More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_C6183 on replicon NC_007336
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007336  Reut_C6183  transposase IS66  100 
 
 
532 aa  1100    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6379  transposase IS66  78.24 
 
 
531 aa  852    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.220092  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1412  transposase IS66  62.52 
 
 
531 aa  649    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4919  transposase IS66  60.73 
 
 
526 aa  635    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.73176  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3092  transposase IS66  62.52 
 
 
531 aa  649    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2521  transposase IS66  61.61 
 
 
536 aa  645    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.538642  normal  0.424177 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6840  transposase IS66  72.41 
 
 
518 aa  771    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6577  transposase IS66  73.87 
 
 
518 aa  798    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.154417  normal  0.0136754 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4534  transposase IS66  62.6 
 
 
532 aa  645    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0321  transposase IS66  46.89 
 
 
526 aa  424  1e-117  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000571248  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0474  transposase IS66  46.89 
 
 
526 aa  424  1e-117  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.215591  normal  0.330634 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0656  transposase IS66  46.89 
 
 
526 aa  424  1e-117  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.762551  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0662  transposase IS66  46.89 
 
 
526 aa  424  1e-117  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0971394  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0677  transposase IS66  46.89 
 
 
526 aa  424  1e-117  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00607766  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1790  transposase IS66  46.89 
 
 
526 aa  424  1e-117  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0368561  normal  0.562655 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1976  transposase IS66  46.89 
 
 
526 aa  424  1e-117  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.212724  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1984  transposase IS66  46.89 
 
 
526 aa  425  1e-117  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.547689  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2184  transposase IS66  46.89 
 
 
526 aa  425  1e-117  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000882375  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2190  transposase IS66  46.89 
 
 
526 aa  424  1e-117  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000183407  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3292  transposase IS66  46.89 
 
 
526 aa  424  1e-117  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.118311  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2630  transposase IS66  46.7 
 
 
526 aa  422  1e-116  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00176311  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2663  transposase IS66  46.7 
 
 
526 aa  422  1e-116  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2620  transposase IS66  45.88 
 
 
515 aa  414  1e-114  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0332564  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2650  transposase IS66  45.88 
 
 
515 aa  414  1e-114  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.956476  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1616  transposase IS66  45.74 
 
 
581 aa  395  1e-108  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.772385  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1003  transposase IS66  45.74 
 
 
581 aa  395  1e-108  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0383  integron integrase  40.61 
 
 
694 aa  378  1e-103  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.241301 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2632  transposase IS66  46.57 
 
 
488 aa  377  1e-103  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0406553  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1783  transposase IS66  41.24 
 
 
530 aa  372  1e-102  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1536  transposase IS66  40.67 
 
 
530 aa  372  1e-101  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.881033  normal  0.856435 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0610  transposase IS66  39.8 
 
 
514 aa  348  1e-94  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0638  transposase IS66  39.6 
 
 
514 aa  347  2e-94  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3114  ISPpu13, transposase Orf2  40.12 
 
 
510 aa  342  1e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.90064  normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3985  ISPpu13, transposase Orf2  40.12 
 
 
510 aa  342  1e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.757297  hitchhiker  0.00792894 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2596  transposase IS66  49.59 
 
 
381 aa  335  2e-90  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0682749  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0434  transposase IS66  42.47 
 
 
520 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.543739  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0431  transposase IS66  42.47 
 
 
520 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3220  ISPsy5, transposase  40.62 
 
 
503 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.221861  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4114  transposase IS66  42.47 
 
 
520 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3638  transposase IS66  42.47 
 
 
520 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1548  transposase IS66  42.47 
 
 
520 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.446339 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3084  transposase IS66  42.47 
 
 
520 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.280234  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1988  transposase IS66  42.47 
 
 
520 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.317222 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1050  transposase IS66  42.47 
 
 
520 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.103704 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1163  transposase IS66  42.47 
 
 
520 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.230902  normal  0.467895 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0160  transposase IS66  44.66 
 
 
522 aa  327  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.328115  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0036  transposase IS66  44.66 
 
 
524 aa  327  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0035  ISPsy5, transposase  39.26 
 
 
517 aa  326  5e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.701861  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0039  ISPsy5, transposase  39.26 
 
 
517 aa  326  5e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0196  ISPsy5, transposase  39.26 
 
 
517 aa  326  5e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.904246  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0670  ISPsy5, transposase  39.26 
 
 
517 aa  326  5e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1020  ISPsy5, transposase  39.26 
 
 
517 aa  326  5e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1098  ISPsy5, transposase  39.26 
 
 
517 aa  326  5e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1189  ISPsy5, transposase  39.26 
 
 
517 aa  326  5e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.633516  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1227  ISPsy5, transposase  39.26 
 
 
517 aa  326  5e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2437  ISPsy5, transposase  39.26 
 
 
517 aa  326  5e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.713289  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2460  ISPsy5, transposase  39.26 
 
 
517 aa  326  5e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.333191  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2840  ISPsy5, transposase  39.26 
 
 
517 aa  326  5e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0352443  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2971  ISPsy5, transposase  39.26 
 
 
517 aa  326  5e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3213  ISPsy5, transposase  39.26 
 
 
517 aa  326  5e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.256774  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3216  ISPsy5, transposase  39.26 
 
 
517 aa  326  5e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.727249  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3613  ISPsy5, transposase  39.26 
 
 
517 aa  326  5e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.935909  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3651  ISPsy5, transposase  39.26 
 
 
517 aa  326  5e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.151984  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3996  ISPsy5, transposase  39.26 
 
 
517 aa  326  5e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0222693  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3999  ISPsy5, transposase  39.26 
 
 
517 aa  326  5e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00912569  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4251  ISPsy5, transposase  39.26 
 
 
517 aa  326  5e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4389  ISPsy5, transposase  39.26 
 
 
517 aa  326  5e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4567  ISPsy5, transposase  39.26 
 
 
517 aa  326  5e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4693  ISPsy5, transposase  39.26 
 
 
517 aa  326  5e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4737  ISPsy5, transposase  39.26 
 
 
517 aa  326  5e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.39192  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4764  ISPsy5, transposase  39.26 
 
 
517 aa  326  5e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4994  ISPsy5, transposase  39.26 
 
 
517 aa  326  5e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5212  ISPsy5, transposase  39.26 
 
 
517 aa  326  5e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5215  ISPsy5, transposase  39.26 
 
 
517 aa  326  5e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5304  ISPsy5, transposase  39.26 
 
 
517 aa  326  5e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5368  ISPsy5, transposase  39.26 
 
 
517 aa  326  5e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.403464  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5411  ISPsy5, transposase  39.26 
 
 
517 aa  326  5e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5443  ISPsy5, transposase  39.26 
 
 
517 aa  326  5e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5445  ISPsy5, transposase  39.26 
 
 
517 aa  326  5e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5543  ISPsy5, transposase  39.26 
 
 
517 aa  326  5e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5591  ISPsy5, transposase  39.26 
 
 
517 aa  326  5e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0637  ISPpu15, transposase Orf2  39.51 
 
 
510 aa  325  1e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4025  ISPpu15, transposase Orf2  39.51 
 
 
510 aa  325  1e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.358489 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4091  ISPpu15, transposase Orf2  39.51 
 
 
510 aa  325  1e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0162386 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4745  ISPpu15, transposase Orf2  39.51 
 
 
510 aa  325  1e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.551625  hitchhiker  0.00865323 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4792  transposase IS66  38.43 
 
 
506 aa  325  2e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0522  transposase IS66  38.43 
 
 
506 aa  325  2e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.117674  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1719  transposase IS66  38.43 
 
 
506 aa  325  2e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.702381  hitchhiker  0.0000463056 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0704  transposase IS66  38.79 
 
 
523 aa  318  1e-85  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0762527  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0642  transposase IS66  37.04 
 
 
516 aa  314  2.9999999999999996e-84  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.153379  normal  0.0230063 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0929  transposase IS66  37.04 
 
 
516 aa  314  2.9999999999999996e-84  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0524356  normal  0.567979 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2203  transposase  38.09 
 
 
530 aa  314  2.9999999999999996e-84  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2211  transposase  38.09 
 
 
530 aa  314  2.9999999999999996e-84  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0201  transposase IS66  38.38 
 
 
523 aa  313  3.9999999999999997e-84  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.228467  n/a   
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3056  transposase IS66  37.3 
 
 
529 aa  311  1e-83  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2281  transposase  37.47 
 
 
527 aa  307  3e-82  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2336  transposase IS66  40.15 
 
 
397 aa  288  2e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6337  transposase IS66  37.45 
 
 
544 aa  283  5.000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0065  putative transposase  37.3 
 
 
526 aa  282  9e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0077  putative ISPpu13, transposase Orf2  37.3 
 
 
526 aa  282  9e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.247033 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>