More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4188 on replicon NC_008757
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008757  Pnap_4188  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 
579 aa  1196    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.428838  normal  0.498692 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3621  hypothetical protein  39.03 
 
 
567 aa  362  1e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1216  hypothetical protein  36.38 
 
 
559 aa  359  9e-98  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1272  aldehyde dehydrogenase  38.53 
 
 
566 aa  359  9e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.676087  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1203  aldehyde dehydrogenase  38.53 
 
 
566 aa  357  3.9999999999999996e-97  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1143  aldehyde dehydrogenase  38.14 
 
 
566 aa  342  9e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1190  aldehyde dehydrogenase  38.39 
 
 
569 aa  337  3.9999999999999995e-91  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0443715  normal  0.761145 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3073  hypothetical protein  28.35 
 
 
575 aa  228  3e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0798426  hitchhiker  0.00432489 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3194  hypothetical protein  29.72 
 
 
574 aa  221  1.9999999999999999e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.14687 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2158  aldehyde dehydrogenase  26.52 
 
 
475 aa  72.8  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2196  aldehyde dehydrogenase  26.52 
 
 
475 aa  72.8  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1729  aldehyde dehydrogenase  25.61 
 
 
475 aa  67.4  0.0000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00132327  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1905  betaine-aldehyde dehydrogenase  27.39 
 
 
472 aa  62.8  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.343927  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1170  aldehyde dehydrogenase  24.63 
 
 
488 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.42325 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3077  aldehyde dehydrogenase  23.9 
 
 
500 aa  62  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.364593  normal  0.0549958 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5721  aldehyde dehydrogenase  26.34 
 
 
471 aa  61.6  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1708  Betaine-aldehyde dehydrogenase  27.53 
 
 
494 aa  60.8  0.00000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2494  Betaine-aldehyde dehydrogenase  26.61 
 
 
468 aa  60.5  0.00000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000289704  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3706  aldehyde dehydrogenase  28.99 
 
 
473 aa  60.5  0.00000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0675814  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5673  aldehyde dehydrogenase  27.14 
 
 
476 aa  60.1  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4389  aldehyde dehydrogenase  25.43 
 
 
482 aa  59.7  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0272  aldehyde dehydrogenase  25.13 
 
 
517 aa  59.3  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1049  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  26.56 
 
 
495 aa  59.3  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.451266 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0240  betaine-aldehyde dehydrogenase  26.39 
 
 
491 aa  58.9  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.183603 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2132  Aldehyde Dehydrogenase  26.29 
 
 
488 aa  58.2  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7193  Aldehyde Dehydrogenase  29.51 
 
 
473 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3634  aldehyde dehydrogenase  26.05 
 
 
480 aa  58.2  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3226  aldehyde dehydrogenase  25.15 
 
 
493 aa  57.4  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3176  aldehyde dehydrogenase  24.58 
 
 
490 aa  57.4  0.0000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000139941  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2577  aldehyde dehydrogenase  24.43 
 
 
477 aa  57  0.0000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.121962  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1827  Betaine-aldehyde dehydrogenase  26.71 
 
 
477 aa  57  0.0000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0226189  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2785  aldehyde dehydrogenase  27.44 
 
 
487 aa  56.2  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0279  betaine-aldehyde dehydrogenase  24.15 
 
 
484 aa  57  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0265  aldehyde dehydrogenase  25.55 
 
 
512 aa  57  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00113994 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3584  Aldehyde Dehydrogenase  25.41 
 
 
496 aa  56.6  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5518  Aldehyde Dehydrogenase  26.99 
 
 
485 aa  57  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.34822  normal  0.179589 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5267  aldehyde dehydrogenase  24.49 
 
 
493 aa  56.2  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6088  aldehyde dehydrogenase  27.57 
 
 
487 aa  56.6  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0096  betaine aldehyde dehydrogenase  24 
 
 
491 aa  55.8  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1104  aldehyde dehydrogenase  25.87 
 
 
474 aa  55.8  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.304588  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0428  betaine-aldehyde dehydrogenase  25.09 
 
 
492 aa  56.2  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0260686  normal  0.349012 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0090  aldehyde dehydrogenase  25.82 
 
 
470 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0099  aldehyde dehydrogenase  25.82 
 
 
470 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.104942 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3819  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  25.07 
 
 
477 aa  55.5  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.540557 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4040  betaine-aldehyde dehydrogenase  24.49 
 
 
477 aa  55.5  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.71775 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4653  aldehyde dehydrogenase  26.09 
 
 
473 aa  55.1  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.516666  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3569  aldehyde dehydrogenase  25 
 
 
494 aa  54.7  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4482  aldehyde dehydrogenase  24.38 
 
 
478 aa  54.7  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.352145  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4156  aldehyde dehydrogenase  26.07 
 
 
504 aa  54.7  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.349065  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4395  aldehyde dehydrogenase  24.38 
 
 
478 aa  54.7  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.428488  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0985  Aminobutyraldehyde dehydrogenase  27.04 
 
 
463 aa  55.1  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6855  aldehyde dehydrogenase  26.69 
 
 
493 aa  54.7  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0177667  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0904  aldehyde dehydrogenase  26.94 
 
 
481 aa  54.3  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4776  aldehyde dehydrogenase  24.38 
 
 
478 aa  53.9  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5435  aldehyde dehydrogenase  27.94 
 
 
504 aa  53.9  0.000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.846738  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3731  aldehyde dehydrogenase  25.44 
 
 
493 aa  53.5  0.000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.576813  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0152  Aldehyde Dehydrogenase  25 
 
 
510 aa  53.5  0.000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2533  aldehyde dehydrogenase  25.89 
 
 
468 aa  53.1  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0742  aldehyde dehydrogenase  25.14 
 
 
468 aa  53.5  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0080  aldehyde dehydrogenase  25.54 
 
 
470 aa  53.1  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.255507 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3676  aldehyde dehydrogenase  24.77 
 
 
501 aa  53.5  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3718  aldehyde dehydrogenase  25.44 
 
 
495 aa  53.5  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.297586  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1561  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  23.85 
 
 
503 aa  53.5  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3749  aldehyde dehydrogenase  24.77 
 
 
501 aa  53.5  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.651796 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3791  aldehyde dehydrogenase  25.44 
 
 
493 aa  53.5  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0604454  normal  0.0877723 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3662  aldehyde dehydrogenase (NAD)  24.07 
 
 
494 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2601  Aminobutyraldehyde dehydrogenase  25.79 
 
 
486 aa  52.8  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4268  Aldehyde Dehydrogenase  24.71 
 
 
462 aa  52.8  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2580  Aldehyde Dehydrogenase  27.05 
 
 
492 aa  52.4  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000196464  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1605  aldehyde dehydrogenase  25.5 
 
 
471 aa  52.8  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.778378  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3257  aldehyde dehydrogenase  23.01 
 
 
494 aa  52.8  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.536879  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0105  aldehyde dehydrogenase  26.08 
 
 
470 aa  52  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.314956 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3689  aldehyde dehydrogenase  24.46 
 
 
501 aa  52  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5442  aldehyde dehydrogenase  24.6 
 
 
486 aa  52  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0274338  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0958  Betaine-aldehyde dehydrogenase  23.3 
 
 
498 aa  52  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.448446  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3194  betaine-aldehyde dehydrogenase  27.07 
 
 
453 aa  52  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0559  aldehyde dehydrogenase  27.34 
 
 
473 aa  51.6  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.088227  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1655  aldehyde dehydrogenase (NAD)  23.46 
 
 
494 aa  51.6  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0330388 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3858  aldehyde dehydrogenase  26.48 
 
 
473 aa  51.2  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.683234  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1897  betaine aldehyde dehydrogenase  24.82 
 
 
481 aa  51.6  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.332328 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3788  aldehyde dehydrogenase  24.62 
 
 
510 aa  51.2  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3432  Aldehyde Dehydrogenase  27.44 
 
 
474 aa  51.2  0.00005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5745  aldehyde dehydrogenase  26.91 
 
 
479 aa  51.2  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0583119  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2502  aldehyde dehydrogenase  26.13 
 
 
498 aa  51.2  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.673466 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2862  Aldehyde Dehydrogenase  27 
 
 
505 aa  51.2  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0352  aldehyde dehydrogenase  25.27 
 
 
499 aa  51.2  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.585255 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3193  aldehyde dehydrogenase  25.32 
 
 
476 aa  50.8  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.752955 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7406  aldehyde dehydrogenase  25.26 
 
 
492 aa  50.8  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.204479  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0886  Aldehyde Dehydrogenase  25.24 
 
 
473 aa  51.2  0.00006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3348  aldehyde dehydrogenase  23.17 
 
 
494 aa  50.8  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0219223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3313  aldehyde dehydrogenase  23.17 
 
 
494 aa  50.8  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3263  aldehyde dehydrogenase  23.17 
 
 
494 aa  50.8  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1044  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  22.16 
 
 
474 aa  50.8  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.973178  normal  0.50904 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3609  aldehyde dehydrogenase  23.17 
 
 
494 aa  50.8  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3562  aldehyde dehydrogenase (NAD)  23.17 
 
 
494 aa  50.8  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00134581 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4723  Aldehyde Dehydrogenase  23.46 
 
 
477 aa  50.8  0.00007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0425775 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6066  aldehyde dehydrogenase  23.39 
 
 
489 aa  50.8  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1492  aldehyde dehydrogenase  24.44 
 
 
492 aa  50.4  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00734873 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6363  betaine-aldehyde dehydrogenase  23.08 
 
 
489 aa  50.4  0.00009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.234314  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0877  aldehyde dehydrogenase family protein  27.57 
 
 
479 aa  50.1  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.928456  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>