21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2329 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_2329  putative heme oxygenase  100 
 
 		 213 aa  421  1e-117  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3288  Heme oxygenase-like protein  36.52 
 
 		 178 aa  95.1  7e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.319763  normal  0.123625 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3033  heme oxygenase protein  36.52 
 
 		 178 aa  83.2  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0587692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2161  Heme oxygenase  29.89 
 
 		 201 aa  68.6  0.00000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.447424  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3698  Haem oxygenase-like protein  30.23 
 
 		 227 aa  60.8  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.434251  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4727  Heme oxygenase-like protein  36.64 
 
 		 230 aa  56.6  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3915  Heme oxygenase  25.7 
 
 		 185 aa  55.5  0.0000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.238149 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1283  heme oxygenase, putative  27.07 
 
 		 254 aa  55.5  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3184  Heme oxygenase-like protein  32.04 
 
 		 207 aa  55.5  0.0000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3312  Haem oxygenase-like protein  28.99 
 
 		 195 aa  54.7  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.336654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1104  Heme oxygenase  28.96 
 
 		 204 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.039154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1720  heme oxygenase  32.78 
 
 		 199 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0149  bacteriophytochrome heme oxygenase  28.24 
 
 		 188 aa  52.8  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.542456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0316  heme oxygenase  26.09 
 
 		 196 aa  51.6  0.000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.806864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3495  heme oxygenase protein  31.54 
 
 		 193 aa  51.6  0.000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.477248  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7208  haem oxygenase-like protein  28.18 
 
 		 191 aa  49.7  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3505  Heme oxygenase  28.89 
 
 		 204 aa  48.1  0.00009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3937  heme oxygenase  23.76 
 
 		 200 aa  45.8  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0358  Heme oxygenase  37.33 
 
 		 219 aa  45.1  0.0009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1985  Haem oxygenase  31.79 
 
 		 219 aa  43.9  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3722  heme oxygenase-like protein  33.95 
 
 		 197 aa  43.1  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.110484 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>