17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_03309 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_03309  hypothetical protein  100 
 
 
168 aa  333  9e-91  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.056141  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1420  Heme oxygenase-like protein  41.76 
 
 
208 aa  51.6  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3915  Heme oxygenase  27.45 
 
 
185 aa  51.6  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.238149 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7208  haem oxygenase-like protein  26.49 
 
 
191 aa  51.2  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2161  Heme oxygenase  29.09 
 
 
201 aa  47  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.447424  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2021  heme oxygenase-like protein  33.08 
 
 
213 aa  47  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1496  Heme oxygenase  34.33 
 
 
222 aa  47  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3033  heme oxygenase protein  31.97 
 
 
178 aa  46.6  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0587692  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3288  Heme oxygenase-like protein  32.43 
 
 
178 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.319763  normal  0.123625 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1720  heme oxygenase  35.48 
 
 
199 aa  45.1  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0149  bacteriophytochrome heme oxygenase  25.48 
 
 
188 aa  44.3  0.0008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.542456  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2329  putative heme oxygenase  30.3 
 
 
213 aa  43.5  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0385  Heme oxygenase-like protein  31.11 
 
 
194 aa  43.5  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.526162 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3937  heme oxygenase  25.6 
 
 
200 aa  42.7  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2977  heme oxygenase  43.75 
 
 
220 aa  41.6  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.199779  normal  0.0466642 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3505  Heme oxygenase  30.69 
 
 
204 aa  41.2  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4278  hypothetical protein  38.46 
 
 
251 aa  40.8  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.50077  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>