14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0219 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_0219  heme oxygenase  100 
 
 		 187 aa  384  1e-106  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1496  Heme oxygenase  27.33 
 
 		 222 aa  63.5  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3184  Heme oxygenase-like protein  27.93 
 
 		 207 aa  54.3  0.0000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2161  Heme oxygenase  26.7 
 
 		 201 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.447424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3915  Heme oxygenase  26.92 
 
 		 185 aa  50.8  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.238149 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3134  heme oxygenase  26.16 
 
 		 196 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3505  Heme oxygenase  27.54 
 
 		 204 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0358  Heme oxygenase  26.29 
 
 		 219 aa  46.6  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0422  heme oxygenase  26.02 
 
 		 213 aa  46.2  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2582  heme oxygenase, putative  26.16 
 
 		 196 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2021  heme oxygenase-like protein  25.67 
 
 		 213 aa  43.9  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3937  heme oxygenase  21.88 
 
 		 200 aa  43.1  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1901  bacteriophytochrome heme oxygenase BphO  27.57 
 
 		 204 aa  42.7  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.497358  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4278  hypothetical protein  24.86 
 
 		 251 aa  42  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.50077  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>