More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0484 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_0484  ribosomal protein L16  100 
 
 		 139 aa  281  3.0000000000000004e-75  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0874  50S ribosomal protein L16  59.4 
 
 		 144 aa  174  3e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000946353  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1233  50S ribosomal protein L16  61.65 
 
 		 139 aa  172  9.999999999999999e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000804114 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2910  50S ribosomal protein L16  61.65 
 
 		 145 aa  171  2.9999999999999996e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2453  50S ribosomal protein L16  61.19 
 
 		 144 aa  170  5e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.219362 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3710  50S ribosomal protein L16  60.9 
 
 		 139 aa  166  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1844  50S ribosomal protein L16  58.65 
 
 		 139 aa  166  1e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.242343  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1299  50S ribosomal protein L16  58.65 
 
 		 140 aa  165  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.210849  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0296  50S ribosomal protein L16  57.89 
 
 		 139 aa  165  2e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2704  ribosomal protein L16  60.9 
 
 		 145 aa  164  2.9999999999999998e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.589348  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2566  50S ribosomal protein L16  58.96 
 
 		 141 aa  164  4e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2850  50S ribosomal protein L16  55.64 
 
 		 140 aa  163  6.9999999999999995e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.867321  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2222  50S ribosomal protein L16  56.39 
 
 		 139 aa  162  2.0000000000000002e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000157972  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2707  50S ribosomal protein L16  58.65 
 
 		 144 aa  161  2.0000000000000002e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2392  50S ribosomal protein L16  58.65 
 
 		 144 aa  161  2.0000000000000002e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3321  50S ribosomal protein L16  54.48 
 
 		 140 aa  162  2.0000000000000002e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000147904 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0940  50S ribosomal protein L16  54.48 
 
 		 140 aa  162  2.0000000000000002e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00197835  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0687  50S ribosomal protein L16  55.22 
 
 		 140 aa  161  3e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.129729  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01240  50S ribosomal protein L16  57.89 
 
 		 144 aa  160  4.0000000000000004e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.844455  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1738  50S ribosomal protein L16  55.64 
 
 		 147 aa  160  4.0000000000000004e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000521329  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0698  50S ribosomal protein L16  58.21 
 
 		 142 aa  160  5.0000000000000005e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000251243  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0765  50S ribosomal protein L16  57.14 
 
 		 145 aa  160  5.0000000000000005e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000894235  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3005  50S ribosomal protein L16  57.14 
 
 		 137 aa  160  5.0000000000000005e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.840277  hitchhiker  0.00634453 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2326  50S ribosomal protein L16  55.64 
 
 		 144 aa  160  5.0000000000000005e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000195214  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2057  50S ribosomal protein L16  56.39 
 
 		 139 aa  160  5.0000000000000005e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00129703  normal  0.24244 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0114  50S ribosomal protein L16  59.4 
 
 		 141 aa  160  7e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0405  ribosomal protein L16  58.65 
 
 		 145 aa  160  8.000000000000001e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0633  50S ribosomal protein L16  55.64 
 
 		 140 aa  159  9e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000966771  hitchhiker  0.00000000446584 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0429  50S ribosomal protein L16  55.64 
 
 		 145 aa  159  9e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0009964  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0188  50S ribosomal protein L16  56.39 
 
 		 139 aa  159  2e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000404592  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0118  50S ribosomal protein L16  57.89 
 
 		 144 aa  158  2e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0312557  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1353  50S ribosomal protein L16  54.89 
 
 		 140 aa  158  2e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.298146  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0849  ribosomal protein L16  55.64 
 
 		 144 aa  157  3e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1622  ribosomal protein L16  56.39 
 
 		 139 aa  158  3e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2289  50S ribosomal protein L16  55.64 
 
 		 139 aa  157  5e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000386576  hitchhiker  0.00295844 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2416  50S ribosomal protein L16  55.64 
 
 		 139 aa  157  6e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000559542  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0201  50S ribosomal protein L16  55.64 
 
 		 144 aa  157  7e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.126239  normal  0.143837 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1517  ribosomal protein L16  56.39 
 
 		 151 aa  155  1e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.592014  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1860  50S ribosomal protein L16  52.59 
 
 		 141 aa  155  1e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0761083  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0117  50S ribosomal protein L16  57.14 
 
 		 144 aa  155  2e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000995896  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0148  50S ribosomal protein L16  57.14 
 
 		 144 aa  155  2e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000139217  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0111  50S ribosomal protein L16  56.39 
 
 		 144 aa  155  2e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000578104  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0245  50S ribosomal protein L16  56.49 
 
 		 139 aa  155  2e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1074  50S ribosomal protein L16  52.63 
 
 		 140 aa  155  2e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000319005  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0242  50S ribosomal protein L16  56.49 
 
 		 139 aa  155  2e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1299  50S ribosomal protein L16  57.14 
 
 		 142 aa  154  3e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000108479  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0117  50S ribosomal protein L16  56.39 
 
 		 144 aa  154  3e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000580753  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0113  50S ribosomal protein L16  56.39 
 
 		 144 aa  154  3e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  4.719700000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0111  50S ribosomal protein L16  56.39 
 
 		 144 aa  154  3e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000723278  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0296  50S ribosomal protein L16  57.78 
 
 		 140 aa  154  3e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.980889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1387  50S ribosomal protein L16  57.14 
 
 		 142 aa  154  3e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000734854  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0117  50S ribosomal protein L16  56.39 
 
 		 144 aa  154  3e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000167847  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5188  50S ribosomal protein L16  56.39 
 
 		 144 aa  154  3e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000330931  unclonable  1.07151e-25 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23091  50S ribosomal protein L16  56.72 
 
 		 158 aa  154  3e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0112  50S ribosomal protein L16  56.39 
 
 		 144 aa  154  3e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000501448  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0138  50S ribosomal protein L16  56.39 
 
 		 144 aa  154  3e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000009071  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0129  50S ribosomal protein L16  56.39 
 
 		 144 aa  154  3e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.87351e-62 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3017  50S ribosomal protein L16  56.39 
 
 		 151 aa  154  4e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00890597  hitchhiker  0.0081871 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1567  50S ribosomal protein L16  51.13 
 
 		 142 aa  153  9e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00199901  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2225  50S ribosomal protein L16  55.22 
 
 		 142 aa  152  1e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.877159  normal  0.84916 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3998  ribosomal protein L16  53.38 
 
 		 138 aa  152  1e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.377378  normal  0.869429 
 
 
-
 
NC_002620  TC0808  50S ribosomal protein L16  53.28 
 
 		 138 aa  152  2e-36  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0752891  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0284  50S ribosomal protein L16  56.49 
 
 		 138 aa  151  2e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00023435  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0293  50S ribosomal protein L16  57.89 
 
 		 143 aa  152  2e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00638417  normal  0.0397052 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1178  50S ribosomal protein L16  57.14 
 
 		 141 aa  151  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.371003  normal  0.169961 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4019  50S ribosomal protein L16  56.39 
 
 		 141 aa  151  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.261659  hitchhiker  0.00000510081 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2680  50S ribosomal protein L16  52.63 
 
 		 138 aa  151  2.9999999999999998e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3660  50S ribosomal protein L16  52.63 
 
 		 145 aa  151  2.9999999999999998e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000506256  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0222  50S ribosomal protein L16  55.22 
 
 		 144 aa  150  4e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000752115  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2148  50S ribosomal protein L16  55.64 
 
 		 138 aa  150  5e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0586575  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2968  50S ribosomal protein L16  51.88 
 
 		 138 aa  150  7e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.306381  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1868  50S ribosomal protein L16  51.88 
 
 		 141 aa  150  8e-36  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2074  50S ribosomal protein L16  51.88 
 
 		 141 aa  150  8e-36  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0136024  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1697  50S ribosomal protein L16  51.88 
 
 		 141 aa  150  8e-36  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000686182  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0066  50S ribosomal protein L16  51.13 
 
 		 141 aa  149  1e-35  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0038879  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17090  50S ribosomal protein L16  50.38 
 
 		 138 aa  149  1e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00239118  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1562  50S ribosomal protein L16  54.14 
 
 		 138 aa  149  1e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16711  50S ribosomal protein L16  54.14 
 
 		 179 aa  149  1e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1961  ribosomal protein L16  51.88 
 
 		 141 aa  149  1e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.564853  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0988  50S ribosomal protein L16  56.3 
 
 		 139 aa  148  2e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.702357  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0609  ribosomal protein L16  54.89 
 
 		 140 aa  149  2e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.817649 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0960  50S ribosomal protein L16  54.14 
 
 		 142 aa  149  2e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000390826  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0458  50S ribosomal protein L16  54.74 
 
 		 149 aa  147  4e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100115  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0722  ribosomal protein L16  55.97 
 
 		 144 aa  147  5e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0708  50S ribosomal protein L16  51.88 
 
 		 141 aa  147  5e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000940858  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2612  50S ribosomal protein L16  51.49 
 
 		 141 aa  147  6e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000705593  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1843  ribosomal protein L16  49.62 
 
 		 137 aa  147  7e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000707867  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2171  ribosomal protein L16  52.63 
 
 		 140 aa  146  8e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.501834  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0481  50S ribosomal protein L16  54.07 
 
 		 149 aa  146  9e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.663076  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0715  50S ribosomal protein L16  54.14 
 
 		 137 aa  146  1.0000000000000001e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.77301  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0569  50S ribosomal protein L16  50.37 
 
 		 139 aa  146  1.0000000000000001e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1962  50S ribosomal protein L16  54.14 
 
 		 158 aa  145  1.0000000000000001e-34  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1131  50S ribosomal protein L16  53.38 
 
 		 142 aa  145  1.0000000000000001e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000508747  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1918  50S ribosomal protein L16  51.13 
 
 		 138 aa  145  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.573905 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1122  50S ribosomal protein L16  52.24 
 
 		 161 aa  145  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0369  50S ribosomal protein L16  54.14 
 
 		 158 aa  145  2.0000000000000003e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2250  50S ribosomal protein L16  52.63 
 
 		 137 aa  145  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000631878  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0293  50S ribosomal protein L16  50.38 
 
 		 141 aa  145  2.0000000000000003e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0021896  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1939  50S ribosomal protein L16  51.13 
 
 		 138 aa  145  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19961  50S ribosomal protein L16  52.24 
 
 		 161 aa  145  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.64825  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>