More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_0409 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0385  hypothetical protein  100 
 
 		 184 aa  374  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.341198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0409  hypothetical protein  100 
 
 		 184 aa  374  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.745808  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0413  hypothetical protein  93.44 
 
 		 184 aa  346  1e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.990255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4818  hypothetical protein  84.48 
 
 		 174 aa  301  5.000000000000001e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4533  serine acetyltransferase  37.33 
 
 		 158 aa  102  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.191412 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0871  hypothetical protein  34.64 
 
 		 181 aa  102  3e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2668  putative serine acetlyltransferase of prophage CP-933T  35.81 
 
 		 158 aa  92.4  4e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000635598 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0443  transferase hexapeptide domain-containing protein  32.68 
 
 		 184 aa  72.4  0.000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1779  transferase hexapeptide repeat containing protein  31.34 
 
 		 175 aa  68.9  0.00000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.868171  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1960  hexapeptide transferase family protein  32.31 
 
 		 195 aa  68.6  0.00000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0561  transferase hexapeptide repeat containing protein  35 
 
 		 204 aa  67.8  0.00000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.740999  normal  0.731809 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2375  serine acetyltransferase  38.64 
 
 		 188 aa  67.8  0.00000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3892  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.13 
 
 		 192 aa  65.9  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.597349  normal  0.536069 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4046  transferase hexapeptide repeat containing protein  28.19 
 
 		 182 aa  65.9  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.935376 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3060  O-acetylserine synthase  28.78 
 
 		 177 aa  63.5  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.950914  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3788  hexapaptide repeat-containing transferase  31.68 
 
 		 218 aa  62.8  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.239622 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_87889  serine acetyl transferase  35.24 
 
 		 374 aa  62.4  0.000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1008  serine O-acetyltransferase  33.77 
 
 		 181 aa  62  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.779259 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2468  transferase hexapeptide repeat containing protein  26.88 
 
 		 175 aa  61.6  0.000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0294  Serine acetyltransferase-like protein  33.94 
 
 		 184 aa  61.6  0.000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.394736  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3325  serine O-acetyltransferase  32.84 
 
 		 222 aa  61.2  0.000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000443093  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0397  serine O-acetyltransferase  34.03 
 
 		 223 aa  60.5  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000026222  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2377  transferase hexapeptide repeat containing protein  34.56 
 
 		 188 aa  60.8  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0243  Serine O-acetyltransferase  30 
 
 		 277 aa  60.5  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0430  acetyltransferase, putative  32.43 
 
 		 175 aa  59.7  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2447  serine O-acetyltransferase  33.59 
 
 		 194 aa  59.7  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.506444  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3971  Serine O-acetyltransferase  32.59 
 
 		 290 aa  58.9  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2610  serine O-acetyltransferase  30.16 
 
 		 191 aa  58.9  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1335  serine O-acetyltransferase  32.26 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1481  Serine O-acetyltransferase  32.8 
 
 		 203 aa  58.9  0.00000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4975  Serine O-acetyltransferase  31.85 
 
 		 290 aa  58.5  0.00000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.593297  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6429  hexapaptide repeat-containing transferase  30.52 
 
 		 191 aa  57.8  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0556952  normal  0.216575 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0438  Serine O-acetyltransferase  32.12 
 
 		 284 aa  57.4  0.0000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.150955 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1807  serine O-acetyltransferase  38.54 
 
 		 245 aa  57.4  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.705763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4814  serine acetyltransferase  32.41 
 
 		 273 aa  57.4  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000193485 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1779  serine O-acetyltransferase  38.54 
 
 		 245 aa  57.4  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0465  Serine O-acetyltransferase  36.08 
 
 		 221 aa  57  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000169601  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2485  serine O-acetyltransferase  33.59 
 
 		 241 aa  57  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000105087  normal  0.0192954 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4091  satase isoform II  29.75 
 
 		 178 aa  56.6  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.251956 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1230  Serine O-acetyltransferase  36.73 
 
 		 188 aa  56.6  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1260  serine O-acetyltransferase  37.5 
 
 		 240 aa  56.2  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000272502  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5016  Serine O-acetyltransferase  35.56 
 
 		 302 aa  57  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1588  serine O-acetyltransferase  30.88 
 
 		 230 aa  55.5  0.0000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24440  serine O-acetyltransferase  28.67 
 
 		 194 aa  55.8  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.54097 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2196  serine O-acetyltransferase  32.81 
 
 		 214 aa  55.8  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000019426 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0451  putative serine O-acetyltransferase  33.62 
 
 		 329 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.419727  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0196  putative serine O-acetyltransferase  33.62 
 
 		 329 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.98649  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1411  putative serine O-acetyltransferase  33.62 
 
 		 329 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.460886  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1821  putative serine O-acetyltransferase  33.62 
 
 		 329 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0930  putative serine O-acetyltransferase  33.62 
 
 		 275 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002243  serine acetyltransferase  28.97 
 
 		 273 aa  54.7  0.0000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2356  Serine O-acetyltransferase  30.28 
 
 		 240 aa  54.7  0.0000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2161  serine O-acetyltransferase  32.03 
 
 		 269 aa  54.7  0.0000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.446756  normal  0.714268 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1006  serine O-acetyltransferase  34.02 
 
 		 173 aa  54.7  0.0000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.53556 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1297  serine acetyltransferase  28.17 
 
 		 258 aa  54.3  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.613777  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2653  Serine acetyltransferase-like protein  32.76 
 
 		 176 aa  54.3  0.0000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.223277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1908  Serine acetyltransferase  32.76 
 
 		 329 aa  54.3  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.625304  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3917  serine acetyltransferase  31.03 
 
 		 273 aa  54.3  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0673  serine O-acetyltransferase  30.25 
 
 		 182 aa  53.9  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0541501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3898  serine acetyltransferase  31.03 
 
 		 273 aa  54.3  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.205124 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3747  serine O-acetyltransferase  31.19 
 
 		 169 aa  53.9  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0365  serine acetyltransferase  32.76 
 
 		 275 aa  54.3  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.833378  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1862  serine O-acetyltransferase  30.47 
 
 		 228 aa  54.3  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  9.89239e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0263  serine O-acetyltransferase  33.68 
 
 		 217 aa  53.5  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00204629  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3842  serine O-acetyltransferase  29.41 
 
 		 215 aa  54.3  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.102983 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3979  serine acetyltransferase  31.03 
 
 		 273 aa  54.3  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.423159 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00125  serine acetyltransferase  28.28 
 
 		 273 aa  53.9  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4024  serine acetyltransferase  31.03 
 
 		 273 aa  54.3  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0264  serine O-acetyltransferase  33.06 
 
 		 226 aa  54.3  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000282343  normal  0.0142225 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0265  serine O-acetyltransferase  32.63 
 
 		 220 aa  54.3  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0154579  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4085  serine acetyltransferase  31.03 
 
 		 273 aa  54.3  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2405  putative serine acetyltransferase  31.58 
 
 		 263 aa  53.1  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2038  Serine O-acetyltransferase  29.17 
 
 		 269 aa  53.5  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.963984  normal  0.666703 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0397  serine O-acetyltransferase  32.26 
 
 		 242 aa  53.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0440506  normal  0.605287 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1165  serine O-acetyltransferase  32.19 
 
 		 253 aa  53.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.701268  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0187  serine O-acetyltransferase  35.42 
 
 		 238 aa  53.5  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.152635  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1590  Serine O-acetyltransferase  29.75 
 
 		 281 aa  53.5  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.171935  normal  0.356982 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1336  serine O-acetyltransferase  30.88 
 
 		 230 aa  53.5  0.000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0260631  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1528  serine O-acetyltransferase  36.11 
 
 		 169 aa  53.5  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000000191347  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3017  serine O-acetyltransferase  36.46 
 
 		 302 aa  53.5  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.177285  hitchhiker  0.00193081 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1135  serine O-acetyltransferase  32.19 
 
 		 253 aa  53.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0169  serine O-acetyltransferase  35.58 
 
 		 175 aa  53.5  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000824701  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23070  serine O-acetyltransferase  30.77 
 
 		 242 aa  53.1  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000574255  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2427  Serine O-acetyltransferase  26.89 
 
 		 312 aa  52.4  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.448467 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4080  serine acetyltransferase  31.03 
 
 		 273 aa  52.8  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.135074  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4361  serine acetyltransferase  31.03 
 
 		 273 aa  52.8  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0172  serine acetyltransferase  30.34 
 
 		 271 aa  52.8  0.000003  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1067  serine O-acetyltransferase  29.69 
 
 		 274 aa  52.8  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.1773  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1064  Serine acetyltransferase-like protein  39.64 
 
 		 221 aa  52.8  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0476544  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5293  serine O-acetyltransferase  34.02 
 
 		 177 aa  52.8  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0026  Serine O-acetyltransferase  33.62 
 
 		 322 aa  52.8  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.602899  normal  0.244581 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0192  serine O-acetyltransferase  31.4 
 
 		 229 aa  52.8  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1110  serine O-acetyltransferase  32.08 
 
 		 225 aa  52.4  0.000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0265752  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1568  serine O-acetyltransferase  32.03 
 
 		 277 aa  52  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0980723 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4132  serine O-acetyltransferase  33.09 
 
 		 288 aa  52.4  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14700  serine O-acetyltransferase  27.46 
 
 		 258 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.74383  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3938  serine acetyltransferase  31.29 
 
 		 273 aa  52  0.000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1648  serine O-acetyltransferase  28.24 
 
 		 272 aa  52  0.000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.500904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3570  Serine acetyltransferase-like protein  33.08 
 
 		 208 aa  52  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.220057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12359  serine acetyltransferase cysE  31.54 
 
 		 229 aa  51.6  0.000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>