23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2445 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_2445  heme oxygenase  100 
 
 
199 aa  375  1e-103  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0580222  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3312  Haem oxygenase-like protein  46.5 
 
 
195 aa  138  4.999999999999999e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.336654  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3698  Haem oxygenase-like protein  46 
 
 
227 aa  138  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.434251  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3134  heme oxygenase  41.8 
 
 
196 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1104  Heme oxygenase  37.04 
 
 
204 aa  112  3e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.039154  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2582  heme oxygenase, putative  41.29 
 
 
196 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1283  heme oxygenase, putative  37.57 
 
 
254 aa  109  3e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0316  heme oxygenase  38.42 
 
 
196 aa  103  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.806864  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4380  Heme oxygenase  33.33 
 
 
198 aa  95.5  4e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.815198  normal  0.171917 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1005  heme oxygenase  36.59 
 
 
197 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1004  heme oxygenase  34.87 
 
 
197 aa  88.6  5e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1042  heme oxygenase  35.98 
 
 
197 aa  88.6  6e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.886307  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4219  heme oxygenase  35.2 
 
 
197 aa  87.8  8e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.388967  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4507  heme oxygenase  38.33 
 
 
196 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3270  heme oxygenase  38.89 
 
 
197 aa  84.3  9e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55580  heme oxygenase  37.37 
 
 
198 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.109066 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4838  heme oxygenase  36.84 
 
 
198 aa  69.3  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3937  heme oxygenase  22.22 
 
 
200 aa  58.5  0.00000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4278  hypothetical protein  34.03 
 
 
251 aa  53.1  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.50077  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0149  bacteriophytochrome heme oxygenase  26.84 
 
 
188 aa  51.6  0.000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.542456  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0358  Heme oxygenase  39.02 
 
 
219 aa  45.8  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2021  heme oxygenase-like protein  31.07 
 
 
213 aa  44.3  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3184  Heme oxygenase-like protein  26.18 
 
 
207 aa  42.7  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>