More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1766 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_1766  methionine aminopeptidase, type I  100 
 
 
272 aa  565  1e-160  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.933376  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3053  methionine aminopeptidase, type I  50.38 
 
 
275 aa  250  2e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0172083  normal  0.17574 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0856  methionine aminopeptidase  46.79 
 
 
266 aa  243  1.9999999999999999e-63  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2941  methionine aminopeptidase, type I  47.24 
 
 
274 aa  243  3e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1917  methionine aminopeptidase, type I  49.4 
 
 
267 aa  243  3e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0748746 
 
 
-
 
NC_002978  WD0167  methionine aminopeptidase  45.82 
 
 
260 aa  241  1e-62  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7508  methionine aminopeptidase, type I  47.47 
 
 
274 aa  241  1e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.771886  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1138  methionine aminopeptidase  47.22 
 
 
266 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000518116  normal  0.111417 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1733  putative methionine aminopeptidase  44.66 
 
 
266 aa  238  5.999999999999999e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.491997  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1149  methionine aminopeptidase, type I  49.23 
 
 
268 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0670  methionine aminopeptidase, type I  49.23 
 
 
268 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1269  methionine aminopeptidase  45.88 
 
 
265 aa  238  9e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.210872  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0586  methionine aminopeptidase, type I  46.85 
 
 
275 aa  237  1e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.487821  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2162  methionine aminopeptidase, type I  48.22 
 
 
279 aa  237  1e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1125  methionine aminopeptidase, type I  49.23 
 
 
268 aa  238  1e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.000764219  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2903  methionine aminopeptidase  47.45 
 
 
268 aa  237  2e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00196224  normal  0.258736 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1480  methionine aminopeptidase  47.45 
 
 
268 aa  237  2e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000568537  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1449  methionine aminopeptidase  47.45 
 
 
268 aa  237  2e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000120153  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2636  methionine aminopeptidase  45.88 
 
 
265 aa  237  2e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000406904  normal  0.209641 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6761  methionine aminopeptidase, type I  47.08 
 
 
274 aa  237  2e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0332677  normal  0.179612 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1444  methionine aminopeptidase  47.45 
 
 
268 aa  237  2e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000385139  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3282  methionine aminopeptidase  46.43 
 
 
265 aa  237  2e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000000794672  hitchhiker  0.0000144576 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1064  methionine aminopeptidase  46.92 
 
 
266 aa  236  3e-61  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.225405  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3795  methionine aminopeptidase, type I  47.7 
 
 
250 aa  235  5.0000000000000005e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0385328  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1086  methionine aminopeptidase, type I  47.28 
 
 
250 aa  235  6e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0756578  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0784  methionine aminopeptidase  47.81 
 
 
269 aa  235  6e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.214544 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1027  methionine aminopeptidase, type I  48.62 
 
 
268 aa  234  9e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3100  methionine aminopeptidase, type I  48.45 
 
 
271 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.612073  normal  0.249942 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3162  methionine aminopeptidase  44.71 
 
 
265 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00027219  normal  0.447345 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1158  methionine aminopeptidase  49.21 
 
 
258 aa  233  3e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1031  methionine aminopeptidase, type I  48.22 
 
 
268 aa  232  4.0000000000000004e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.872831  normal  0.941111 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2206  methionine aminopeptidase, type I  47.43 
 
 
284 aa  232  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.462333  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0402  methionine aminopeptidase  47.11 
 
 
255 aa  232  5e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.48358 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2886  methionine aminopeptidase  45.1 
 
 
266 aa  232  6e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00071423  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0337  methionine aminopeptidase, type I  46.61 
 
 
262 aa  231  8.000000000000001e-60  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.184617  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1581  methionine aminopeptidase, type I  49.4 
 
 
271 aa  231  1e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0754  methionine aminopeptidase  46.77 
 
 
256 aa  230  1e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.837605  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2293  methionine aminopeptidase, type I  49.4 
 
 
271 aa  231  1e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.050606 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2482  methionine aminopeptidase, type I  47.04 
 
 
284 aa  230  2e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2906  methionine aminopeptidase, type I  45.17 
 
 
263 aa  229  2e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.320863  normal  0.193027 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2642  methionine aminopeptidase  45.63 
 
 
278 aa  230  2e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000168885  normal  0.351065 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2709  methionine aminopeptidase  45.63 
 
 
278 aa  230  2e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00736812  normal  0.164197 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2816  methionine aminopeptidase  45.24 
 
 
278 aa  229  4e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000497002  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0183  methionine aminopeptidase  47.64 
 
 
262 aa  229  5e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.275285  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1760  methionine aminopeptidase, type I  47.43 
 
 
267 aa  229  5e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.508465 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1553  methionine aminopeptidase  46.03 
 
 
265 aa  229  5e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00648208  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1627  methionine aminopeptidase  44.84 
 
 
265 aa  228  6e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1347  methionine aminopeptidase  45.31 
 
 
278 aa  228  7e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000200998  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4261  methionine aminopeptidase, type I  47.83 
 
 
268 aa  228  8e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.814393  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1910  methionine aminopeptidase  46.18 
 
 
275 aa  228  9e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.529497  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2156  methionine aminopeptidase, type I  47.43 
 
 
268 aa  227  1e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0942578  normal  0.307314 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1273  methionine aminopeptidase  47.22 
 
 
258 aa  227  1e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.65111  normal  0.766609 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39000  methionine aminopeptidase  49.6 
 
 
260 aa  227  2e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3054  methionine aminopeptidase  46.77 
 
 
260 aa  226  2e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.020093  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1044  methionine aminopeptidase, type I  44.88 
 
 
279 aa  226  2e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.27507 
 
 
-
 
NC_004310  BR1282  methionine aminopeptidase  44.98 
 
 
275 aa  226  3e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00202985  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0506  methionine aminopeptidase, type I  48.59 
 
 
278 aa  226  3e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.224089  normal  0.874449 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0566  methionine aminopeptidase, type I  47.22 
 
 
261 aa  226  4e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0799254  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1245  methionine aminopeptidase  44.98 
 
 
299 aa  226  4e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.12762  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3118  methionine aminopeptidase, type I  47.39 
 
 
270 aa  226  4e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0559112  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1319  methionine aminopeptidase, type I  47.95 
 
 
285 aa  226  4e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.123772  normal  0.0982705 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1412  methionine aminopeptidase type I  48.18 
 
 
298 aa  225  5.0000000000000005e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.906768  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1455  methionine aminopeptidase  43.66 
 
 
274 aa  225  5.0000000000000005e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.519958  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00166  methionine aminopeptidase  45.78 
 
 
264 aa  225  6e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.115272  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3435  methionine aminopeptidase, type I  45.78 
 
 
264 aa  225  6e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.360729  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0171  methionine aminopeptidase  45.78 
 
 
264 aa  225  6e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.118644  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00165  hypothetical protein  45.78 
 
 
264 aa  225  6e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0974285  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1740  methionine aminopeptidase  45.1 
 
 
266 aa  225  6e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0176  methionine aminopeptidase  45.78 
 
 
264 aa  225  6e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0363695  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0178  methionine aminopeptidase  45.78 
 
 
264 aa  225  6e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.26554  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0170  methionine aminopeptidase  45.78 
 
 
264 aa  225  6e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.892209  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4300  methionine aminopeptidase  46.5 
 
 
253 aa  225  6e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.182547 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2587  methionine aminopeptidase, type I  47.62 
 
 
284 aa  225  6e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.625106 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4238  methionine aminopeptidase  46.5 
 
 
253 aa  225  6e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0160  methionine aminopeptidase  45.78 
 
 
264 aa  225  6e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00761799  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2076  methionine aminopeptidase, type I  44.88 
 
 
277 aa  225  6e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3492  methionine aminopeptidase  45.78 
 
 
264 aa  225  6e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.317527  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12160  methionine aminopeptidase, type I  49.61 
 
 
286 aa  225  7e-58  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00879026  normal  0.104642 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0733  methionine aminopeptidase, type I  44.92 
 
 
271 aa  224  8e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.801618  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4852  methionine aminopeptidase, type I  47.67 
 
 
271 aa  224  9e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.838238  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1452  methionine aminopeptidase, type I  48.24 
 
 
278 aa  224  9e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.814103  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0236  methionine aminopeptidase  46.59 
 
 
264 aa  224  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.712887 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1012  methionine aminopeptidase  45.78 
 
 
263 aa  224  1e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000377508  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0336  peptidase M24A  45.28 
 
 
271 aa  224  1e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.575724  normal  0.771831 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2644  methionine aminopeptidase, type I  48.81 
 
 
272 aa  224  1e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0236  methionine aminopeptidase  46.59 
 
 
264 aa  224  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0239  methionine aminopeptidase  46.59 
 
 
264 aa  224  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.631965  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0254  methionine aminopeptidase  46.59 
 
 
264 aa  224  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0252  methionine aminopeptidase  46.59 
 
 
264 aa  224  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.44257  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2557  methionine aminopeptidase, type I  48.81 
 
 
272 aa  224  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1618  methionine aminopeptidase, type I  48.81 
 
 
272 aa  224  2e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2119  methionine aminopeptidase, type I  48.81 
 
 
272 aa  224  2e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1393  methionine aminopeptidase, type I  48.81 
 
 
272 aa  224  2e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2504  methionine aminopeptidase, type I  48.81 
 
 
272 aa  224  2e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.738612  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0155  methionine aminopeptidase, type I  48.56 
 
 
274 aa  223  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.368202  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3195  methionine aminopeptidase, type I  48.81 
 
 
273 aa  224  2e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.218576  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3610  methionine aminopeptidase, type I  49 
 
 
276 aa  223  2e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.204392  normal  0.74642 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1065  methionine aminopeptidase  45.78 
 
 
263 aa  223  3e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0252964  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0378  methionine aminopeptidase, type I  47.11 
 
 
279 aa  223  3e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2026  methionine aminopeptidase  47.83 
 
 
271 aa  222  4e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>