216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_0730 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A0201  flagellar motor protein MotA  100 
 
 		 288 aa  410  1e-114  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.11554 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0730  MotA/TolQ/ExbB proton channel  100 
 
 		 201 aa  410  1e-114  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0661  flagellar motor protein MotA  98.51 
 
 		 288 aa  408  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0283  flagellar motor protein MotA  71.07 
 
 		 287 aa  299  1e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0606654  normal  0.545308 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3351  flagellar motor protein MotA  70.56 
 
 		 287 aa  299  2e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.879292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0192  flagellar motor protein MotA  65.46 
 
 		 290 aa  267  7e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001166  Flagellar motor rotation protein MotA  62.77 
 
 		 267 aa  253  2.0000000000000002e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04950  flagellar motor protein MotA  60.64 
 
 		 285 aa  248  4e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0153  flagellar motor protein MotA  57.81 
 
 		 283 aa  246  2e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0201  flagellar motor protein MotA  57.81 
 
 		 283 aa  245  3e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.616798  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3448  MotA/TolQ/ExbB proton channel  51.3 
 
 		 285 aa  222  3e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.894431  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4665  MotA/TolQ/ExbB proton channel  54.69 
 
 		 290 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0724721 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0056  MotA/TolQ/ExbB proton channel  52.13 
 
 		 285 aa  217  7.999999999999999e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0050  MotA/TolQ/ExbB proton channel  51.56 
 
 		 285 aa  216  2e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3632  MotA/TolQ/ExbB proton channel  50.52 
 
 		 285 aa  216  2e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.189643  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3580  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.03 
 
 		 287 aa  192  2e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5683  flagellar motor protein MotA  43.16 
 
 		 283 aa  165  5e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65450  flagellar motor protein MotA  43.16 
 
 		 283 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.927396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2779  flagellar motor component  40.21 
 
 		 283 aa  159  3e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4905  flagellar motor protein MotA  41.58 
 
 		 283 aa  158  5e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4781  flagellar motor protein MotA  41.58 
 
 		 283 aa  158  5e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2641  flagellar motor component  38.42 
 
 		 284 aa  158  6e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.300205  hitchhiker  0.0000105245 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4697  flagellar motor protein MotA  41.58 
 
 		 283 aa  157  1e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4958  flagellar motor protein MotA  41.05 
 
 		 283 aa  156  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.915585 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3818  flagellar motor protein MotA  37.17 
 
 		 286 aa  155  3e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0116  flagellar motor protein MotA  37.17 
 
 		 286 aa  155  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1322  putative chemotaxis (motility protein A) transmembrane  40.21 
 
 		 285 aa  155  3e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.229907  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3185  flagellar motor protein MotA  37.7 
 
 		 286 aa  154  9e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0552503  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0512  flagellar motor protein MotA  40 
 
 		 283 aa  154  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.738855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0578  putative chemotaxis (motility protein A) transmembrane  40.74 
 
 		 283 aa  154  1e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0679661 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2862  flagellar motor protein MotA  37.17 
 
 		 286 aa  153  2e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0080  flagellar motor protein MotA  37.17 
 
 		 286 aa  153  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0162  flagellar motor protein MotA  37.17 
 
 		 286 aa  153  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.968285 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2977  flagellar motor protein MotA  36.65 
 
 		 286 aa  152  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000883737 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3438  flagellar motor protein MotA  37.17 
 
 		 286 aa  153  2e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1681  flagellar motor protein MotA  37.17 
 
 		 286 aa  153  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.279788  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3858  flagellar motor protein MotA  37.17 
 
 		 286 aa  153  2e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3939  flagellar motor protein MotA  37.17 
 
 		 286 aa  153  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3113  flagellar motor protein MotA  37.17 
 
 		 286 aa  153  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0624  flagellar motor protein MotA  40.86 
 
 		 283 aa  153  2e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.895123 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0235  flagellar motor protein MotA  36.65 
 
 		 286 aa  152  4e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2854  flagellar motor protein MotA  36.65 
 
 		 286 aa  152  4e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0253  flagellar motor protein MotA  36.65 
 
 		 286 aa  152  4e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.203265  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3355  flagellar motor protein MotA  36.65 
 
 		 286 aa  151  5e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.428227 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0179  flagellar motor protein MotA  36.65 
 
 		 286 aa  151  5.9999999999999996e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0166  flagellar motor protein MotA  36.65 
 
 		 286 aa  151  5.9999999999999996e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3687  chemotaxis protein MotA  35.08 
 
 		 299 aa  150  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.366746  normal  0.0257375 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4953  chemotaxis motA protein  38.42 
 
 		 283 aa  148  4e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0561  flagellar motor protein MotA  38.42 
 
 		 283 aa  148  4e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0867  flagellar motor protein MotA  36.92 
 
 		 289 aa  148  6e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.177785 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1411  flagellar motor protein MotA  37.11 
 
 		 286 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.425205 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5606  chemotaxis MotA protein  35.6 
 
 		 287 aa  146  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.50598  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4045  flagellar motor protein MotA  37.11 
 
 		 286 aa  146  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.579307  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4157  flagellar motor protein MotA  37.11 
 
 		 286 aa  146  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.234806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1243  flagellar motor protein MotA  34.74 
 
 		 286 aa  145  3e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3702  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.92 
 
 		 270 aa  145  3e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2238  flagellar motor protein MotA  35.2 
 
 		 301 aa  145  4.0000000000000006e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2266  flagellar motor protein MotA  35.2 
 
 		 301 aa  145  5e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1510  flagellar motor protein MotA  34.03 
 
 		 295 aa  144  8.000000000000001e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0122942  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1538  flagellar motor protein MotA  33.51 
 
 		 295 aa  144  9e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00177397  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0604  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.92 
 
 		 286 aa  143  1e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1853  flagellar motor protein MotA  33.51 
 
 		 295 aa  143  2e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00504562  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1505  putative chemotaxis (motility protein A) transmembrane  36.7 
 
 		 285 aa  142  3e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.302447  normal  0.757023 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4158  chemotaxis MotA protein  34.03 
 
 		 286 aa  142  4e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2613  flagellar motor protein MotA  34.03 
 
 		 295 aa  142  5e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0144418  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2987  flagellar motor protein MotA  34.03 
 
 		 298 aa  141  6e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4205  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.86 
 
 		 289 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1307  chemotaxis (motility protein A) transmembrane  35.05 
 
 		 286 aa  140  9.999999999999999e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1940  flagellar motor protein MotA  35.6 
 
 		 286 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2827  flagellar motor protein MotA  33.51 
 
 		 295 aa  139  1.9999999999999998e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.127647 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1636  flagellar motor protein MotA  33.51 
 
 		 295 aa  139  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1747  flagellar motor protein MotA  33.51 
 
 		 295 aa  139  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0835896  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3815  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.33 
 
 		 286 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2790  flagellar motor component-like  34.39 
 
 		 289 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.995037  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3088  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.33 
 
 		 286 aa  138  3.9999999999999997e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03068  flagellar motor protein MotA  41.36 
 
 		 284 aa  138  4.999999999999999e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2519  flagellar motor protein MotA  34.03 
 
 		 290 aa  138  4.999999999999999e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1035  flagellar motor protein MotA  32.63 
 
 		 283 aa  137  1e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1198  flagellar motor protein MotA  34.39 
 
 		 295 aa  136  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000125742  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5982  flagellar motor component-like protein  33.33 
 
 		 289 aa  136  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.186422  normal  0.583801 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2084  flagellar motor protein MotA  34.39 
 
 		 295 aa  136  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.039228  unclonable  3.0299e-30 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1321  flagellar motor protein MotA  34.39 
 
 		 295 aa  136  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.142338  decreased coverage  5.03142e-27 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2139  flagellar motor protein MotA  34.39 
 
 		 295 aa  136  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00816419  hitchhiker  5.2257999999999995e-28 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2079  flagellar motor protein MotA  34.39 
 
 		 295 aa  136  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000367916  decreased coverage  0.000000495633 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0439  flagellar motor protein MotA  40.31 
 
 		 284 aa  135  4e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2468  flagellar motor protein MotA  33.86 
 
 		 295 aa  135  4e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000801949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2123  flagellar motor protein MotA  34.39 
 
 		 295 aa  135  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000217676  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1294  flagellar motor protein MotA  34.39 
 
 		 295 aa  135  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000681717  decreased coverage  0.00000000786895 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1001  chemotaxis signal transduction protein CheY  35.79 
 
 		 285 aa  135  6.0000000000000005e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01861  flagellar motor protein MotA  34.39 
 
 		 295 aa  134  7.000000000000001e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00919512  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1750  flagellar motor protein MotA  34.39 
 
 		 295 aa  134  7.000000000000001e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00519867  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1986  flagellar motor protein MotA  34.39 
 
 		 295 aa  134  7.000000000000001e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000224268  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01850  hypothetical protein  34.39 
 
 		 295 aa  134  7.000000000000001e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.021393  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1742  flagellar motor protein MotA  34.39 
 
 		 295 aa  134  7.000000000000001e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.11312  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2629  flagellar motor protein MotA  33.86 
 
 		 295 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000190208  hitchhiker  0.000000000000740297 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2951  flagellar motor protein MotA  35.11 
 
 		 289 aa  133  9.999999999999999e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.777037  normal  0.113727 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2872  chemotaxis signal transduction protein CheY  33.86 
 
 		 286 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2026  chemotaxis MotA protein  31.58 
 
 		 293 aa  133  1.9999999999999998e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00259722  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0227  putative chemotaxis (motility protein A) transmembrane  34.39 
 
 		 290 aa  133  1.9999999999999998e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.450881  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2749  flagellar motor protein MotA  35.83 
 
 		 289 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.794955  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>