37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2161 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2161  Heme oxygenase  100 
 
 		 201 aa  407  1e-113  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.447424  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3505  Heme oxygenase  53.92 
 
 		 204 aa  212  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1901  bacteriophytochrome heme oxygenase BphO  50.98 
 
 		 204 aa  203  2e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.497358  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1720  heme oxygenase  46.07 
 
 		 199 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2021  heme oxygenase-like protein  34.05 
 
 		 213 aa  92.4  3e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0976  hypothetical protein  35.11 
 
 		 195 aa  92  5e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.298908  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10710  hypothetical protein  37.57 
 
 		 195 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.951393 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3184  Heme oxygenase-like protein  35.87 
 
 		 207 aa  90.1  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3915  Heme oxygenase  31.49 
 
 		 185 aa  84.3  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.238149 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7208  haem oxygenase-like protein  30.69 
 
 		 191 aa  81.6  0.000000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3312  Haem oxygenase-like protein  31.72 
 
 		 195 aa  77  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.336654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4727  Heme oxygenase-like protein  33.17 
 
 		 230 aa  74.7  0.0000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1985  Haem oxygenase  29.73 
 
 		 219 aa  69.3  0.00000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2329  putative heme oxygenase  29.89 
 
 		 213 aa  68.6  0.00000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1496  Heme oxygenase  34.62 
 
 		 222 aa  66.6  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4450  heme oxygenase-like protein  35.16 
 
 		 185 aa  65.5  0.0000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4082  heme oxygenase  37.36 
 
 		 185 aa  65.5  0.0000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1420  Heme oxygenase-like protein  31.31 
 
 		 208 aa  63.9  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4278  hypothetical protein  30.26 
 
 		 251 aa  63.2  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.50077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3937  heme oxygenase  24.86 
 
 		 200 aa  62.4  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0358  Heme oxygenase  31.5 
 
 		 219 aa  62.4  0.000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_7212  Heme oxygenase  28.87 
 
 		 264 aa  61.2  0.000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.213316  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4190  Heme oxygenase  28.65 
 
 		 197 aa  60.8  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.449894  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0385  Heme oxygenase-like protein  32.81 
 
 		 194 aa  60.5  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.526162 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4563  Haem oxygenase-like protein  34.62 
 
 		 187 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.330788  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3722  heme oxygenase-like protein  33.33 
 
 		 197 aa  57  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.110484 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0149  bacteriophytochrome heme oxygenase  31.53 
 
 		 188 aa  56.2  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.542456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0885  heme oxygenase  31.05 
 
 		 235 aa  52.4  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2582  heme oxygenase, putative  29.73 
 
 		 196 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3062  Heme oxygenase  29.9 
 
 		 217 aa  47.8  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.486899  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0422  heme oxygenase  36.07 
 
 		 213 aa  46.6  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03309  hypothetical protein  28.48 
 
 		 168 aa  43.9  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.056141  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3134  heme oxygenase  25 
 
 		 196 aa  44.3  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0219  heme oxygenase  26.7 
 
 		 187 aa  44.3  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3288  Heme oxygenase-like protein  27.01 
 
 		 178 aa  43.9  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.319763  normal  0.123625 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2977  heme oxygenase  43.1 
 
 		 220 aa  42  0.006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.199779  normal  0.0466642 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1104  Heme oxygenase  27.75 
 
 		 204 aa  41.6  0.009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.039154  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>