More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_1164 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_1164  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  100 
 
 
113 aa  225  2e-58  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00000155222  normal  0.138498 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0972  nitrogen regulatory protein P-II  88.5 
 
 
113 aa  210  5.999999999999999e-54  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000123389  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1342  nitrogen regulatory protein P-II  80.53 
 
 
113 aa  197  3.9999999999999996e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000000301067  unclonable  0.00000108063 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1137  nitrogen regulatory protein P-II  83.19 
 
 
113 aa  197  5e-50  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.201523 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0531  nitrogen regulatory protein P-II  65.49 
 
 
113 aa  153  9e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00497558  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0517  nitrogen regulatory protein P-II  65.49 
 
 
113 aa  153  9e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000164694  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0112  nitrogen regulatory protein P-II  57.52 
 
 
113 aa  127  5.0000000000000004e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2478  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 
112 aa  122  2e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.464409  normal  0.572942 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2477  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 
112 aa  119  9.999999999999999e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.698113  normal  0.567778 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00479  nitrogen regulatory protein P-II  50.89 
 
 
112 aa  119  9.999999999999999e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0641  nitrogen regulatory protein P-II  51.79 
 
 
112 aa  118  1.9999999999999998e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.252116  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03218  hypothetical protein  55.36 
 
 
114 aa  117  6e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3050  nitrogen regulatory protein P-II  53.1 
 
 
113 aa  117  7e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.59817  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2590  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 
112 aa  116  7.999999999999999e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1065  nitrogen regulatory protein P-II  49.11 
 
 
112 aa  116  9e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03437  hypothetical protein  51.79 
 
 
112 aa  116  9e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002766  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 
112 aa  116  9e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.370925  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0995  nitrogen regulatory protein P-II  50.89 
 
 
112 aa  115  9.999999999999999e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.882952  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2137  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 
112 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.573897  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1155  nitrogen regulatory protein P-II 1  53.57 
 
 
112 aa  115  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.717243  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3119  nitrogen regulatory protein P-II  49.11 
 
 
112 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0556  nitrogen regulatory protein P-II  51.79 
 
 
112 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1262  nitrogen regulatory protein P-II 1  53.57 
 
 
112 aa  115  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.297918  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03014  GlnB  51.79 
 
 
112 aa  115  1.9999999999999998e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000337232  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0491  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 
112 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0135  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 
121 aa  115  1.9999999999999998e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000114835  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3631  nitrogen regulatory protein P-II 1  53.57 
 
 
112 aa  115  1.9999999999999998e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1888  nitrogen regulatory protein P-II  51.79 
 
 
112 aa  114  3.9999999999999997e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002572  nitrogen regulatory protein P-II  50.89 
 
 
112 aa  114  3.9999999999999997e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000156099  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2408  nitrogen regulatory protein P-II  50.89 
 
 
112 aa  114  5e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.82113  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1499  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  51.79 
 
 
112 aa  114  5e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1130  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 
112 aa  114  6e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0371  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  50 
 
 
112 aa  114  6e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1227  nitrogen regulatory protein P-II 1  52.68 
 
 
112 aa  114  6e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3819  nitrogen regulatory protein P-II  48.21 
 
 
112 aa  113  6.9999999999999995e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3772  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 
112 aa  113  6.9999999999999995e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.762526 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0451  nitrogen regulatory protein P-II  50.89 
 
 
112 aa  113  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.164177  normal  0.269933 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3649  nitrogen regulatory protein P-II 1  52.68 
 
 
112 aa  113  8.999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1831  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 
114 aa  113  8.999999999999998e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3048  nitrogen regulatory protein P-II 1  52.68 
 
 
112 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2513  nitrogen regulatory protein P-II  50.89 
 
 
112 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00284343  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3163  nitrogen regulatory protein P-II  49.11 
 
 
112 aa  112  1.0000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.105283  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2629  nitrogen regulatory protein P-II  48.21 
 
 
112 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.594654  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1355  nitrogen regulatory protein p-II  49.11 
 
 
112 aa  112  1.0000000000000001e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2044  nitrogen regulatory protein P-II  50.89 
 
 
112 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0275  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 
112 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0053  nitrogen regulatory protein P-II  47.32 
 
 
112 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0041295  normal  0.377674 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2767  nitrogen regulatory protein P-II  51.79 
 
 
112 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0217  nitrogen regulatory protein P-II  50.89 
 
 
112 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000368327 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0523  nitrogen regulatory protein P-II  48.21 
 
 
112 aa  112  2.0000000000000002e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.278087  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1086  nitrogen regulatory protein P-II  51.79 
 
 
112 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0198  nitrogen regulatory protein P-II  50.89 
 
 
112 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.485304 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2480  nitrogen regulatory protein P-II  51.79 
 
 
112 aa  112  2.0000000000000002e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.312055  normal  0.888078 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0433  nitrogen regulatory protein P-II  48.21 
 
 
112 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0037358  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1181  nitrogen regulatory protein P-II  49.11 
 
 
112 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000688194 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3237  nitrogen regulatory protein P-II  47.32 
 
 
112 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0815  nitrogen regulatory protein P-II  48.21 
 
 
136 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0173  nitrogen regulatory protein P-II  50.89 
 
 
112 aa  111  3e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000293377  normal  0.353092 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3038  nitrogen regulatory protein P-II 1  50.89 
 
 
112 aa  111  3e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.196983  normal  0.293626 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0195  nitrogen regulatory protein P-II  50.89 
 
 
112 aa  111  3e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.863029 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3656  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 
112 aa  111  4.0000000000000004e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2861  nitrogen regulatory protein P-II  48.21 
 
 
112 aa  111  4.0000000000000004e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.715878  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0550  nitrogen regulatory protein P-II  49.11 
 
 
112 aa  111  4.0000000000000004e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0143  nitrogen regulatory protein P-II  49.11 
 
 
112 aa  111  4.0000000000000004e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0080  nitrogen regulatory protein P-II  46.43 
 
 
112 aa  111  4.0000000000000004e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.416357  normal  0.780104 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0342  nitrogen regulatory P-II transcription regulator protein  50 
 
 
112 aa  110  5e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2406  nitrogen regulatory protein P-II  45.54 
 
 
112 aa  110  5e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47790  Nitrogen regulatory protein P-II GlnK  46.43 
 
 
112 aa  110  5e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.144153  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3243  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 
112 aa  110  5e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.669306  normal  0.422234 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02445  regulatory protein P-II for glutamine synthetase  50.89 
 
 
112 aa  110  6e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1115  nitrogen regulatory protein P-II  50.89 
 
 
112 aa  110  6e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0650  nitrogen regulatory protein P-II  50.89 
 
 
112 aa  110  6e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.367034  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2918  nitrogen regulatory protein P-II 1  50.89 
 
 
112 aa  110  6e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.94675  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2706  nitrogen regulatory protein P-II 1  50.89 
 
 
112 aa  110  6e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3787  nitrogen regulatory protein P-II 1  50.89 
 
 
112 aa  110  6e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2530  nitrogen regulatory protein P-II  48.21 
 
 
112 aa  110  6e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2937  nitrogen regulatory protein P-II 1  50.89 
 
 
112 aa  110  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2706  nitrogen regulatory protein P-II 1  50.89 
 
 
112 aa  110  6e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2803  nitrogen regulatory protein P-II 1  50.89 
 
 
112 aa  110  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2915  nitrogen regulatory protein P-II 2  48.21 
 
 
112 aa  110  6e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0326538  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0269  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  50 
 
 
112 aa  110  6e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.76816  normal  0.184312 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02409  hypothetical protein  50.89 
 
 
112 aa  110  6e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0086  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  49.11 
 
 
112 aa  110  6e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0840353  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2762  nitrogen regulatory protein P-II 1  50.89 
 
 
112 aa  110  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2838  nitrogen regulatory protein P-II 1  50.89 
 
 
112 aa  110  6e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2824  nitrogen regulatory protein P-II 1  50.89 
 
 
112 aa  110  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3162  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 
112 aa  110  6e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000317831  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2720  nitrogen regulatory protein P-II 1  50.89 
 
 
112 aa  110  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2733  nitrogen regulatory protein P-II  49.11 
 
 
112 aa  110  6e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.122931 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0132  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 
112 aa  110  6e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000199717  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1124  nitrogen regulatory protein P-II 1  50.89 
 
 
112 aa  110  6e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0939  nitrogen regulatory protein P-II, putative  53.57 
 
 
112 aa  110  7.000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0564  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 
112 aa  110  7.000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000717962  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2346  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  49.11 
 
 
112 aa  110  7.000000000000001e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.235899 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3366  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 
112 aa  110  7.000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1017  nitrogen regulatory protein P-II  49.11 
 
 
113 aa  110  8.000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000487669  normal  0.288979 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3493  nitrogen regulatory protein P-II  51.89 
 
 
108 aa  110  8.000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2361  nitrogen regulatory protein P-II  51.79 
 
 
112 aa  110  8.000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2905  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 
112 aa  110  8.000000000000001e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0234  nitrogen regulatory protein P-II  50.89 
 
 
112 aa  110  9e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000834653  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>