29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_7212 on replicon NC_007489
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007489  RSP_7212  Heme oxygenase  100 
 
 		 264 aa  533  1e-150  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.213316  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4190  Heme oxygenase  100 
 
 		 197 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.449894  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4278  hypothetical protein  62.8 
 
 		 251 aa  293  1e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.50077  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0885  heme oxygenase  41.58 
 
 		 235 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3184  Heme oxygenase-like protein  32.09 
 
 		 207 aa  77  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7208  haem oxygenase-like protein  34.41 
 
 		 191 aa  74.3  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3505  Heme oxygenase  31.82 
 
 		 204 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0358  Heme oxygenase  31.98 
 
 		 219 aa  66.2  0.0000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1720  heme oxygenase  31.02 
 
 		 199 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3915  Heme oxygenase  25.67 
 
 		 185 aa  63.2  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.238149 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1901  bacteriophytochrome heme oxygenase BphO  30.43 
 
 		 204 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.497358  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2161  Heme oxygenase  28.87 
 
 		 201 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.447424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4727  Heme oxygenase-like protein  27.88 
 
 		 230 aa  56.2  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2021  heme oxygenase-like protein  31.38 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1496  Heme oxygenase  31.96 
 
 		 222 aa  54.3  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0149  bacteriophytochrome heme oxygenase  33.33 
 
 		 188 aa  52.8  0.000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.542456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3312  Haem oxygenase-like protein  33.08 
 
 		 195 aa  50.1  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.336654  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4082  heme oxygenase  42.53 
 
 		 185 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4563  Haem oxygenase-like protein  35.62 
 
 		 187 aa  49.7  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.330788  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0385  Heme oxygenase-like protein  32.89 
 
 		 194 aa  49.3  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.526162 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4450  heme oxygenase-like protein  42.05 
 
 		 185 aa  48.9  0.00007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1420  Heme oxygenase-like protein  32.47 
 
 		 208 aa  49.3  0.00007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1985  Haem oxygenase  36.07 
 
 		 219 aa  48.5  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3937  heme oxygenase  22.51 
 
 		 200 aa  48.1  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3722  heme oxygenase-like protein  31.66 
 
 		 197 aa  46.2  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.110484 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0422  heme oxygenase  25.26 
 
 		 213 aa  46.6  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2582  heme oxygenase, putative  35.87 
 
 		 196 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0976  hypothetical protein  27.42 
 
 		 195 aa  43.9  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.298908  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3698  Haem oxygenase-like protein  29.79 
 
 		 227 aa  43.5  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.434251  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>