More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_4818 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_4818  hypothetical protein  100 
 
 		 174 aa  357  4e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0385  hypothetical protein  84.48 
 
 		 184 aa  301  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.341198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0409  hypothetical protein  84.48 
 
 		 184 aa  301  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.745808  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0413  hypothetical protein  84.21 
 
 		 184 aa  296  9e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.990255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4533  serine acetyltransferase  38.89 
 
 		 158 aa  100  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.191412 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0871  hypothetical protein  35.98 
 
 		 181 aa  99.8  2e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2668  putative serine acetlyltransferase of prophage CP-933T  34.46 
 
 		 158 aa  87.8  8e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000635598 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3892  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 192 aa  71.6  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.597349  normal  0.536069 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3060  O-acetylserine synthase  30.28 
 
 		 177 aa  69.7  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.950914  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1960  hexapeptide transferase family protein  33.85 
 
 		 195 aa  68.9  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3788  hexapaptide repeat-containing transferase  30.28 
 
 		 218 aa  68.2  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.239622 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0465  Serine O-acetyltransferase  42.27 
 
 		 221 aa  67.8  0.00000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000169601  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1481  Serine O-acetyltransferase  34.65 
 
 		 203 aa  65.5  0.0000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0443  transferase hexapeptide domain-containing protein  30.14 
 
 		 184 aa  64.7  0.0000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0294  Serine acetyltransferase-like protein  33.03 
 
 		 184 aa  62.8  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.394736  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3325  serine O-acetyltransferase  35.56 
 
 		 222 aa  62.4  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000443093  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1165  serine O-acetyltransferase  44.9 
 
 		 253 aa  62  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.701268  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1135  serine O-acetyltransferase  44.9 
 
 		 253 aa  62  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0561  transferase hexapeptide repeat containing protein  29.7 
 
 		 204 aa  61.6  0.000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.740999  normal  0.731809 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2375  serine acetyltransferase  33.83 
 
 		 188 aa  60.8  0.000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0263  serine O-acetyltransferase  28.31 
 
 		 217 aa  60.5  0.00000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00204629  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0265  serine O-acetyltransferase  36.56 
 
 		 220 aa  60.5  0.00000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0154579  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3701  serine O-acetyltransferase  43.88 
 
 		 252 aa  59.7  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0397  serine O-acetyltransferase  36.09 
 
 		 223 aa  58.9  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000026222  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4046  transferase hexapeptide repeat containing protein  25.15 
 
 		 182 aa  58.9  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.935376 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5017  Serine O-acetyltransferase  41.84 
 
 		 239 aa  58.5  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000123081  normal  0.163334 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1779  serine O-acetyltransferase  41.84 
 
 		 245 aa  58.2  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1807  serine O-acetyltransferase  41.84 
 
 		 245 aa  58.2  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.705763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0397  serine O-acetyltransferase  42.86 
 
 		 242 aa  57.8  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0440506  normal  0.605287 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2447  serine O-acetyltransferase  32.31 
 
 		 194 aa  58.2  0.00000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.506444  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3017  serine O-acetyltransferase  41.84 
 
 		 302 aa  57.8  0.00000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.177285  hitchhiker  0.00193081 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4132  serine O-acetyltransferase  41.84 
 
 		 288 aa  57.8  0.00000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_87889  serine acetyl transferase  34.29 
 
 		 374 aa  57.8  0.00000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3971  Serine O-acetyltransferase  32.06 
 
 		 290 aa  57.4  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2485  serine O-acetyltransferase  35.38 
 
 		 241 aa  56.2  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000105087  normal  0.0192954 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4975  Serine O-acetyltransferase  31.3 
 
 		 290 aa  56.6  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.593297  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1008  serine O-acetyltransferase  32.64 
 
 		 181 aa  56.2  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.779259 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3979  serine acetyltransferase  33.08 
 
 		 273 aa  55.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.423159 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1260  serine O-acetyltransferase  38.78 
 
 		 240 aa  55.8  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000272502  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3898  serine acetyltransferase  33.08 
 
 		 273 aa  55.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.205124 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4024  serine acetyltransferase  33.08 
 
 		 273 aa  55.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1129  serine O-acetyltransferase  36.09 
 
 		 256 aa  55.8  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.101168  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3917  serine acetyltransferase  33.08 
 
 		 273 aa  55.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4085  serine acetyltransferase  33.08 
 
 		 273 aa  55.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1230  Serine O-acetyltransferase  35.71 
 
 		 188 aa  55.8  0.0000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1006  serine O-acetyltransferase  32 
 
 		 173 aa  55.8  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.53556 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1779  transferase hexapeptide repeat containing protein  26.06 
 
 		 175 aa  55.8  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.868171  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4814  serine acetyltransferase  34.09 
 
 		 273 aa  55.5  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000193485 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1568  serine O-acetyltransferase  34.11 
 
 		 277 aa  55.1  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0980723 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1668  Serine O-acetyltransferase  40.82 
 
 		 253 aa  54.7  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.310875 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0128  serine acetyltransferase  33.08 
 
 		 273 aa  55.1  0.0000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.25771  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0169  serine O-acetyltransferase  35.19 
 
 		 175 aa  54.7  0.0000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000824701  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2196  serine O-acetyltransferase  31.54 
 
 		 214 aa  54.7  0.0000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000019426 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0192  serine O-acetyltransferase  35.45 
 
 		 229 aa  54.7  0.0000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3570  Serine acetyltransferase-like protein  29.92 
 
 		 208 aa  54.7  0.0000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.220057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1862  serine O-acetyltransferase  31.25 
 
 		 228 aa  54.3  0.0000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  9.89239e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0438  Serine O-acetyltransferase  30.66 
 
 		 284 aa  54.3  0.0000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.150955 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03465  serine acetyltransferase  32.31 
 
 		 273 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0098  serine O-acetyltransferase  32.31 
 
 		 273 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3944  serine acetyltransferase  32.31 
 
 		 273 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.863552 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4035  serine acetyltransferase  32.31 
 
 		 273 aa  53.5  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4111  serine acetyltransferase  32.31 
 
 		 273 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2254  serine O-acetyltransferase  33.33 
 
 		 234 aa  53.9  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000404898  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03416  hypothetical protein  32.31 
 
 		 273 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4091  satase isoform II  28.85 
 
 		 178 aa  53.9  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.251956 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1824  serine O-acetyltransferase  30.36 
 
 		 172 aa  53.9  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.336838  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2427  Serine O-acetyltransferase  31.13 
 
 		 312 aa  53.9  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.448467 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4980  serine acetyltransferase  32.31 
 
 		 273 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3819  serine acetyltransferase  32.31 
 
 		 273 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0101  serine acetyltransferase  32.31 
 
 		 273 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1588  serine O-acetyltransferase  30.53 
 
 		 230 aa  53.5  0.000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4978  serine O-acetyltransferase (serine acetyltransferase)  37.86 
 
 		 344 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.367321  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0129  Serine O-acetyltransferase  36.94 
 
 		 247 aa  52.8  0.000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.192527  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6012  putative hexapeptide transferase family protein  39.47 
 
 		 139 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.493512  normal  0.386766 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0187  serine O-acetyltransferase  37.76 
 
 		 238 aa  52.8  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.152635  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2505  Serine O-acetyltransferase  31.9 
 
 		 263 aa  52.4  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.729249  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23070  serine O-acetyltransferase  32 
 
 		 242 aa  52.4  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000574255  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0170  serine O-acetyltransferase  33.59 
 
 		 222 aa  52.4  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000148199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0172  serine acetyltransferase  31.82 
 
 		 271 aa  52.4  0.000003  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1765  serine O-acetyltransferase  32.56 
 
 		 277 aa  52.4  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.465099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1113  serine O-acetyltransferase  33.33 
 
 		 275 aa  52.4  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.860963 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2454  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaB  35.24 
 
 		 162 aa  51.6  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0245254 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002243  serine acetyltransferase  31.54 
 
 		 273 aa  51.6  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2347  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaB  35.24 
 
 		 162 aa  51.6  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.464819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2239  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaB  35.24 
 
 		 162 aa  51.6  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2161  serine O-acetyltransferase  30.95 
 
 		 269 aa  51.6  0.000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.446756  normal  0.714268 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4361  serine acetyltransferase  31.54 
 
 		 273 aa  51.6  0.000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0264  serine O-acetyltransferase  33.09 
 
 		 226 aa  51.2  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000282343  normal  0.0142225 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2468  transferase hexapeptide repeat containing protein  26.56 
 
 		 175 aa  51.6  0.000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2340  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaB  35.24 
 
 		 146 aa  51.2  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.312233  normal  0.68727 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1375  serine O-acetyltransferase  37.76 
 
 		 225 aa  51.2  0.000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0430  acetyltransferase, putative  30.56 
 
 		 175 aa  51.2  0.000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1648  serine O-acetyltransferase  30.16 
 
 		 272 aa  51.2  0.000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.500904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2296  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaB  35.24 
 
 		 162 aa  51.2  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0186762  normal  0.151552 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2038  Serine O-acetyltransferase  29.29 
 
 		 269 aa  51.2  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.963984  normal  0.666703 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4080  serine acetyltransferase  31.82 
 
 		 273 aa  50.8  0.000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.135074  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2420  serine O-acetyltransferase  39.8 
 
 		 244 aa  50.8  0.000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0922044 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0181  serine acetyltransferase  32.58 
 
 		 273 aa  50.8  0.000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1528  serine O-acetyltransferase  29.82 
 
 		 169 aa  50.8  0.000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000000191347  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3938  serine acetyltransferase  32.58 
 
 		 273 aa  50.8  0.000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>