17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3073 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3194  hypothetical protein  80.7 
 
 		 574 aa  911    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.14687 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3073  hypothetical protein  100 
 
 		 575 aa  1159    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0798426  hitchhiker  0.00432489 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1216  hypothetical protein  35.28 
 
 		 559 aa  311  1e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1190  aldehyde dehydrogenase  34.93 
 
 		 569 aa  298  2e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0443715  normal  0.761145 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1203  aldehyde dehydrogenase  34.17 
 
 		 566 aa  283  5.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1272  aldehyde dehydrogenase  33.99 
 
 		 566 aa  281  2e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.676087  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1143  aldehyde dehydrogenase  34.07 
 
 		 566 aa  271  2.9999999999999997e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4188  aldehyde dehydrogenase  28.35 
 
 		 579 aa  228  3e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.428838  normal  0.498692 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3621  hypothetical protein  29.84 
 
 		 567 aa  223  8e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3314  aldehyde dehydrogenase  26.2 
 
 		 496 aa  48.1  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1220  delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase  26.8 
 
 		 548 aa  47.4  0.0007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1170  aldehyde dehydrogenase  24.17 
 
 		 488 aa  46.2  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42325 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1561  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  28.72 
 
 		 487 aa  45.8  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2920  succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase  29.23 
 
 		 489 aa  46.2  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.215201  normal  0.372996 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6908  aldehyde dehydrogenase  29.31 
 
 		 483 aa  44.7  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.997054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3377  aldehyde dehydrogenase  40.74 
 
 		 482 aa  43.9  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0313  aldehyde dehydrogenase  30.99 
 
 		 792 aa  43.9  0.009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>