25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_1104 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_1104  Heme oxygenase  100 
 
 		 204 aa  412  1e-114  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.039154  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1283  heme oxygenase, putative  85.29 
 
 		 254 aa  353  1e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4219  heme oxygenase  70.37 
 
 		 197 aa  259  2e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.388967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4380  Heme oxygenase  71.35 
 
 		 198 aa  254  5e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.815198  normal  0.171917 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1005  heme oxygenase  70.9 
 
 		 197 aa  251  6e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1042  heme oxygenase  70.9 
 
 		 197 aa  251  7e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.886307  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1004  heme oxygenase  70.37 
 
 		 197 aa  248  5e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4507  heme oxygenase  56.99 
 
 		 196 aa  194  6e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4838  heme oxygenase  51.56 
 
 		 198 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55580  heme oxygenase  51.03 
 
 		 198 aa  143  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.109066 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2582  heme oxygenase, putative  42.47 
 
 		 196 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3134  heme oxygenase  42.39 
 
 		 196 aa  129  3e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3698  Haem oxygenase-like protein  39.67 
 
 		 227 aa  125  5e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.434251  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3312  Haem oxygenase-like protein  39.57 
 
 		 195 aa  119  3e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.336654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0316  heme oxygenase  38.01 
 
 		 196 aa  114  1.0000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.806864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2445  heme oxygenase  37.04 
 
 		 199 aa  112  3e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0580222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3270  heme oxygenase  40.22 
 
 		 197 aa  107  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2021  heme oxygenase-like protein  30.22 
 
 		 213 aa  59.7  0.00000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3495  heme oxygenase protein  27.84 
 
 		 193 aa  57  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.477248  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2329  putative heme oxygenase  28.96 
 
 		 213 aa  53.5  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0149  bacteriophytochrome heme oxygenase  25.53 
 
 		 188 aa  49.3  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.542456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4727  Heme oxygenase-like protein  27.94 
 
 		 230 aa  48.1  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3937  heme oxygenase  29.03 
 
 		 200 aa  44.3  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3184  Heme oxygenase-like protein  27.33 
 
 		 207 aa  43.1  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2161  Heme oxygenase  27.75 
 
 		 201 aa  41.6  0.009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.447424  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>