268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1085 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_1085  flagellar motor protein MotA  100 
 
 
281 aa  563  1.0000000000000001e-159  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0642  flagellar motor protein MotA  78.21 
 
 
281 aa  457  1e-127  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.509529  normal  0.576594 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2179  flagellar motor protein MotA  66.9 
 
 
282 aa  394  1e-108  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3481  chemotaxis protein  43.42 
 
 
301 aa  249  3e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0252598  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2779  flagellar motor component  41.55 
 
 
283 aa  234  1.0000000000000001e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0578  putative chemotaxis (motility protein A) transmembrane  40.5 
 
 
283 aa  231  1e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0679661 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1505  putative chemotaxis (motility protein A) transmembrane  40.21 
 
 
285 aa  229  3e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.302447  normal  0.757023 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1322  putative chemotaxis (motility protein A) transmembrane  42.35 
 
 
285 aa  227  2e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.229907  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1411  flagellar motor protein MotA  40.93 
 
 
286 aa  224  1e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.425205 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1307  chemotaxis (motility protein A) transmembrane  41.49 
 
 
286 aa  223  2e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1243  flagellar motor protein MotA  42.05 
 
 
286 aa  223  3e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4045  flagellar motor protein MotA  41.28 
 
 
286 aa  223  4e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.579307  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4157  flagellar motor protein MotA  41.28 
 
 
286 aa  223  4e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.234806  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1842  motA, chemotaxis (motility protein A  44.07 
 
 
285 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.968305  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2641  flagellar motor component  43.26 
 
 
284 aa  219  3.9999999999999997e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.300205  hitchhiker  0.0000105245 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1940  flagellar motor protein MotA  42.05 
 
 
286 aa  218  7e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1977  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.28 
 
 
287 aa  218  1e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.126006  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5683  flagellar motor protein MotA  40.64 
 
 
283 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65450  flagellar motor protein MotA  39.93 
 
 
283 aa  215  7e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.927396  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3227  flagellar motor protein MotA  41.34 
 
 
284 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0658571  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4697  flagellar motor protein MotA  41.55 
 
 
283 aa  211  7e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2613  flagellar motor protein MotA  39.72 
 
 
295 aa  211  7.999999999999999e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0144418  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0512  flagellar motor protein MotA  41.34 
 
 
283 aa  211  1e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.738855  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1853  flagellar motor protein MotA  39.72 
 
 
295 aa  211  1e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00504562  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1538  flagellar motor protein MotA  39.22 
 
 
295 aa  211  1e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00177397  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1148  lateral flagellar motor protein MotA  41.09 
 
 
301 aa  210  2e-53  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0439  flagellar motor protein MotA  38.65 
 
 
284 aa  210  3e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4958  flagellar motor protein MotA  41.34 
 
 
283 aa  209  4e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.915585 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0235  flagellar motor protein MotA  39.36 
 
 
286 aa  209  4e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0116  flagellar motor protein MotA  38.65 
 
 
286 aa  209  4e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2854  flagellar motor protein MotA  39.36 
 
 
286 aa  209  4e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0253  flagellar motor protein MotA  39.36 
 
 
286 aa  209  4e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.203265  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2872  chemotaxis signal transduction protein CheY  41.7 
 
 
286 aa  209  4e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2790  flagellar motor component-like  38.87 
 
 
289 aa  209  6e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.995037  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4905  flagellar motor protein MotA  40.99 
 
 
283 aa  208  8e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4781  flagellar motor protein MotA  40.99 
 
 
283 aa  208  8e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5982  flagellar motor component-like protein  39.58 
 
 
289 aa  207  1e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.186422  normal  0.583801 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3355  flagellar motor protein MotA  39.36 
 
 
286 aa  207  1e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.428227 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1435  chemotaxis protein  41.54 
 
 
273 aa  208  1e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1035  flagellar motor protein MotA  41.28 
 
 
283 aa  207  1e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3113  flagellar motor protein MotA  39.36 
 
 
286 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2862  flagellar motor protein MotA  39.36 
 
 
286 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0162  flagellar motor protein MotA  39.36 
 
 
286 aa  206  2e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.968285 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0080  flagellar motor protein MotA  39.36 
 
 
286 aa  207  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3939  flagellar motor protein MotA  39.36 
 
 
286 aa  207  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3858  flagellar motor protein MotA  39.36 
 
 
286 aa  207  2e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03068  flagellar motor protein MotA  40.3 
 
 
284 aa  207  2e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1510  flagellar motor protein MotA  38.87 
 
 
295 aa  207  2e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0122942  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1681  flagellar motor protein MotA  39.36 
 
 
286 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.279788  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0179  flagellar motor protein MotA  39.01 
 
 
286 aa  207  2e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3438  flagellar motor protein MotA  39.36 
 
 
286 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3818  flagellar motor protein MotA  37.94 
 
 
286 aa  206  4e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3185  flagellar motor protein MotA  39.36 
 
 
286 aa  206  5e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0552503  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4953  chemotaxis motA protein  40.28 
 
 
283 aa  205  7e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0561  flagellar motor protein MotA  39.93 
 
 
283 aa  204  1e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2977  flagellar motor protein MotA  38.3 
 
 
286 aa  204  1e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000883737 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4184  flagellar motor protein MotA  37.1 
 
 
288 aa  204  1e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0166  flagellar motor protein MotA  39.01 
 
 
286 aa  204  1e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0227  putative chemotaxis (motility protein A) transmembrane  35.94 
 
 
290 aa  204  2e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.450881  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2238  flagellar motor protein MotA  39.36 
 
 
301 aa  204  2e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0604  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.08 
 
 
286 aa  204  2e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2887  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.71 
 
 
312 aa  203  2e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000634442 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4205  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.87 
 
 
289 aa  203  3e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2266  flagellar motor protein MotA  39.36 
 
 
301 aa  202  5e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1747  flagellar motor protein MotA  39.22 
 
 
295 aa  201  8e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0835896  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1636  flagellar motor protein MotA  39.22 
 
 
295 aa  201  8e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2123  flagellar motor protein MotA  38.87 
 
 
295 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000217676  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2976  flagellar motor protein MotA  35.56 
 
 
289 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.749081 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2629  flagellar motor protein MotA  38.87 
 
 
295 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000190208  hitchhiker  0.000000000000740297 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1316  flagellar motor protein MotA  35.56 
 
 
289 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.210771  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1294  flagellar motor protein MotA  38.87 
 
 
295 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000681717  decreased coverage  0.00000000786895 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01861  flagellar motor protein MotA  38.87 
 
 
295 aa  200  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00919512  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1750  flagellar motor protein MotA  38.87 
 
 
295 aa  200  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00519867  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1986  flagellar motor protein MotA  38.87 
 
 
295 aa  200  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000224268  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01850  hypothetical protein  38.87 
 
 
295 aa  200  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.021393  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1742  flagellar motor protein MotA  38.87 
 
 
295 aa  200  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.11312  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2827  flagellar motor protein MotA  39.22 
 
 
295 aa  200  1.9999999999999998e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.127647 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0867  flagellar motor protein MotA  38.73 
 
 
289 aa  200  3e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.177785 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4408  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.42 
 
 
286 aa  199  3.9999999999999996e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3815  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.97 
 
 
286 aa  198  7e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4217  flagellar motor protein MotA  38.77 
 
 
290 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.299726  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2749  flagellar motor protein MotA  34.51 
 
 
289 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.794955  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3088  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.62 
 
 
286 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0624  flagellar motor protein MotA  38.16 
 
 
283 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.895123 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3702  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.7 
 
 
270 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2139  flagellar motor protein MotA  37.46 
 
 
295 aa  195  6e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00816419  hitchhiker  5.2257999999999995e-28 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2079  flagellar motor protein MotA  37.46 
 
 
295 aa  195  6e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000367916  decreased coverage  0.000000495633 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1321  flagellar motor protein MotA  37.46 
 
 
295 aa  195  6e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.142338  decreased coverage  5.03142e-27 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2084  flagellar motor protein MotA  37.46 
 
 
295 aa  195  6e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.039228  unclonable  3.0299e-30 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1198  flagellar motor protein MotA  37.46 
 
 
295 aa  195  6e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000125742  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1900  flagellar motor protein MotA  39.57 
 
 
286 aa  195  7e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.139415  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2026  chemotaxis MotA protein  36.17 
 
 
293 aa  194  2e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00259722  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1001  chemotaxis signal transduction protein CheY  40.49 
 
 
285 aa  193  2e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1260  flagellar motor protein MotA  37.28 
 
 
287 aa  193  3e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0894303  normal  0.516828 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0722  chemotaxis motA protein  38.87 
 
 
285 aa  192  7e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.409995 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3454  flagellar motor protein MotA  38.3 
 
 
293 aa  191  1e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.345342 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0126  flagellar motor protein MotA  38.41 
 
 
290 aa  190  2e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5606  chemotaxis MotA protein  39.01 
 
 
287 aa  190  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.50598  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4421  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.97 
 
 
286 aa  190  2e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.65455 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3260  flagellar motor protein MotA  37.08 
 
 
289 aa  191  2e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>