29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_1283 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1283  heme oxygenase, putative  100 
 
 		 254 aa  519  1e-146  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1104  Heme oxygenase  85.29 
 
 		 204 aa  353  2e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.039154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4219  heme oxygenase  67.72 
 
 		 197 aa  254  9e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.388967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4380  Heme oxygenase  70.27 
 
 		 198 aa  248  8e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.815198  normal  0.171917 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1005  heme oxygenase  67.72 
 
 		 197 aa  246  2e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1042  heme oxygenase  67.72 
 
 		 197 aa  246  4e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.886307  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1004  heme oxygenase  67.72 
 
 		 197 aa  245  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4507  heme oxygenase  57.53 
 
 		 196 aa  194  1e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4838  heme oxygenase  51.3 
 
 		 198 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55580  heme oxygenase  51.03 
 
 		 198 aa  137  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.109066 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2582  heme oxygenase, putative  39.29 
 
 		 196 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3698  Haem oxygenase-like protein  39.67 
 
 		 227 aa  123  3e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.434251  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3134  heme oxygenase  39.67 
 
 		 196 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3312  Haem oxygenase-like protein  42.29 
 
 		 195 aa  113  3e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.336654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2445  heme oxygenase  37.57 
 
 		 199 aa  109  5e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0580222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0316  heme oxygenase  34.07 
 
 		 196 aa  102  6e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.806864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3270  heme oxygenase  39.13 
 
 		 197 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2329  putative heme oxygenase  27.07 
 
 		 213 aa  55.5  0.0000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3495  heme oxygenase protein  28.41 
 
 		 193 aa  53.9  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.477248  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4727  Heme oxygenase-like protein  28.04 
 
 		 230 aa  51.2  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0149  bacteriophytochrome heme oxygenase  26.8 
 
 		 188 aa  50.8  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.542456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2021  heme oxygenase-like protein  32.79 
 
 		 213 aa  49.7  0.00004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3937  heme oxygenase  29.27 
 
 		 200 aa  46.6  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4082  heme oxygenase  31.41 
 
 		 185 aa  44.7  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4563  Haem oxygenase-like protein  33.74 
 
 		 187 aa  44.3  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.330788  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4450  heme oxygenase-like protein  31.41 
 
 		 185 aa  43.1  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3184  Heme oxygenase-like protein  28.22 
 
 		 207 aa  42.7  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1985  Haem oxygenase  28.89 
 
 		 219 aa  42.4  0.007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1901  bacteriophytochrome heme oxygenase BphO  26.09 
 
 		 204 aa  42  0.009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.497358  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>