37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_4082 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_4082  heme oxygenase  100 
 
 		 185 aa  349  1e-95  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4450  heme oxygenase-like protein  93.51 
 
 		 185 aa  281  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4563  Haem oxygenase-like protein  80.21 
 
 		 187 aa  239  2e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.330788  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3722  heme oxygenase-like protein  58.92 
 
 		 197 aa  149  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.110484 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7208  haem oxygenase-like protein  35.64 
 
 		 191 aa  79.3  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2161  Heme oxygenase  37.36 
 
 		 201 aa  77  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.447424  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1901  bacteriophytochrome heme oxygenase BphO  36.02 
 
 		 204 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.497358  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1720  heme oxygenase  36.11 
 
 		 199 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3915  Heme oxygenase  28.02 
 
 		 185 aa  68.2  0.00000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.238149 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2021  heme oxygenase-like protein  35.12 
 
 		 213 aa  67  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3184  Heme oxygenase-like protein  30.57 
 
 		 207 aa  65.5  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1420  Heme oxygenase-like protein  37.91 
 
 		 208 aa  64.3  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0358  Heme oxygenase  36.41 
 
 		 219 aa  62  0.000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0149  bacteriophytochrome heme oxygenase  28.57 
 
 		 188 aa  62  0.000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.542456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0385  Heme oxygenase-like protein  33.7 
 
 		 194 aa  62  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.526162 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3505  Heme oxygenase  32.42 
 
 		 204 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0976  hypothetical protein  41.67 
 
 		 195 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.298908  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_7212  Heme oxygenase  37.42 
 
 		 264 aa  57  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.213316  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4190  Heme oxygenase  33.86 
 
 		 197 aa  57  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.449894  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4278  hypothetical protein  33.7 
 
 		 251 aa  56.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.50077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10710  hypothetical protein  38.26 
 
 		 195 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.951393 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2582  heme oxygenase, putative  39.47 
 
 		 196 aa  52  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1283  heme oxygenase, putative  32.7 
 
 		 254 aa  51.6  0.000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3937  heme oxygenase  25.29 
 
 		 200 aa  49.7  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1985  Haem oxygenase  34.92 
 
 		 219 aa  48.9  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3312  Haem oxygenase-like protein  35.12 
 
 		 195 aa  47.4  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.336654  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3288  Heme oxygenase-like protein  31.07 
 
 		 178 aa  47.8  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.319763  normal  0.123625 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4727  Heme oxygenase-like protein  28.64 
 
 		 230 aa  46.6  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3134  heme oxygenase  36.84 
 
 		 196 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0990  Heme oxygenase  33.71 
 
 		 215 aa  45.1  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1104  Heme oxygenase  31.03 
 
 		 204 aa  45.4  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.039154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0885  heme oxygenase  50 
 
 		 235 aa  44.7  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2329  putative heme oxygenase  36.25 
 
 		 213 aa  43.5  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1496  Heme oxygenase  31.28 
 
 		 222 aa  43.1  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0316  heme oxygenase  27.17 
 
 		 196 aa  42.7  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.806864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03309  hypothetical protein  36.14 
 
 		 168 aa  41.6  0.006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.056141  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3698  Haem oxygenase-like protein  29.09 
 
 		 227 aa  41.2  0.01  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.434251  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>