28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0358 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0358  Heme oxygenase  100 
 
 		 219 aa  425  1e-118  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7208  haem oxygenase-like protein  29.02 
 
 		 191 aa  76.3  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_7212  Heme oxygenase  31.98 
 
 		 264 aa  66.2  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.213316  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4190  Heme oxygenase  31.98 
 
 		 197 aa  66.2  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.449894  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2161  Heme oxygenase  31.5 
 
 		 201 aa  62.4  0.000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.447424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1496  Heme oxygenase  32.9 
 
 		 222 aa  60.8  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3937  heme oxygenase  23.27 
 
 		 200 aa  59.7  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3505  Heme oxygenase  27.14 
 
 		 204 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0976  hypothetical protein  32.67 
 
 		 195 aa  58.9  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.298908  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1720  heme oxygenase  29.35 
 
 		 199 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1901  bacteriophytochrome heme oxygenase BphO  25.85 
 
 		 204 aa  57  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.497358  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10710  hypothetical protein  32.65 
 
 		 195 aa  57  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.951393 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3184  Heme oxygenase-like protein  25.13 
 
 		 207 aa  55.5  0.0000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4278  hypothetical protein  30.65 
 
 		 251 aa  54.3  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.50077  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0885  heme oxygenase  42.17 
 
 		 235 aa  52.8  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3722  heme oxygenase-like protein  35.62 
 
 		 197 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.110484 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4450  heme oxygenase-like protein  36.36 
 
 		 185 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4082  heme oxygenase  36.36 
 
 		 185 aa  49.3  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2021  heme oxygenase-like protein  29.02 
 
 		 213 aa  48.9  0.00005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0385  Heme oxygenase-like protein  28.04 
 
 		 194 aa  48.9  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.526162 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3312  Haem oxygenase-like protein  30.61 
 
 		 195 aa  47  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.336654  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4563  Haem oxygenase-like protein  34.1 
 
 		 187 aa  46.2  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.330788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0422  heme oxygenase  24.1 
 
 		 213 aa  46.2  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2445  heme oxygenase  39.02 
 
 		 199 aa  45.8  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0580222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2329  putative heme oxygenase  37.33 
 
 		 213 aa  45.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0149  bacteriophytochrome heme oxygenase  23.3 
 
 		 188 aa  44.7  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.542456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4727  Heme oxygenase-like protein  29.82 
 
 		 230 aa  44.7  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3915  Heme oxygenase  26.99 
 
 		 185 aa  43.5  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.238149 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>