24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0316 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0316  heme oxygenase  100 
 
 
196 aa  404  1.0000000000000001e-112  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.806864  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2582  heme oxygenase, putative  54.1 
 
 
196 aa  194  6e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3134  heme oxygenase  53.93 
 
 
196 aa  194  6e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3270  heme oxygenase  54.75 
 
 
197 aa  183  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3312  Haem oxygenase-like protein  47.4 
 
 
195 aa  150  1e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.336654  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3698  Haem oxygenase-like protein  41.33 
 
 
227 aa  149  3e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.434251  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55580  heme oxygenase  44.69 
 
 
198 aa  119  3e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.109066 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4838  heme oxygenase  43.58 
 
 
198 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1104  Heme oxygenase  38.01 
 
 
204 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.039154  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4380  Heme oxygenase  35.67 
 
 
198 aa  107  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.815198  normal  0.171917 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2445  heme oxygenase  38.42 
 
 
199 aa  103  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0580222  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1283  heme oxygenase, putative  34.07 
 
 
254 aa  102  4e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4219  heme oxygenase  35 
 
 
197 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.388967  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1042  heme oxygenase  35.26 
 
 
197 aa  98.2  7e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.886307  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1005  heme oxygenase  35.26 
 
 
197 aa  98.2  8e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4507  heme oxygenase  36.31 
 
 
196 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1004  heme oxygenase  35.26 
 
 
197 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2021  heme oxygenase-like protein  29.27 
 
 
213 aa  52  0.000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2329  putative heme oxygenase  26.09 
 
 
213 aa  51.6  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3090  heme oxygenase  34.02 
 
 
214 aa  48.1  0.00008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.768796  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3915  Heme oxygenase  24.86 
 
 
185 aa  47  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.238149 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3937  heme oxygenase  25 
 
 
200 aa  45.8  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0885  heme oxygenase  31.82 
 
 
235 aa  42.4  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2161  Heme oxygenase  27.06 
 
 
201 aa  41.2  0.01  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.447424  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>