More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3100 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_3100  hexapaptide repeat-containing transferase  100 
 
 
189 aa  386  1e-107  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.568306  normal  0.389321 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1601  hexapaptide repeat-containing transferase  51.7 
 
 
193 aa  185  3e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3452  hypothetical protein  40.99 
 
 
174 aa  131  6.999999999999999e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1693  hexapaptide repeat-containing transferase  41.33 
 
 
176 aa  128  4.0000000000000003e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.529544  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3188  hexapaptide repeat-containing transferase  41.4 
 
 
174 aa  127  1.0000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.798925  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2139  hexapaptide repeat-containing transferase  41.21 
 
 
176 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.328816  normal  0.883722 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1242  hypothetical protein  48.85 
 
 
174 aa  126  2.0000000000000002e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3284  hexapaptide repeat-containing transferase  41.21 
 
 
176 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.619416  normal  0.0269804 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1635  transferase hexapeptide repeat containing protein  38.65 
 
 
177 aa  125  5e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0076  transferase hexapeptide repeat containing protein  40.26 
 
 
175 aa  124  6e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.186497 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1265  hexapaptide repeat-containing transferase  39.04 
 
 
173 aa  124  8.000000000000001e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.301445  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1178  hexapaptide repeat-containing transferase  36.42 
 
 
174 aa  122  3e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.928764  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1073  hexapaptide repeat-containing transferase  37.82 
 
 
176 aa  122  4e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.099583  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0993  transferase hexapeptide protein  38.22 
 
 
174 aa  121  5e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1211  hexapeptide transferase family protein  42.48 
 
 
192 aa  119  1.9999999999999998e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.534657 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3324  hexapeptide transferase family protein  42.22 
 
 
186 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1604  hexapaptide repeat-containing transferase  43.61 
 
 
175 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0624  carbonic anhydrase  40.79 
 
 
171 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000010495  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1933  ferripyochelin-binding protein  36.84 
 
 
175 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2575  carbonic anhydrase  37.18 
 
 
176 aa  118  3.9999999999999996e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2190  hypothetical protein  38.75 
 
 
181 aa  118  4.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0134235  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0908  transferase hexapeptide protein  37.58 
 
 
174 aa  117  7.999999999999999e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3520  carbonic anhydrase/acetyltransferase isoleucine patch superfamily-like protein  42.96 
 
 
177 aa  117  7.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0123178  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0197  transferase hexapeptide protein  41.4 
 
 
173 aa  117  7.999999999999999e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.876343  normal  0.740105 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3912  hypothetical protein  36.36 
 
 
176 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1069  hypothetical protein  39.33 
 
 
173 aa  117  9.999999999999999e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0598  hexapaptide repeat-containing transferase  36.71 
 
 
171 aa  117  9.999999999999999e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.815519  hitchhiker  0.000000000000309138 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0961  ferripyochelin binding protein  38.92 
 
 
170 aa  117  9.999999999999999e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0020  hexapeptide transferase family protein  41.48 
 
 
179 aa  116  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0945686  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3589  carbonic anhydrase/acetyltransferase isoleucine patch superfamily-like protein  42.22 
 
 
177 aa  116  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0041  carbonic anhydrase/acetyltransferase, isoleucine patch superfamily  37.18 
 
 
167 aa  116  1.9999999999999998e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000415248  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3140  hypothetical protein  37.35 
 
 
176 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.735648  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3545  hexapaptide repeat-containing transferase  40 
 
 
177 aa  115  3e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000167215  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3654  hexapaptide repeat-containing transferase  39.1 
 
 
177 aa  115  3e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.443395  normal  0.158158 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0468  hexapaptide repeat-containing transferase  36.81 
 
 
177 aa  115  5e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0252468 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1852  hexapaptide repeat-containing transferase  39.1 
 
 
174 aa  115  5e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0198  carbonic anhydrase  38.51 
 
 
177 aa  115  5e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000371733  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0773  hexapaptide repeat-containing transferase  41.1 
 
 
178 aa  114  6e-25  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0167469  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2707  acetyltransferase protein  33.76 
 
 
176 aa  114  6e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1318  hexapaptide repeat-containing transferase  36.71 
 
 
174 aa  114  6.9999999999999995e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1260  ferripyochelin-binding protein, putative  36.18 
 
 
175 aa  113  1.0000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0164066  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6221  hexapaptide repeat-containing transferase  35.03 
 
 
173 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.954264  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1221  putative ferripyochelin-binding protein  36.18 
 
 
175 aa  113  1.0000000000000001e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2042  hexapaptide repeat-containing transferase  39.73 
 
 
175 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0768  ferripyochelin binding protein (fbp)  38.97 
 
 
178 aa  112  3e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01995  Carbonic anhydrases/acetyltransferase, isoleucine patch superfamily protein  40.27 
 
 
174 aa  112  3e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000189812  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5112  hexapaptide repeat-containing transferase  34.39 
 
 
174 aa  112  4.0000000000000004e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.846878 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18170  isoleucine patch superfamily enzyme, carbonic anhydrase/acetyltransferase  38.06 
 
 
177 aa  112  4.0000000000000004e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.814927 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2224  transferase family protein  40.15 
 
 
173 aa  111  5e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.076272  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1618  carbonic anhydrase  40.65 
 
 
172 aa  112  5e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0648  ferripyochelin binding protein (fbp)  34.39 
 
 
168 aa  111  6e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4925  hexapaptide repeat-containing transferase  36.94 
 
 
174 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0228  hexapaptide repeat-containing transferase  37.11 
 
 
182 aa  110  9e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0365  hexapaptide repeat-containing transferase  37.66 
 
 
174 aa  110  9e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.50082  normal  0.18639 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0478  anhydrase family 3 protein  37.67 
 
 
170 aa  110  9e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000849084  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3392  anhydrase family 3 protein  37.58 
 
 
174 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0885475  normal  0.295245 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1011  hexapaptide repeat-containing transferase  36.84 
 
 
174 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.335767 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2918  ferripyochelin binding protein  36.94 
 
 
172 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0861  transferase hexapeptide repeat protein  36.92 
 
 
173 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1579  hexapaptide repeat-containing transferase  40.3 
 
 
175 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3074  transferase hexapeptide repeat containing protein  32.34 
 
 
181 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1562  ferripyochelin binding protein  36.94 
 
 
172 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.190855  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1347  ferripyochelin binding protein  38.27 
 
 
169 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1164  hexapaptide repeat-containing transferase  37.01 
 
 
174 aa  109  2.0000000000000002e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0108  ferripyochelin binding protein (fbp)  36.24 
 
 
168 aa  110  2.0000000000000002e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000224981 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0817  transferase  37.97 
 
 
178 aa  109  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0247749 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1447  hexapaptide repeat-containing transferase  41.61 
 
 
183 aa  110  2.0000000000000002e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00240912  normal  0.115132 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2083  putative acetyltransferase  35.22 
 
 
180 aa  108  3e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.185371  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1727  ferripyochelin binding protein-like  34.94 
 
 
177 aa  108  3e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2377  transferase hexapeptide repeat containing protein  34.44 
 
 
176 aa  109  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.191386 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2561  hexapaptide repeat-containing transferase  37.58 
 
 
174 aa  108  3e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.298703  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2172  carbonic anhydrase  35.15 
 
 
176 aa  108  4.0000000000000004e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.441175  normal  0.697548 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6251  hexapaptide repeat-containing transferase  34.71 
 
 
194 aa  108  5e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1064  carbonic anhydrase  41.09 
 
 
162 aa  108  5e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1691  carbonic anhydrase  33.14 
 
 
214 aa  108  5e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0280  hexapaptide repeat-containing transferase  35.98 
 
 
182 aa  108  6e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.801626  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2013  hexapaptide repeat-containing transferase  37.5 
 
 
174 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.858963  hitchhiker  0.00330641 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1556  transferase hexapeptide repeat containing protein  42.06 
 
 
173 aa  107  7.000000000000001e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0426  Carbonic anhydrase/acetyltransferase isoleucine patch superfamily-like protein  39.61 
 
 
176 aa  108  7.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2140  hexapaptide repeat-containing transferase  37.5 
 
 
174 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0023  hypothetical protein  38.78 
 
 
171 aa  107  8.000000000000001e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.727004  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1520  hexapaptide repeat-containing transferase  43.33 
 
 
175 aa  107  9.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.000102664  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1720  hexapaptide repeat-containing transferase  34.23 
 
 
174 aa  107  9.000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.803923  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0254  hexapaptide repeat-containing transferase  35.98 
 
 
182 aa  107  9.000000000000001e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.836815  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1854  hypothetical protein  39.84 
 
 
175 aa  107  1e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0466742  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1678  carbonic anhydrase  40.77 
 
 
172 aa  107  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2480  putative acetyltransferase  36.71 
 
 
178 aa  106  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00330566  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1133  hypothetical protein  33.54 
 
 
175 aa  106  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1516  transferase hexapeptide repeat protein  43.09 
 
 
175 aa  106  2e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.159482  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1171  hexapaptide repeat-containing transferase  36.11 
 
 
174 aa  106  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.940435  hitchhiker  0.000000671897 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2653  transferase hexapeptide protein  32.26 
 
 
174 aa  106  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1530  gamma-class carbonic anhydrase family protein  33.33 
 
 
174 aa  106  2e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.256343 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3189  hexapaptide repeat-containing transferase  32.94 
 
 
175 aa  106  2e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.876706  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1611  transferase hexapeptide repeat protein  43.09 
 
 
175 aa  106  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0836  carbonic anhydrase  38.26 
 
 
178 aa  106  2e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.871401 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1095  hexapaptide repeat-containing transferase  35.71 
 
 
174 aa  105  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1365  hypothetical protein  36.84 
 
 
174 aa  105  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.849179  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2353  hexapaptide repeat-containing transferase  42.28 
 
 
175 aa  105  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5974  hexapaptide repeat-containing transferase  39.2 
 
 
174 aa  105  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2103  hexapaptide repeat-containing transferase  39.2 
 
 
174 aa  105  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>