16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_3288 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_3288  Heme oxygenase-like protein  100 
 
 
178 aa  353  7.999999999999999e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.319763  normal  0.123625 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3033  heme oxygenase protein  75.84 
 
 
178 aa  258  3e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0587692  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2329  putative heme oxygenase  36.52 
 
 
213 aa  95.1  5e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4727  Heme oxygenase-like protein  34.78 
 
 
230 aa  59.7  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3312  Haem oxygenase-like protein  36.36 
 
 
195 aa  53.1  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.336654  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3495  heme oxygenase protein  34.43 
 
 
193 aa  47.8  0.00008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.477248  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3937  heme oxygenase  26.02 
 
 
200 aa  45.4  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2161  Heme oxygenase  27.01 
 
 
201 aa  43.9  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.447424  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3698  Haem oxygenase-like protein  28.89 
 
 
227 aa  43.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.434251  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03309  hypothetical protein  31.53 
 
 
168 aa  42.7  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.056141  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1720  heme oxygenase  33.33 
 
 
199 aa  42.4  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3134  heme oxygenase  30.6 
 
 
196 aa  41.6  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1985  Haem oxygenase  41.41 
 
 
219 aa  41.6  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1901  bacteriophytochrome heme oxygenase BphO  29.26 
 
 
204 aa  41.2  0.008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.497358  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4082  heme oxygenase  37.78 
 
 
185 aa  41.2  0.008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3184  Heme oxygenase-like protein  25.97 
 
 
207 aa  40.8  0.01  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>