24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_0976 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_0976  hypothetical protein  100 
 
 
195 aa  384  1e-106  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.298908  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10710  hypothetical protein  85.64 
 
 
195 aa  333  5.999999999999999e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.951393 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1901  bacteriophytochrome heme oxygenase BphO  37.76 
 
 
204 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.497358  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3505  Heme oxygenase  38.46 
 
 
204 aa  95.1  5e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2161  Heme oxygenase  35.11 
 
 
201 aa  92  5e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.447424  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1720  heme oxygenase  36.84 
 
 
199 aa  89.4  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2977  heme oxygenase  36.56 
 
 
220 aa  87.8  9e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.199779  normal  0.0466642 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1985  Haem oxygenase  33.79 
 
 
219 aa  70.1  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4727  Heme oxygenase-like protein  31.78 
 
 
230 aa  68.6  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1281  Haem oxygenase-like protein  33.15 
 
 
222 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0716575  normal  0.0716923 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3915  Heme oxygenase  34.51 
 
 
185 aa  67  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.238149 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3184  Heme oxygenase-like protein  34.45 
 
 
207 aa  65.9  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2021  heme oxygenase-like protein  31.15 
 
 
213 aa  66.2  0.0000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7208  haem oxygenase-like protein  31.58 
 
 
191 aa  61.2  0.000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0358  Heme oxygenase  32.67 
 
 
219 aa  58.9  0.00000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4082  heme oxygenase  39.25 
 
 
185 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3937  heme oxygenase  42.11 
 
 
200 aa  51.6  0.000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0149  bacteriophytochrome heme oxygenase  25.77 
 
 
188 aa  51.2  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.542456  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4450  heme oxygenase-like protein  43.21 
 
 
185 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4563  Haem oxygenase-like protein  47.17 
 
 
187 aa  48.1  0.00007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.330788  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1420  Heme oxygenase-like protein  38.3 
 
 
208 aa  48.1  0.00007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4190  Heme oxygenase  27.27 
 
 
197 aa  43.9  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.449894  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_7212  Heme oxygenase  27.42 
 
 
264 aa  43.9  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.213316  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3312  Haem oxygenase-like protein  31.34 
 
 
195 aa  41.6  0.007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.336654  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>