More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_0413 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_0413  hypothetical protein  100 
 
 		 184 aa  374  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.990255  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0385  hypothetical protein  93.44 
 
 		 184 aa  346  1e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.341198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0409  hypothetical protein  93.44 
 
 		 184 aa  346  1e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.745808  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4818  hypothetical protein  84.21 
 
 		 174 aa  296  1e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4533  serine acetyltransferase  38 
 
 		 158 aa  106  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.191412 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0871  hypothetical protein  35.43 
 
 		 181 aa  99.4  3e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2668  putative serine acetlyltransferase of prophage CP-933T  35.1 
 
 		 158 aa  92.8  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000635598 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2375  serine acetyltransferase  37.59 
 
 		 188 aa  69.3  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0443  transferase hexapeptide domain-containing protein  29.31 
 
 		 184 aa  67.8  0.00000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1779  transferase hexapeptide repeat containing protein  31.34 
 
 		 175 aa  67.4  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.868171  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0561  transferase hexapeptide repeat containing protein  34.75 
 
 		 204 aa  65.1  0.0000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.740999  normal  0.731809 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1960  hexapeptide transferase family protein  30.77 
 
 		 195 aa  64.3  0.0000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4046  transferase hexapeptide repeat containing protein  30.06 
 
 		 182 aa  64.3  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.935376 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_87889  serine acetyl transferase  35.24 
 
 		 374 aa  61.6  0.000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6429  hexapaptide repeat-containing transferase  30.63 
 
 		 191 aa  61.2  0.000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0556952  normal  0.216575 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2468  transferase hexapeptide repeat containing protein  26.88 
 
 		 175 aa  60.5  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3892  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.43 
 
 		 192 aa  59.7  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.597349  normal  0.536069 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0294  Serine acetyltransferase-like protein  32.11 
 
 		 184 aa  59.7  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.394736  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1008  serine O-acetyltransferase  33.33 
 
 		 181 aa  58.2  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.779259 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0465  Serine O-acetyltransferase  36.08 
 
 		 221 aa  57  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000169601  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3060  O-acetylserine synthase  31.31 
 
 		 177 aa  57.8  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.950914  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3788  hexapaptide repeat-containing transferase  31.31 
 
 		 218 aa  57.4  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.239622 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1481  Serine O-acetyltransferase  31.45 
 
 		 203 aa  57  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1230  Serine O-acetyltransferase  36.73 
 
 		 188 aa  56.6  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1588  serine O-acetyltransferase  30.61 
 
 		 230 aa  56.2  0.0000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0397  serine O-acetyltransferase  33.59 
 
 		 223 aa  55.8  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000026222  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1779  serine O-acetyltransferase  37.5 
 
 		 245 aa  55.5  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1807  serine O-acetyltransferase  37.5 
 
 		 245 aa  55.5  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.705763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2485  serine O-acetyltransferase  34.26 
 
 		 241 aa  55.1  0.0000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000105087  normal  0.0192954 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3325  serine O-acetyltransferase  31.34 
 
 		 222 aa  55.1  0.0000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000443093  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2610  serine O-acetyltransferase  29.37 
 
 		 191 aa  54.3  0.0000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4978  serine O-acetyltransferase (serine acetyltransferase)  38.68 
 
 		 344 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.367321  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1336  serine O-acetyltransferase  31.58 
 
 		 230 aa  53.9  0.000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0260631  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2377  transferase hexapeptide repeat containing protein  32.35 
 
 		 188 aa  53.5  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3570  Serine acetyltransferase-like protein  30.61 
 
 		 208 aa  54.3  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.220057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1006  serine O-acetyltransferase  35.87 
 
 		 173 aa  54.3  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.53556 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0243  Serine O-acetyltransferase  28.93 
 
 		 277 aa  53.1  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4091  satase isoform II  29.45 
 
 		 178 aa  53.5  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.251956 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3842  serine O-acetyltransferase  37.78 
 
 		 215 aa  53.1  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.102983 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3971  Serine O-acetyltransferase  31.71 
 
 		 290 aa  53.5  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2447  serine O-acetyltransferase  31.78 
 
 		 194 aa  53.1  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.506444  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4975  Serine O-acetyltransferase  30.89 
 
 		 290 aa  53.1  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.593297  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0263  serine O-acetyltransferase  32.63 
 
 		 217 aa  52.4  0.000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00204629  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0265  serine O-acetyltransferase  31.58 
 
 		 220 aa  52.8  0.000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0154579  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1335  serine O-acetyltransferase  30.4 
 
 		 205 aa  52.4  0.000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1064  Serine acetyltransferase-like protein  37.72 
 
 		 221 aa  52.4  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0476544  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0438  Serine O-acetyltransferase  30.88 
 
 		 284 aa  52  0.000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.150955 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1165  serine O-acetyltransferase  31.51 
 
 		 253 aa  52  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.701268  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1135  serine O-acetyltransferase  31.51 
 
 		 253 aa  52  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2356  Serine O-acetyltransferase  32.71 
 
 		 240 aa  52  0.000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2405  putative serine acetyltransferase  32.33 
 
 		 263 aa  51.6  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1824  serine O-acetyltransferase  29.36 
 
 		 172 aa  52  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.336838  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1110  serine O-acetyltransferase  31.21 
 
 		 225 aa  52  0.000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0265752  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24440  serine O-acetyltransferase  27.39 
 
 		 194 aa  51.6  0.000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.54097 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2427  Serine O-acetyltransferase  26.23 
 
 		 312 aa  51.6  0.000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.448467 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1067  serine O-acetyltransferase  30.47 
 
 		 274 aa  51.2  0.000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.1773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1528  serine O-acetyltransferase  35.19 
 
 		 169 aa  51.2  0.000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000000191347  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1472  serine O-acetyltransferase  31.58 
 
 		 230 aa  51.2  0.000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000445007  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1841  transferase hexapeptide repeat containing protein  28.16 
 
 		 173 aa  51.2  0.000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.520289  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0397  serine O-acetyltransferase  32.17 
 
 		 242 aa  51.2  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0440506  normal  0.605287 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00201  serine acetyltransferase  30.94 
 
 		 268 aa  51.2  0.000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.956846  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3942  serine O-acetyltransferase  31.86 
 
 		 238 aa  51.2  0.000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.426146 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1260  serine O-acetyltransferase  35.42 
 
 		 240 aa  50.8  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000272502  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2983  acetyltransferase  37.97 
 
 		 170 aa  50.8  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.833594  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1126  galactoside-O-acetyltransferase  37.39 
 
 		 198 aa  50.4  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.579692  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0595  putative capsular polysacharide biosynthesis transferase  33.33 
 
 		 166 aa  50.4  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5293  serine O-acetyltransferase  32.99 
 
 		 177 aa  50.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5016  Serine O-acetyltransferase  35.65 
 
 		 302 aa  50.4  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0192  serine O-acetyltransferase  31.48 
 
 		 229 aa  50.4  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0264  serine O-acetyltransferase  33.33 
 
 		 226 aa  50.4  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000282343  normal  0.0142225 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2542  serine acetyltransferase  30.16 
 
 		 274 aa  50.1  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1012  transferase hexapeptide repeat containing protein  30.28 
 
 		 174 aa  50.1  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0051386  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1862  serine O-acetyltransferase  29.69 
 
 		 228 aa  50.1  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  9.89239e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4132  serine O-acetyltransferase  32.06 
 
 		 288 aa  49.7  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0927  serine O-acetyltransferase  25.47 
 
 		 230 aa  50.1  0.00002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.549767  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2196  serine O-acetyltransferase  31.01 
 
 		 214 aa  49.7  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000019426 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0430  acetyltransferase, putative  29.36 
 
 		 175 aa  49.3  0.00003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4004  Serine O-acetyltransferase  31.3 
 
 		 312 aa  49.3  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.194675 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0883  hexapeptide repeat-containing protein acetyltransferase  31.3 
 
 		 163 aa  49.7  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00414991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0423  acetyltransferase  32.46 
 
 		 190 aa  49.3  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0284031  hitchhiker  0.00641556 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3703  hexapaptide repeat-containing transferase  32.98 
 
 		 166 aa  49.3  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3514  Serine O-acetyltransferase  31.3 
 
 		 312 aa  49.3  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1690  transferase hexapeptide repeat containing protein  27.22 
 
 		 198 aa  49.3  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0534677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0169  serine O-acetyltransferase  33.65 
 
 		 175 aa  48.9  0.00004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000824701  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0673  serine O-acetyltransferase  28.69 
 
 		 182 aa  48.9  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0541501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5017  Serine O-acetyltransferase  34.38 
 
 		 239 aa  48.9  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000123081  normal  0.163334 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2625  Serine O-acetyltransferase  31.3 
 
 		 312 aa  48.9  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1957  serine O-acetyltransferase  30.28 
 
 		 170 aa  48.9  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.344203  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1129  serine O-acetyltransferase  31.3 
 
 		 256 aa  48.9  0.00004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.101168  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09440  serine O-acetyltransferase  28.46 
 
 		 195 aa  48.9  0.00004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.33324  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002243  serine acetyltransferase  28.17 
 
 		 273 aa  48.9  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6012  putative hexapeptide transferase family protein  34.48 
 
 		 139 aa  48.5  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.493512  normal  0.386766 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3549  putative capsular polysacharide biosynthesis transferase  35.42 
 
 		 166 aa  48.5  0.00005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00933563  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1672  acetyltransferase  30.97 
 
 		 186 aa  48.9  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0187  serine O-acetyltransferase  30.91 
 
 		 238 aa  48.1  0.00006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.152635  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03117  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  34.13 
 
 		 447 aa  48.5  0.00006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3017  serine O-acetyltransferase  34.38 
 
 		 302 aa  48.1  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.177285  hitchhiker  0.00193081 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4814  serine acetyltransferase  28.17 
 
 		 273 aa  48.5  0.00006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000193485 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3167  transferase hexapeptide repeat containing protein  35.11 
 
 		 165 aa  48.1  0.00006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00125  serine acetyltransferase  27.46 
 
 		 273 aa  48.1  0.00007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>