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4016  ISPpu14, transposase Orf3  42.55 
 
 		 122 aa  43.1  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0068  putative transposase, truncation  55 
 
 		 68 aa  42.4  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4903  transposase IS66  48.78 
 
 		 529 aa  41.6  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.683483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3306  hypothetical protein  41.86 
 
 		 143 aa  41.6  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.657369 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3310  hypothetical protein  42.11 
 
 		 109 aa  41.2  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.435551 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1170  transposase IS66  43.18 
 
 		 509 aa  40.4  0.009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.934596  normal  0.320109 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1485  transposase IS66  43.18 
 
 		 509 aa  40.4  0.009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000322511 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>