More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_3050 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_3050  nitrogen regulatory protein P-II  100 
 
 		 113 aa  229  1e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.59817  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0112  nitrogen regulatory protein P-II  75.22 
 
 		 113 aa  182  1.0000000000000001e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3493  nitrogen regulatory protein P-II  66.98 
 
 		 108 aa  147  5e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1137  nitrogen regulatory protein P-II  57.52 
 
 		 113 aa  127  6e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.201523 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0531  nitrogen regulatory protein P-II  58.41 
 
 		 113 aa  127  7.000000000000001e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00497558  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0517  nitrogen regulatory protein P-II  58.41 
 
 		 113 aa  127  7.000000000000001e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000164694  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1342  nitrogen regulatory protein P-II  55.75 
 
 		 113 aa  125  2.0000000000000002e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000000301067  unclonable  0.00000108063 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0972  nitrogen regulatory protein P-II  52.21 
 
 		 113 aa  117  6e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000123389  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1164  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  53.1 
 
 		 113 aa  117  7e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00000155222  normal  0.138498 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0295  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 		 112 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.886213  normal  0.678271 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0995  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 112 aa  112  2.0000000000000002e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.882952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0912  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  49.11 
 
 		 112 aa  108  3e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  4.42242e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0371  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  51.79 
 
 		 112 aa  107  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0086  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  51.79 
 
 		 112 aa  107  5e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0840353  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0302  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 		 112 aa  107  7.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0275  nitrogen regulatory protein P-II  51.79 
 
 		 112 aa  106  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0451  nitrogen regulatory protein P-II  51.79 
 
 		 112 aa  106  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.164177  normal  0.269933 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0594  nitrogen regulatory protein P-II  49.11 
 
 		 112 aa  106  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0234  nitrogen regulatory protein P-II  48.21 
 
 		 112 aa  105  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000834653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1918  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 112 aa  105  3e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2915  nitrogen regulatory protein P-II 2  50 
 
 		 112 aa  105  3e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0326538  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2530  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 112 aa  105  3e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3218  P-II family regulatory protein  49.11 
 
 		 112 aa  104  4e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.472285  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0651  nitrogen regulatory protein P-II  49.11 
 
 		 112 aa  104  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.888486  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1400  nitrogen regulatory protein P-II  49.11 
 
 		 112 aa  104  4e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0407  nitrogen regulatory protein P-II  49.11 
 
 		 112 aa  104  4e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.32852  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2827  nitrogen regulatory protein P-II  49.11 
 
 		 112 aa  104  4e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.994537  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0487  nitrogen regulatory protein P-II  49.11 
 
 		 112 aa  104  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.188054  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0193  nitrogen regulatory protein P-II  49.11 
 
 		 112 aa  104  4e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.431486  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0468  nitrogen regulatory protein P-II  49.11 
 
 		 112 aa  104  4e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.409463  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0291  nitrogen regulatory protein P-II  49.11 
 
 		 112 aa  104  5e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1499  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  48.21 
 
 		 112 aa  104  5e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2252  nitrogen regulatory protein P-II  49.11 
 
 		 112 aa  104  5e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0233324  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0437  nitrogen regulatory protein P-II  49.11 
 
 		 112 aa  104  5e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2921  nitrogen regulatory protein P-II  49.11 
 
 		 112 aa  104  5e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0772673  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2877  nitrogen regulatory protein P-II  49.11 
 
 		 112 aa  104  5e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.58077  normal  0.596742 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2866  nitrogen regulatory protein P-II  49.11 
 
 		 136 aa  104  5e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00138557  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2783  nitrogen regulatory protein P-II  49.11 
 
 		 112 aa  104  5e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.190051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6195  nitrogen regulatory protein P-II  49.11 
 
 		 136 aa  103  6e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0198  nitrogen regulatory protein P-II  49.11 
 
 		 112 aa  103  7e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.485304 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2478  nitrogen regulatory protein P-II  50.89 
 
 		 112 aa  103  7e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.464409  normal  0.572942 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0217  nitrogen regulatory protein P-II  49.11 
 
 		 112 aa  103  7e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000368327 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0342  nitrogen regulatory P-II transcription regulator protein  49.11 
 
 		 112 aa  103  8e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0159  nitrogen regulatory protein P-II  48.7 
 
 		 114 aa  103  8e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0269  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  50.89 
 
 		 112 aa  103  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.76816  normal  0.184312 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3237  nitrogen regulatory protein P-II  49.11 
 
 		 112 aa  102  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3770  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 116 aa  102  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.929056 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4239  nitrogen regulatory protein PII  50 
 
 		 116 aa  102  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0693  nitrogen regulatory protein P-II  47.32 
 
 		 112 aa  102  2e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.333555  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4094  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 116 aa  102  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.52607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1130  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 112 aa  101  3e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4190  nitrogen regulatory protein P-II  47.32 
 
 		 112 aa  101  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.959597 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0256  nitrogen regulatory protein P-II  47.32 
 
 		 112 aa  101  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0525  nitrogen regulatory protein P-II  47.32 
 
 		 112 aa  101  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.887906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2733  nitrogen regulatory protein P-II  49.06 
 
 		 112 aa  101  3e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.122931 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2629  nitrogen regulatory protein P-II  49.11 
 
 		 112 aa  101  4e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.594654  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0218  nitrogen regulatory protein P-II  48.21 
 
 		 112 aa  101  4e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.601689  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00479  nitrogen regulatory protein P-II  49.11 
 
 		 112 aa  100  5e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3119  nitrogen regulatory protein P-II  47.32 
 
 		 112 aa  100  7e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0240  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  47.32 
 
 		 112 aa  100  7e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.289663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0240  nitrogen regulatory protein P-II  47.32 
 
 		 112 aa  100  8e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.806951 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2209  nitrogen regulatory protein P-II  48.21 
 
 		 112 aa  100  8e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.448638  normal  0.538315 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0523  nitrogen regulatory protein P-II  48.21 
 
 		 112 aa  100  8e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.278087  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2406  nitrogen regulatory protein P-II  45.54 
 
 		 112 aa  100  9e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0472  nitrogen regulatory protein P-II  48.21 
 
 		 112 aa  100  9e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0491  nitrogen regulatory protein P-II  49.11 
 
 		 112 aa  100  9e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0195  nitrogen regulatory protein P-II  44.64 
 
 		 112 aa  100  9e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.863029 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1302  nitrogen regulatory protein P-II  45.54 
 
 		 112 aa  99.4  1e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.54202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0053  nitrogen regulatory protein P-II  47.32 
 
 		 112 aa  99.4  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0041295  normal  0.377674 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0183  nitrogen regulatory protein P-II  46.43 
 
 		 112 aa  99.4  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.320277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0981  nitrogen regulatory protein P-II  45.54 
 
 		 112 aa  99.8  1e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.502811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0115  nitrogen regulatory protein P-II  47.32 
 
 		 116 aa  99.8  1e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0778651  normal  0.359579 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2137  nitrogen regulatory protein P-II  47.32 
 
 		 112 aa  99.4  2e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.573897  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0146  nitrogen regulatory protein P-II  49.11 
 
 		 112 aa  98.6  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.220304  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0120  nitrogen regulatory protein P-II  46.43 
 
 		 112 aa  99  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0723912 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2477  nitrogen regulatory protein P-II  48.21 
 
 		 112 aa  99.4  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.698113  normal  0.567778 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1957  nitrogen regulatory protein P-II  47.32 
 
 		 112 aa  98.6  2e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0449  nitrogen regulatory protein P-II  46.43 
 
 		 112 aa  99  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.321853  normal  0.279949 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1779  nitrogen regulatory protein P-II  49.11 
 
 		 112 aa  98.6  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.903734 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1345  nitrogen regulatory protein P-II  49.11 
 
 		 112 aa  99  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.934318 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03014  GlnB  47.32 
 
 		 112 aa  98.6  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000337232  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0233  nitrogen regulatory protein P-II  48.21 
 
 		 112 aa  99  2e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0163  nitrogen regulatory protein P-II  47.32 
 
 		 112 aa  98.6  3e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.814781 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0372  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  45.54 
 
 		 112 aa  98.6  3e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3656  nitrogen regulatory protein P-II  46.43 
 
 		 112 aa  98.2  3e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2513  nitrogen regulatory protein P-II  47.32 
 
 		 112 aa  98.2  3e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00284343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3163  nitrogen regulatory protein P-II  47.32 
 
 		 112 aa  98.2  3e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.105283  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0181  nitrogen regulatory protein P-II  47.32 
 
 		 112 aa  98.6  3e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.153981  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5499  nitrogen regulatory protein P-II  47.32 
 
 		 112 aa  98.2  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.118454 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0900  nitrogen regulatory protein P-II  45.54 
 
 		 117 aa  98.2  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.471092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0433  nitrogen regulatory protein P-II  45.54 
 
 		 112 aa  97.8  4e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0037358  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0171  nitrogen regulatory protein P-II  45.54 
 
 		 112 aa  97.8  4e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.138781  normal  0.605066 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3627  nitrogen regulatory protein P-II  45.54 
 
 		 112 aa  97.8  5e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.186884 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2852  nitrogen regulatory protein P-II  49.11 
 
 		 112 aa  97.8  5e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.287324  normal  0.0455746 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1663  nitrogen regulatory protein P-II  47.32 
 
 		 112 aa  97.4  5e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.824699  normal  0.572812 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2357  nitrogen regulatory protein P-II  47.32 
 
 		 112 aa  97.8  5e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2326  nitrogen regulatory protein P-II  47.32 
 
 		 112 aa  97.8  5e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.875617  normal  0.385523 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2044  nitrogen regulatory protein P-II  47.32 
 
 		 112 aa  97.4  6e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0173  nitrogen regulatory protein P-II  45.54 
 
 		 112 aa  97.4  6e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000293377  normal  0.353092 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0380  nitrogen regulatory protein P-II  47.32 
 
 		 114 aa  97.4  6e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>