30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_3134 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_3134  heme oxygenase  100 
 
 		 196 aa  400  1e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2582  heme oxygenase, putative  93.85 
 
 		 196 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3270  heme oxygenase  86.6 
 
 		 197 aa  316  1e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0316  heme oxygenase  53.93 
 
 		 196 aa  194  6e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.806864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3698  Haem oxygenase-like protein  46.32 
 
 		 227 aa  160  1e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.434251  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3312  Haem oxygenase-like protein  45.69 
 
 		 195 aa  154  9e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.336654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4380  Heme oxygenase  42.39 
 
 		 198 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.815198  normal  0.171917 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1104  Heme oxygenase  42.39 
 
 		 204 aa  129  3e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.039154  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1283  heme oxygenase, putative  39.67 
 
 		 254 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2445  heme oxygenase  41.8 
 
 		 199 aa  113  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0580222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4507  heme oxygenase  37.95 
 
 		 196 aa  111  6e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4219  heme oxygenase  39.46 
 
 		 197 aa  111  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.388967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55580  heme oxygenase  43.24 
 
 		 198 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.109066 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1042  heme oxygenase  40.54 
 
 		 197 aa  106  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.886307  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1005  heme oxygenase  40.54 
 
 		 197 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4838  heme oxygenase  42.7 
 
 		 198 aa  106  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1004  heme oxygenase  40 
 
 		 197 aa  105  4e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3937  heme oxygenase  25.13 
 
 		 200 aa  60.5  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3915  Heme oxygenase  23.03 
 
 		 185 aa  50.1  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.238149 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3184  Heme oxygenase-like protein  33.75 
 
 		 207 aa  47.4  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2021  heme oxygenase-like protein  32.02 
 
 		 213 aa  45.4  0.0005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1901  bacteriophytochrome heme oxygenase BphO  24.37 
 
 		 204 aa  44.3  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.497358  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0219  heme oxygenase  26.16 
 
 		 187 aa  44.3  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2161  Heme oxygenase  25 
 
 		 201 aa  44.3  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.447424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4278  hypothetical protein  40.37 
 
 		 251 aa  43.5  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.50077  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1720  heme oxygenase  27.89 
 
 		 199 aa  42.4  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4082  heme oxygenase  40.22 
 
 		 185 aa  42  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4450  heme oxygenase-like protein  39.36 
 
 		 185 aa  42  0.007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3288  Heme oxygenase-like protein  30.6 
 
 		 178 aa  41.6  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.319763  normal  0.123625 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3505  Heme oxygenase  26.74 
 
 		 204 aa  41.6  0.008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>