21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_2977 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_2977  heme oxygenase  100 
 
 
220 aa  424  1e-118  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.199779  normal  0.0466642 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0976  hypothetical protein  39.58 
 
 
195 aa  95.1  7e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.298908  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1281  Haem oxygenase-like protein  42.05 
 
 
222 aa  94.7  9e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0716575  normal  0.0716923 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10710  hypothetical protein  39.69 
 
 
195 aa  91.7  9e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.951393 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3937  heme oxygenase  21.67 
 
 
200 aa  62.8  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3184  Heme oxygenase-like protein  28.65 
 
 
207 aa  57  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1720  heme oxygenase  30.41 
 
 
199 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0316  heme oxygenase  27.62 
 
 
196 aa  49.7  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.806864  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4727  Heme oxygenase-like protein  30.85 
 
 
230 aa  47  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0358  Heme oxygenase  30.5 
 
 
219 aa  46.2  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2161  Heme oxygenase  27.04 
 
 
201 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.447424  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2021  heme oxygenase-like protein  31 
 
 
213 aa  45.4  0.0007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03309  hypothetical protein  43.24 
 
 
168 aa  45.1  0.0008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.056141  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7208  haem oxygenase-like protein  27.46 
 
 
191 aa  45.1  0.0009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1901  bacteriophytochrome heme oxygenase BphO  26.2 
 
 
204 aa  45.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.497358  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0149  bacteriophytochrome heme oxygenase  32 
 
 
188 aa  43.1  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.542456  normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4278  hypothetical protein  29.02 
 
 
251 aa  42.4  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.50077  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3915  Heme oxygenase  27.16 
 
 
185 aa  42.4  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.238149 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1496  Heme oxygenase  28.87 
 
 
222 aa  42  0.007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2582  heme oxygenase, putative  36.36 
 
 
196 aa  41.6  0.008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1985  Haem oxygenase  33.33 
 
 
219 aa  41.6  0.009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>