237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_3580 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_3580  MotA/TolQ/ExbB proton channel  100 
 
 
287 aa  582  1.0000000000000001e-165  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04950  flagellar motor protein MotA  42.25 
 
 
285 aa  251  7e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0192  flagellar motor protein MotA  42.81 
 
 
290 aa  250  1e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3351  flagellar motor protein MotA  41.2 
 
 
287 aa  246  3e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.879292  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0056  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.25 
 
 
285 aa  246  4e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0283  flagellar motor protein MotA  40.85 
 
 
287 aa  246  4e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0606654  normal  0.545308 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001166  Flagellar motor rotation protein MotA  43.23 
 
 
267 aa  236  3e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3632  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.93 
 
 
285 aa  229  6e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.189643  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0050  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.57 
 
 
285 aa  228  1e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0153  flagellar motor protein MotA  40.36 
 
 
283 aa  226  2e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0201  flagellar motor protein MotA  40.36 
 
 
283 aa  226  3e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.616798  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3448  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.72 
 
 
285 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.894431  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4665  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.33 
 
 
290 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0724721 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0201  flagellar motor protein MotA  43.66 
 
 
288 aa  215  8e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.11554 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0661  flagellar motor protein MotA  42.96 
 
 
288 aa  214  9.999999999999999e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2779  flagellar motor component  37.09 
 
 
283 aa  202  5e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0730  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.03 
 
 
201 aa  192  5e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0235  flagellar motor protein MotA  34.15 
 
 
286 aa  185  8e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3355  flagellar motor protein MotA  34.15 
 
 
286 aa  185  8e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.428227 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2854  flagellar motor protein MotA  34.15 
 
 
286 aa  185  8e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0253  flagellar motor protein MotA  34.15 
 
 
286 aa  185  8e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.203265  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0162  flagellar motor protein MotA  34.15 
 
 
286 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.968285 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2862  flagellar motor protein MotA  34.15 
 
 
286 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0080  flagellar motor protein MotA  34.15 
 
 
286 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3185  flagellar motor protein MotA  34.51 
 
 
286 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0552503  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3438  flagellar motor protein MotA  34.15 
 
 
286 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1681  flagellar motor protein MotA  34.15 
 
 
286 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.279788  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3858  flagellar motor protein MotA  34.15 
 
 
286 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3939  flagellar motor protein MotA  34.15 
 
 
286 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3113  flagellar motor protein MotA  34.15 
 
 
286 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0179  flagellar motor protein MotA  33.8 
 
 
286 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0166  flagellar motor protein MotA  33.8 
 
 
286 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2977  flagellar motor protein MotA  33.45 
 
 
286 aa  181  1e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000883737 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3818  flagellar motor protein MotA  33.1 
 
 
286 aa  180  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0116  flagellar motor protein MotA  33.1 
 
 
286 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0624  flagellar motor protein MotA  33.93 
 
 
283 aa  179  4e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.895123 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1148  lateral flagellar motor protein MotA  35 
 
 
301 aa  179  4e-44  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1636  flagellar motor protein MotA  32.75 
 
 
295 aa  179  5.999999999999999e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0578  putative chemotaxis (motility protein A) transmembrane  33.69 
 
 
283 aa  179  5.999999999999999e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0679661 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1747  flagellar motor protein MotA  32.75 
 
 
295 aa  179  5.999999999999999e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0835896  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2084  flagellar motor protein MotA  33.8 
 
 
295 aa  178  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.039228  unclonable  3.0299e-30 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2139  flagellar motor protein MotA  33.8 
 
 
295 aa  178  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00816419  hitchhiker  5.2257999999999995e-28 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1198  flagellar motor protein MotA  33.8 
 
 
295 aa  178  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000125742  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2079  flagellar motor protein MotA  33.8 
 
 
295 aa  178  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000367916  decreased coverage  0.000000495633 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1977  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.45 
 
 
287 aa  177  1e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.126006  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1321  flagellar motor protein MotA  33.8 
 
 
295 aa  178  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.142338  decreased coverage  5.03142e-27 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01861  flagellar motor protein MotA  33.8 
 
 
295 aa  177  2e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00919512  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1750  flagellar motor protein MotA  33.8 
 
 
295 aa  177  2e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00519867  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2123  flagellar motor protein MotA  33.8 
 
 
295 aa  177  2e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000217676  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1986  flagellar motor protein MotA  33.8 
 
 
295 aa  177  2e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000224268  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01850  hypothetical protein  33.8 
 
 
295 aa  177  2e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.021393  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1294  flagellar motor protein MotA  33.8 
 
 
295 aa  177  2e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000681717  decreased coverage  0.00000000786895 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1742  flagellar motor protein MotA  33.8 
 
 
295 aa  177  2e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.11312  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2827  flagellar motor protein MotA  32.4 
 
 
295 aa  176  4e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.127647 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2629  flagellar motor protein MotA  33.45 
 
 
295 aa  176  4e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000190208  hitchhiker  0.000000000000740297 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1505  putative chemotaxis (motility protein A) transmembrane  31.87 
 
 
285 aa  175  9.999999999999999e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.302447  normal  0.757023 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1411  flagellar motor protein MotA  32.48 
 
 
286 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.425205 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2918  flagellar motor protein MotA  34.17 
 
 
287 aa  172  3.9999999999999995e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4157  flagellar motor protein MotA  31.64 
 
 
286 aa  171  1e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.234806  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4045  flagellar motor protein MotA  31.64 
 
 
286 aa  171  1e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.579307  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3481  chemotaxis protein  32.62 
 
 
301 aa  171  2e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0252598  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2987  flagellar motor protein MotA  32.98 
 
 
298 aa  171  2e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1538  flagellar motor protein MotA  31.01 
 
 
295 aa  170  3e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00177397  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1853  flagellar motor protein MotA  31.71 
 
 
295 aa  170  3e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00504562  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0227  putative chemotaxis (motility protein A) transmembrane  30.11 
 
 
290 aa  170  3e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.450881  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2613  flagellar motor protein MotA  31.36 
 
 
295 aa  169  4e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0144418  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2887  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.58 
 
 
312 aa  169  4e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000634442 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3815  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.57 
 
 
286 aa  169  6e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4217  flagellar motor protein MotA  32.61 
 
 
290 aa  168  1e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.299726  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65450  flagellar motor protein MotA  30.36 
 
 
283 aa  168  1e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.927396  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5683  flagellar motor protein MotA  30.36 
 
 
283 aa  167  2e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2026  chemotaxis MotA protein  32.26 
 
 
293 aa  167  2e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00259722  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0654  chemotaxis MotA protein  33.33 
 
 
291 aa  167  2e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.112592 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0643  chemotaxis MotA protein  33.33 
 
 
291 aa  167  2e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.385067 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4205  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.33 
 
 
289 aa  167  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1243  flagellar motor protein MotA  32.26 
 
 
286 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3088  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.86 
 
 
286 aa  166  2.9999999999999998e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2468  flagellar motor protein MotA  34.49 
 
 
295 aa  166  4e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000801949  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2804  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.09 
 
 
296 aa  166  4e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.920347 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0622  chemotaxis MotA protein  33.33 
 
 
291 aa  166  5e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2641  flagellar motor component  35.71 
 
 
284 aa  165  6.9999999999999995e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.300205  hitchhiker  0.0000105245 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0642  flagellar motor protein MotA  31.18 
 
 
281 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.509529  normal  0.576594 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1900  flagellar motor protein MotA  33.57 
 
 
286 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.139415  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2790  flagellar motor component-like  33.33 
 
 
289 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.995037  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24320  Fagellar motor protein  32.48 
 
 
291 aa  164  2.0000000000000002e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0303  flagellar motor protein MotA  34.51 
 
 
295 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.935988  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1510  flagellar motor protein MotA  29.62 
 
 
295 aa  163  3e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0122942  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0604  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.25 
 
 
286 aa  162  5.0000000000000005e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2179  flagellar motor protein MotA  33.33 
 
 
282 aa  162  6e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1085  flagellar motor protein MotA  34.41 
 
 
281 aa  162  8.000000000000001e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0126  flagellar motor protein MotA  32.61 
 
 
290 aa  161  9e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0117  flagellar motor protein MotA  32.61 
 
 
339 aa  161  1e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.417064  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4905  flagellar motor protein MotA  30.36 
 
 
283 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1940  flagellar motor protein MotA  31.45 
 
 
286 aa  161  2e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3687  chemotaxis protein MotA  33.33 
 
 
299 aa  160  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.366746  normal  0.0257375 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4781  flagellar motor protein MotA  30.36 
 
 
283 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1260  flagellar motor protein MotA  34.43 
 
 
287 aa  160  3e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0894303  normal  0.516828 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2951  flagellar motor protein MotA  32 
 
 
289 aa  160  3e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.777037  normal  0.113727 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1307  chemotaxis (motility protein A) transmembrane  31.65 
 
 
286 aa  159  4e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4958  flagellar motor protein MotA  30 
 
 
283 aa  159  5e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.915585 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>