More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1137 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1137  nitrogen regulatory protein P-II  100 
 
 
113 aa  226  7e-59  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.201523 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1342  nitrogen regulatory protein P-II  92.04 
 
 
113 aa  214  4e-55  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000000301067  unclonable  0.00000108063 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0972  nitrogen regulatory protein P-II  84.96 
 
 
113 aa  200  7e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000123389  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1164  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  83.19 
 
 
113 aa  197  5e-50  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00000155222  normal  0.138498 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0531  nitrogen regulatory protein P-II  69.03 
 
 
113 aa  152  1e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00497558  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0517  nitrogen regulatory protein P-II  69.03 
 
 
113 aa  152  1e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000164694  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0112  nitrogen regulatory protein P-II  58.41 
 
 
113 aa  135  2e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3050  nitrogen regulatory protein P-II  57.52 
 
 
113 aa  127  6e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.59817  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0995  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 
112 aa  119  9.999999999999999e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.882952  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2478  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 
112 aa  119  9.999999999999999e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.464409  normal  0.572942 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3819  nitrogen regulatory protein P-II  51.79 
 
 
112 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00479  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 
112 aa  119  1.9999999999999998e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0371  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  52.68 
 
 
112 aa  117  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2590  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 
112 aa  117  4.9999999999999996e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0491  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 
112 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2477  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 
112 aa  117  6e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.698113  normal  0.567778 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0275  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 
112 aa  117  6e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3119  nitrogen regulatory protein P-II  51.79 
 
 
112 aa  117  7.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0086  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  52.68 
 
 
112 aa  117  7.999999999999999e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0840353  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0451  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 
112 aa  115  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.164177  normal  0.269933 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0641  nitrogen regulatory protein P-II  50.89 
 
 
112 aa  115  1.9999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.252116  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0198  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 
112 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.485304 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0217  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 
112 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000368327 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2513  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 
112 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00284343  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0080  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 
112 aa  115  1.9999999999999998e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.416357  normal  0.780104 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2137  nitrogen regulatory protein P-II  50.89 
 
 
112 aa  114  3e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.573897  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0342  nitrogen regulatory P-II transcription regulator protein  51.79 
 
 
112 aa  114  3.9999999999999997e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0053  nitrogen regulatory protein P-II  50.89 
 
 
112 aa  114  3.9999999999999997e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0041295  normal  0.377674 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1262  nitrogen regulatory protein P-II 1  54.46 
 
 
112 aa  114  3.9999999999999997e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.297918  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1155  nitrogen regulatory protein P-II 1  54.46 
 
 
112 aa  114  3.9999999999999997e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.717243  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3631  nitrogen regulatory protein P-II 1  54.46 
 
 
112 aa  114  3.9999999999999997e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2480  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 
112 aa  114  3.9999999999999997e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.312055  normal  0.888078 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0433  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 
112 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0037358  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0135  nitrogen regulatory protein P-II  50.89 
 
 
121 aa  114  3.9999999999999997e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000114835  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3772  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 
112 aa  114  3.9999999999999997e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.762526 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2406  nitrogen regulatory protein P-II  48.21 
 
 
112 aa  114  5e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0429  nitrogen regulatory protein P-II 1  52.68 
 
 
112 aa  114  5e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.398049  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0591  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 
112 aa  114  5e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.307832  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3237  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 
112 aa  114  6e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1017  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 
113 aa  113  6.9999999999999995e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000487669  normal  0.288979 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2530  nitrogen regulatory protein P-II  51.79 
 
 
112 aa  113  6.9999999999999995e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2408  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 
112 aa  113  6.9999999999999995e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.82113  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2915  nitrogen regulatory protein P-II 2  51.79 
 
 
112 aa  113  6.9999999999999995e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0326538  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1494  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 
112 aa  113  6.9999999999999995e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03437  hypothetical protein  51.79 
 
 
112 aa  113  7.999999999999999e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0523  nitrogen regulatory protein P-II  50.89 
 
 
112 aa  113  8.999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.278087  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3163  nitrogen regulatory protein P-II  50.89 
 
 
112 aa  113  8.999999999999998e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.105283  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1227  nitrogen regulatory protein P-II 1  53.57 
 
 
112 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2044  nitrogen regulatory protein P-II  51.79 
 
 
112 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0594  nitrogen regulatory protein P-II  50.89 
 
 
112 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3038  nitrogen regulatory protein P-II 1  53.57 
 
 
112 aa  112  1.0000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.196983  normal  0.293626 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03014  GlnB  50.89 
 
 
112 aa  112  1.0000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000337232  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2767  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 
112 aa  112  1.0000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2629  nitrogen regulatory protein P-II  48.21 
 
 
112 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.594654  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1355  nitrogen regulatory protein p-II  51.79 
 
 
112 aa  112  1.0000000000000001e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02445  regulatory protein P-II for glutamine synthetase  53.57 
 
 
112 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1115  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 
112 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5234  nitrogen regulatory protein P-II  49.11 
 
 
112 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03218  hypothetical protein  53.57 
 
 
114 aa  112  2.0000000000000002e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3649  nitrogen regulatory protein P-II 1  53.57 
 
 
112 aa  112  2.0000000000000002e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3787  nitrogen regulatory protein P-II 1  53.57 
 
 
112 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0217  nitrogen regulatory protein P-II  49.11 
 
 
112 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.531374  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2803  nitrogen regulatory protein P-II 1  53.57 
 
 
112 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0190  nitrogen regulatory protein P-II  49.11 
 
 
112 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0291  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 
112 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47790  Nitrogen regulatory protein P-II GlnK  50 
 
 
112 aa  112  2.0000000000000002e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.144153  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2706  nitrogen regulatory protein P-II 1  53.57 
 
 
112 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5506  nitrogen regulatory protein P-II  49.11 
 
 
112 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.851812  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0815  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 
136 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2918  nitrogen regulatory protein P-II 1  53.57 
 
 
112 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.94675  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2861  nitrogen regulatory protein P-II  51.79 
 
 
112 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.715878  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1124  nitrogen regulatory protein P-II 1  53.57 
 
 
112 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1339  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  50.89 
 
 
112 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2762  nitrogen regulatory protein P-II 1  53.57 
 
 
112 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02409  hypothetical protein  53.57 
 
 
112 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1086  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 
112 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2824  nitrogen regulatory protein P-II 1  53.57 
 
 
112 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002766  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 
112 aa  112  2.0000000000000002e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.370925  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2720  nitrogen regulatory protein P-II 1  53.57 
 
 
112 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0238  nitrogen regulatory protein P-II  49.11 
 
 
112 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0928138  normal  0.898368 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2838  nitrogen regulatory protein P-II 1  53.57 
 
 
112 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0240  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  50 
 
 
112 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.289663  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1065  nitrogen regulatory protein P-II  48.21 
 
 
112 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2706  nitrogen regulatory protein P-II 1  53.57 
 
 
112 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0295  nitrogen regulatory protein P-II  51.79 
 
 
112 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.886213  normal  0.678271 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2937  nitrogen regulatory protein P-II 1  53.57 
 
 
112 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5143  nitrogen regulatory protein P-II  49.11 
 
 
112 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5295  nitrogen regulatory protein P-II  49.11 
 
 
112 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3656  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 
112 aa  112  2.0000000000000002e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3048  nitrogen regulatory protein P-II 1  53.57 
 
 
112 aa  112  3e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1181  nitrogen regulatory protein P-II  49.11 
 
 
112 aa  111  3e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000688194 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3770  nitrogen regulatory protein P-II  50.89 
 
 
116 aa  111  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.929056 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2036  nitrogen regulatory protein P-II  50.89 
 
 
112 aa  111  3e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.504448  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0642  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  53.57 
 
 
112 aa  111  3e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0211837  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0173  nitrogen regulatory protein P-II  51.79 
 
 
112 aa  111  3e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000293377  normal  0.353092 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0234  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 
112 aa  111  3e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000834653  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2733  nitrogen regulatory protein P-II  50.89 
 
 
112 aa  111  3e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.122931 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4094  nitrogen regulatory protein P-II  50.89 
 
 
116 aa  111  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.52607  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6030  nitrogen regulatory protein P-II 2  49.11 
 
 
112 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69810  nitrogen regulatory protein P-II 2  49.11 
 
 
112 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.194686  normal  0.241854 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>