More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0972 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_0972  nitrogen regulatory protein P-II  100 
 
 
113 aa  228  3e-59  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000123389  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1164  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  88.5 
 
 
113 aa  210  5.999999999999999e-54  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00000155222  normal  0.138498 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1342  nitrogen regulatory protein P-II  84.07 
 
 
113 aa  200  4e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000000301067  unclonable  0.00000108063 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1137  nitrogen regulatory protein P-II  84.96 
 
 
113 aa  200  7e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.201523 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0517  nitrogen regulatory protein P-II  66.37 
 
 
113 aa  149  2e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000164694  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0531  nitrogen regulatory protein P-II  66.37 
 
 
113 aa  149  2e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00497558  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0112  nitrogen regulatory protein P-II  58.41 
 
 
113 aa  130  6e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3119  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 
112 aa  123  7e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0523  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 
112 aa  123  8.000000000000001e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.278087  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0053  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 
112 aa  123  1e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0041295  normal  0.377674 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0641  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 
112 aa  121  2e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.252116  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3656  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 
112 aa  122  2e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0594  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 
112 aa  122  2e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0433  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 
112 aa  122  2e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0037358  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0080  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 
112 aa  122  2e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.416357  normal  0.780104 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47790  Nitrogen regulatory protein P-II GlnK  54.46 
 
 
112 aa  121  3e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.144153  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2590  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 
112 aa  121  3e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5234  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 
112 aa  120  4e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0217  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 
112 aa  120  4e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.531374  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0190  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 
112 aa  120  4e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5506  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 
112 aa  120  4e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.851812  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2478  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 
112 aa  121  4e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.464409  normal  0.572942 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5143  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 
112 aa  120  4e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0135  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 
121 aa  121  4e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000114835  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0238  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 
112 aa  120  4e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0928138  normal  0.898368 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2513  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 
112 aa  121  4e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00284343  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5295  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 
112 aa  120  4e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0198  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 
112 aa  120  5e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.485304 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0217  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 
112 aa  120  5e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000368327 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00479  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 
112 aa  120  6e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6030  nitrogen regulatory protein P-II 2  53.57 
 
 
112 aa  120  8e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0259  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 
112 aa  120  8e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69810  nitrogen regulatory protein P-II 2  53.57 
 
 
112 aa  120  8e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.194686  normal  0.241854 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2137  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 
112 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.573897  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0342  nitrogen regulatory P-II transcription regulator protein  54.46 
 
 
112 aa  119  9.999999999999999e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0995  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 
112 aa  119  9.999999999999999e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.882952  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0173  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 
112 aa  119  9.999999999999999e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000293377  normal  0.353092 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3163  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 
112 aa  119  9.999999999999999e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.105283  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2477  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 
112 aa  119  9.999999999999999e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.698113  normal  0.567778 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2044  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 
112 aa  118  1.9999999999999998e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1262  nitrogen regulatory protein P-II 1  55.36 
 
 
112 aa  119  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.297918  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0291  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 
112 aa  118  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0371  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  51.79 
 
 
112 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3631  nitrogen regulatory protein P-II 1  55.36 
 
 
112 aa  119  1.9999999999999998e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2406  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 
112 aa  119  1.9999999999999998e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2346  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  54.46 
 
 
112 aa  119  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.235899 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0491  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 
112 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1155  nitrogen regulatory protein P-II 1  55.36 
 
 
112 aa  119  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.717243  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2043  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 
112 aa  118  3e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.242523  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0120  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 
112 aa  118  3e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0723912 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2530  nitrogen regulatory protein P-II  51.79 
 
 
112 aa  118  3e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0240  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  54.46 
 
 
112 aa  118  3e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.289663  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0218  nitrogen regulatory protein P-II  50.89 
 
 
112 aa  118  3e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.601689  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3237  nitrogen regulatory protein P-II  49.11 
 
 
112 aa  118  3e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2915  nitrogen regulatory protein P-II 2  51.79 
 
 
112 aa  118  3e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0326538  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1227  nitrogen regulatory protein P-II 1  54.46 
 
 
112 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3243  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 
112 aa  117  3.9999999999999996e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.669306  normal  0.422234 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2629  nitrogen regulatory protein P-II  49.11 
 
 
112 aa  117  3.9999999999999996e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.594654  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2408  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 
112 aa  117  3.9999999999999996e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.82113  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0275  nitrogen regulatory protein P-II  51.79 
 
 
112 aa  117  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2767  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 
112 aa  117  4.9999999999999996e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1065  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 
112 aa  117  4.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3050  nitrogen regulatory protein P-II  52.21 
 
 
113 aa  117  6e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.59817  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1545  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 
112 aa  117  6e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3038  nitrogen regulatory protein P-II 1  55.36 
 
 
112 aa  117  7e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.196983  normal  0.293626 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002572  nitrogen regulatory protein P-II  51.79 
 
 
112 aa  117  7e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000156099  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03437  hypothetical protein  50.89 
 
 
112 aa  117  7e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3649  nitrogen regulatory protein P-II 1  54.46 
 
 
112 aa  117  7.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1086  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 
112 aa  117  7.999999999999999e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1516  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 
112 aa  117  7.999999999999999e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.14536 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0086  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  50.89 
 
 
112 aa  116  7.999999999999999e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0840353  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1494  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 
112 aa  116  9e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0171  nitrogen regulatory protein P-II  51.79 
 
 
112 aa  116  9e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.138781  normal  0.605066 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1130  nitrogen regulatory protein P-II  50.89 
 
 
112 aa  116  9e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3819  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 
112 aa  115  9.999999999999999e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3048  nitrogen regulatory protein P-II 1  54.46 
 
 
112 aa  116  9.999999999999999e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0143  nitrogen regulatory protein P-II  50.89 
 
 
112 aa  116  9.999999999999999e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3942  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 
112 aa  116  9.999999999999999e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0234  nitrogen regulatory protein P-II  51.79 
 
 
112 aa  115  9.999999999999999e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000834653  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0183  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 
112 aa  116  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.320277  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0451  nitrogen regulatory protein P-II  50.89 
 
 
112 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.164177  normal  0.269933 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1115  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 
112 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1302  nitrogen regulatory protein P-II  49.11 
 
 
112 aa  115  1.9999999999999998e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.54202  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1124  nitrogen regulatory protein P-II 1  55.36 
 
 
112 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2762  nitrogen regulatory protein P-II 1  55.36 
 
 
112 aa  115  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2803  nitrogen regulatory protein P-II 1  55.36 
 
 
112 aa  115  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02409  hypothetical protein  55.36 
 
 
112 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3787  nitrogen regulatory protein P-II 1  55.36 
 
 
112 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2559  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 
112 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.32282  normal  0.488626 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2918  nitrogen regulatory protein P-II 1  55.36 
 
 
112 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.94675  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0472  nitrogen regulatory protein P-II  50.89 
 
 
112 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2387  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 
112 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.344208 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2720  nitrogen regulatory protein P-II 1  55.36 
 
 
112 aa  115  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2706  nitrogen regulatory protein P-II 1  55.36 
 
 
112 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2706  nitrogen regulatory protein P-II 1  55.36 
 
 
112 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3586  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 
112 aa  115  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0323305  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1355  nitrogen regulatory protein p-II  51.79 
 
 
112 aa  115  1.9999999999999998e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2838  nitrogen regulatory protein P-II 1  55.36 
 
 
112 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0623  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 
112 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000846933  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3314  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 
112 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.431384  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>