166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1047 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_1047  transposase IS4 family protein  100 
 
 		 497 aa  1018    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.183518  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1661  IS4 family transposase  39.34 
 
 		 458 aa  258  2e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.754512 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2539  IS4 family transposase  39.34 
 
 		 458 aa  258  2e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.542819  hitchhiker  0.00975932 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2425  transposase  33.8 
 
 		 489 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2212  IS4 transposase  31.7 
 
 		 442 aa  114  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0327329  normal  0.418952 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1741  IS4 transposase  31.7 
 
 		 442 aa  114  6e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000150228  unclonable  2.9887999999999996e-21 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2573  IS4 transposase  31.7 
 
 		 442 aa  114  6e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.163039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2916  IS4 transposase  31.7 
 
 		 442 aa  114  6e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00217078  normal  0.61002 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4353  IS4 transposase  31.7 
 
 		 442 aa  114  6e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.621464 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2056  IS4 transposase  31.7 
 
 		 448 aa  113  7.000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2280  IS4 transposase  31.7 
 
 		 448 aa  113  7.000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2027  IS4 transposase  31.7 
 
 		 448 aa  113  7.000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000537624  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2496  IS4 transposase  31.7 
 
 		 448 aa  113  7.000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2762  IS4 transposase  31.7 
 
 		 448 aa  113  7.000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0503533  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2790  IS4 transposase  31.7 
 
 		 448 aa  113  7.000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2546  IS4 transposase  31.7 
 
 		 448 aa  113  7.000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4278  IS4 transposase  31.7 
 
 		 448 aa  113  7.000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0475  IS4 transposase  31.7 
 
 		 448 aa  113  7.000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1691  transposase (IS4 family)  28.09 
 
 		 542 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0674671  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3503  IS4 transposase  31.7 
 
 		 448 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0875962  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3997  IS4 transposase  31.7 
 
 		 448 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0633832  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3707  IS4 ORF  31.7 
 
 		 395 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000458395  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2394  transposase (IS4 family)  31.41 
 
 		 395 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.70731  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0033  IS4 transposase  31.7 
 
 		 448 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4174  IS4 transposase  31.7 
 
 		 448 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0120  IS4 transposase  31.7 
 
 		 448 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1807  IS4 transposase  31.7 
 
 		 448 aa  111  3e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3754  IS4 transposase  31.37 
 
 		 448 aa  111  3e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4113  IS4 transposase  31.7 
 
 		 448 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1038  transposase IS4 family protein  30.26 
 
 		 436 aa  111  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.158805  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2977  IS4 ORF  31.37 
 
 		 400 aa  110  7.000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0325653  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04140  IS4 predicted transposase  31.05 
 
 		 442 aa  109  1e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3723  transposase IS4 family protein  31.05 
 
 		 442 aa  109  1e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04103  hypothetical protein  31.05 
 
 		 442 aa  109  1e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2324  IS4 transposase  31.37 
 
 		 448 aa  108  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000109672  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1969  hypothetical protein  40 
 
 		 255 aa  107  4e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.820911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3433  transposase IS4 family protein  30 
 
 		 449 aa  107  4e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.168872  normal  0.0300834 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2909  transposase IS4 family protein  30 
 
 		 449 aa  107  4e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.623174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2322  transposase IS4 family protein  30 
 
 		 449 aa  107  4e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2863  transposase IS4 family protein  30.58 
 
 		 440 aa  103  5e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1743  transposase IS4 family protein  30.28 
 
 		 406 aa  103  7e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3185  transposase IS4 family protein  27.98 
 
 		 440 aa  102  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.100541 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1164  transposase, IS4 family protein  28.01 
 
 		 440 aa  101  3e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.417072  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1414  transposase, IS4 family protein  28.01 
 
 		 440 aa  101  3e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4179  transposase, IS4 family protein  28.01 
 
 		 440 aa  101  3e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0206865  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2417  transposase IS4 family protein  27.98 
 
 		 440 aa  101  3e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.424861  hitchhiker  0.000136578 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0665  transposase, IS4 family protein  27.98 
 
 		 446 aa  100  4e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3915  transposase IS4 family protein  27.98 
 
 		 446 aa  100  5e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3485  transposase IS4 family protein  27.98 
 
 		 440 aa  100  5e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3031  transposase IS4 family protein  27.98 
 
 		 440 aa  100  5e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2940  transposase IS4 family protein  27.98 
 
 		 440 aa  100  5e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.517731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1671  transposase IS4 family protein  27.98 
 
 		 440 aa  100  5e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000299325  hitchhiker  0.00155503 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2295  transposase IS4 family protein  27.98 
 
 		 440 aa  100  5e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00969572  normal  0.992733 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3429  transposase IS4 family protein  30.99 
 
 		 421 aa  99.8  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0724  transposase, IS4 family protein  29.08 
 
 		 378 aa  98.6  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1093  ISSod7, transposase  28.08 
 
 		 440 aa  97.1  6e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1833  ISSod7, transposase  28.08 
 
 		 440 aa  97.1  6e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3544  ISSod7, transposase  28.08 
 
 		 440 aa  97.1  6e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4077  transposase IS4 family protein  27.7 
 
 		 440 aa  97.1  6e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.775632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3808  transposase, IS4 family protein  27.7 
 
 		 440 aa  96.3  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4135  ISSod7, transposase  27.79 
 
 		 440 aa  95.5  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3106  transposase IS4 family protein  27.84 
 
 		 451 aa  94.7  3e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.99267  normal  0.0276245 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1184  transposase  28.01 
 
 		 435 aa  93.2  9e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.334864  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0617  transposase  28.01 
 
 		 435 aa  93.2  9e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.34753  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1776  transposase  28.01 
 
 		 441 aa  93.2  1e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2844  transposase  28.01 
 
 		 441 aa  93.2  1e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0290796  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2826  transposase  28.01 
 
 		 441 aa  93.2  1e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0283  transposase  28.01 
 
 		 441 aa  93.2  1e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2962  transposase  28.01 
 
 		 441 aa  93.2  1e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1954  transposase  28.01 
 
 		 441 aa  93.2  1e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1349  transposase  28.01 
 
 		 441 aa  93.2  1e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2027  transposase  28.01 
 
 		 441 aa  93.2  1e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.28488  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00405  transposase  28.33 
 
 		 441 aa  91.3  4e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00448  transposase  28.33 
 
 		 441 aa  91.3  4e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00558  transposase  28.33 
 
 		 441 aa  91.3  4e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00797  hypothetical protein  28.33 
 
 		 441 aa  91.3  4e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01062  hypothetical protein  28.33 
 
 		 441 aa  91.3  4e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01118  hypothetical protein  28.33 
 
 		 441 aa  91.3  4e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01156  hypothetical protein  28.33 
 
 		 441 aa  91.3  4e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01584  hypothetical protein  28.33 
 
 		 441 aa  91.3  4e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01746  hypothetical protein  28.33 
 
 		 441 aa  91.3  4e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03025  hypothetical protein  28.33 
 
 		 441 aa  91.3  4e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03297  hypothetical protein  28.33 
 
 		 441 aa  91.3  4e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03531  hypothetical protein  28.33 
 
 		 441 aa  91.3  4e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04888  hypothetical protein  28.33 
 
 		 441 aa  91.3  4e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05175  hypothetical protein  28.33 
 
 		 441 aa  91.3  4e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05353  hypothetical protein  28.33 
 
 		 441 aa  91.3  4e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05572  hypothetical protein  28.33 
 
 		 441 aa  91.3  4e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05628  hypothetical protein  28.33 
 
 		 456 aa  91.3  4e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05700  hypothetical protein  28.33 
 
 		 441 aa  91.3  4e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05878  hypothetical protein  28.33 
 
 		 441 aa  91.3  4e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06534  hypothetical protein  28.33 
 
 		 441 aa  91.3  4e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2183  transposase, IS4  29.35 
 
 		 412 aa  90.9  5e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.208464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0119  transposase DDE domain-containing protein  27.87 
 
 		 423 aa  90.5  6e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05740  hypothetical protein  27.99 
 
 		 383 aa  90.1  7e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6319  transposase IS4 family protein  28.3 
 
 		 420 aa  86.7  9e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6322  transposase IS4 family protein  28.3 
 
 		 420 aa  86.7  9e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2762  transposase IS4 family protein  28.3 
 
 		 420 aa  86.3  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5533  transposase IS4 family protein  28.3 
 
 		 420 aa  86.3  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.541697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0990  transposase IS4 family protein  30.4 
 
 		 440 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0133097  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>