180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2425 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2425  transposase  100 
 
 		 489 aa  1016    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2539  IS4 family transposase  36.89 
 
 		 458 aa  249  5e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.542819  hitchhiker  0.00975932 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1661  IS4 family transposase  36.65 
 
 		 458 aa  248  2e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.754512 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1047  transposase IS4 family protein  33.8 
 
 		 497 aa  223  4.9999999999999996e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.183518  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0475  IS4 transposase  26.1 
 
 		 448 aa  109  9.000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2027  IS4 transposase  26.1 
 
 		 448 aa  109  9.000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000537624  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2280  IS4 transposase  26.1 
 
 		 448 aa  109  9.000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2546  IS4 transposase  26.1 
 
 		 448 aa  109  9.000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4278  IS4 transposase  26.1 
 
 		 448 aa  109  9.000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2790  IS4 transposase  26.1 
 
 		 448 aa  109  9.000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2056  IS4 transposase  26.1 
 
 		 448 aa  109  9.000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2762  IS4 transposase  26.1 
 
 		 448 aa  109  9.000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0503533  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2496  IS4 transposase  26.1 
 
 		 448 aa  109  9.000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0120  IS4 transposase  26.27 
 
 		 448 aa  108  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0033  IS4 transposase  26.1 
 
 		 448 aa  108  3e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3503  IS4 transposase  26.1 
 
 		 448 aa  108  3e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0875962  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3997  IS4 transposase  26.1 
 
 		 448 aa  108  3e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0633832  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4113  IS4 transposase  26.1 
 
 		 448 aa  107  5e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1807  IS4 transposase  26.1 
 
 		 448 aa  106  9e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4353  IS4 transposase  26.27 
 
 		 442 aa  106  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.621464 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1741  IS4 transposase  26.2 
 
 		 442 aa  106  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000150228  unclonable  2.9887999999999996e-21 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2573  IS4 transposase  26.2 
 
 		 442 aa  106  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.163039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2916  IS4 transposase  26.27 
 
 		 442 aa  106  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00217078  normal  0.61002 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3707  IS4 ORF  26.48 
 
 		 395 aa  105  2e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000458395  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2863  transposase IS4 family protein  26.91 
 
 		 440 aa  105  2e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4174  IS4 transposase  26.48 
 
 		 448 aa  105  2e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3754  IS4 transposase  26.2 
 
 		 448 aa  105  2e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2324  IS4 transposase  25.87 
 
 		 448 aa  104  3e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000109672  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2394  transposase (IS4 family)  26.48 
 
 		 395 aa  104  4e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.70731  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1691  transposase (IS4 family)  26.18 
 
 		 542 aa  103  6e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0674671  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04140  IS4 predicted transposase  25.92 
 
 		 442 aa  103  7e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3723  transposase IS4 family protein  25.92 
 
 		 442 aa  103  7e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04103  hypothetical protein  25.92 
 
 		 442 aa  103  7e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2212  IS4 transposase  25.83 
 
 		 442 aa  103  7e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0327329  normal  0.418952 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2977  IS4 ORF  26.2 
 
 		 400 aa  103  8e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0325653  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1038  transposase IS4 family protein  25.17 
 
 		 436 aa  103  1e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.158805  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1969  hypothetical protein  36.26 
 
 		 255 aa  102  2e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.820911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3433  transposase IS4 family protein  25.5 
 
 		 449 aa  102  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.168872  normal  0.0300834 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2909  transposase IS4 family protein  25.5 
 
 		 449 aa  102  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.623174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2322  transposase IS4 family protein  25.5 
 
 		 449 aa  102  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3106  transposase IS4 family protein  23.58 
 
 		 451 aa  100  5e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.99267  normal  0.0276245 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6319  transposase IS4 family protein  26.45 
 
 		 420 aa  97.8  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6322  transposase IS4 family protein  26.45 
 
 		 420 aa  97.8  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2762  transposase IS4 family protein  26.45 
 
 		 420 aa  97.4  5e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5533  transposase IS4 family protein  26.45 
 
 		 420 aa  97.4  5e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.541697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2844  transposase  23.29 
 
 		 441 aa  97.1  6e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0290796  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2826  transposase  23.29 
 
 		 441 aa  97.1  6e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2962  transposase  23.29 
 
 		 441 aa  97.1  6e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0283  transposase  23.29 
 
 		 441 aa  97.1  6e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0617  transposase  23.29 
 
 		 435 aa  97.4  6e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.34753  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1184  transposase  23.29 
 
 		 435 aa  97.4  6e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.334864  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1349  transposase  23.29 
 
 		 441 aa  97.1  6e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1776  transposase  23.29 
 
 		 441 aa  97.1  6e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1954  transposase  23.29 
 
 		 441 aa  97.1  6e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2027  transposase  23.29 
 
 		 441 aa  97.1  6e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.28488  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0665  transposase, IS4 family protein  23.88 
 
 		 446 aa  94  5e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1164  transposase, IS4 family protein  23.88 
 
 		 440 aa  94  6e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.417072  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1414  transposase, IS4 family protein  23.88 
 
 		 440 aa  94  6e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4179  transposase, IS4 family protein  23.88 
 
 		 440 aa  94  6e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0206865  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3915  transposase IS4 family protein  23.88 
 
 		 446 aa  94  6e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2417  transposase IS4 family protein  23.88 
 
 		 440 aa  94  6e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.424861  hitchhiker  0.000136578 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3185  transposase IS4 family protein  23.88 
 
 		 440 aa  93.2  8e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.100541 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1671  transposase IS4 family protein  23.88 
 
 		 440 aa  92.8  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000299325  hitchhiker  0.00155503 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2295  transposase IS4 family protein  23.88 
 
 		 440 aa  92.8  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00969572  normal  0.992733 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2940  transposase IS4 family protein  23.88 
 
 		 440 aa  92.8  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.517731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3485  transposase IS4 family protein  23.88 
 
 		 440 aa  92.8  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3031  transposase IS4 family protein  23.88 
 
 		 440 aa  92.8  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0513  transposase, IS4 family protein  24.08 
 
 		 401 aa  91.7  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.150104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2192  transposase, IS4 family protein  24.08 
 
 		 401 aa  91.7  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.922489 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1743  transposase IS4 family protein  24.64 
 
 		 406 aa  91.7  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2660  transposase, IS4 family protein  24.08 
 
 		 401 aa  91.3  4e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.336181  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1093  ISSod7, transposase  23.6 
 
 		 440 aa  90.5  6e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1833  ISSod7, transposase  23.6 
 
 		 440 aa  90.5  6e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3544  ISSod7, transposase  23.6 
 
 		 440 aa  90.5  6e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3808  transposase, IS4 family protein  23.6 
 
 		 440 aa  89.4  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4077  transposase IS4 family protein  23.6 
 
 		 440 aa  89.4  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.775632  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4135  ISSod7, transposase  23.31 
 
 		 440 aa  89  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0724  transposase, IS4 family protein  24.29 
 
 		 378 aa  88.2  3e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3429  transposase IS4 family protein  25.29 
 
 		 421 aa  85.9  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2423  transposase IS4 family protein  25.28 
 
 		 441 aa  84.7  0.000000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1595  transposase IS4 family protein  25.34 
 
 		 441 aa  84.7  0.000000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0140728  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2874  transposase IS4 family protein  25.34 
 
 		 441 aa  84.7  0.000000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0204  transposase IS4 family protein  25.34 
 
 		 441 aa  84.7  0.000000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.960386  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0511  transposase IS4 family protein  25.34 
 
 		 441 aa  84.7  0.000000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4011  transposase IS4 family protein  25.34 
 
 		 441 aa  84.7  0.000000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.875416  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4014  transposase IS4 family protein  25.34 
 
 		 441 aa  84.7  0.000000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2257  transposase IS4 family protein  25.34 
 
 		 441 aa  84.7  0.000000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0990  transposase IS4 family protein  24.76 
 
 		 440 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0133097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6556  transposase IS4 family protein  24.76 
 
 		 440 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00558  transposase  22.48 
 
 		 441 aa  78.6  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00797  hypothetical protein  22.48 
 
 		 441 aa  78.6  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01062  hypothetical protein  22.48 
 
 		 441 aa  78.6  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01118  hypothetical protein  22.48 
 
 		 441 aa  78.6  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01156  hypothetical protein  22.48 
 
 		 441 aa  78.6  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01584  hypothetical protein  22.48 
 
 		 441 aa  78.6  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01746  hypothetical protein  22.48 
 
 		 441 aa  78.6  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03025  hypothetical protein  22.48 
 
 		 441 aa  78.6  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03297  hypothetical protein  22.48 
 
 		 441 aa  78.6  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03531  hypothetical protein  22.48 
 
 		 441 aa  78.6  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04888  hypothetical protein  22.48 
 
 		 441 aa  78.6  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>