23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_10710 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_10710  hypothetical protein  100 
 
 
195 aa  382  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.951393 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0976  hypothetical protein  85.64 
 
 
195 aa  333  5.999999999999999e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.298908  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1901  bacteriophytochrome heme oxygenase BphO  38.97 
 
 
204 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.497358  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3505  Heme oxygenase  38.02 
 
 
204 aa  92  5e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2161  Heme oxygenase  37.57 
 
 
201 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.447424  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1720  heme oxygenase  37.7 
 
 
199 aa  88.6  5e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2977  heme oxygenase  36.17 
 
 
220 aa  79  0.00000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.199779  normal  0.0466642 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3184  Heme oxygenase-like protein  33.61 
 
 
207 aa  66.2  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4727  Heme oxygenase-like protein  31.7 
 
 
230 aa  65.9  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2021  heme oxygenase-like protein  30.98 
 
 
213 aa  65.1  0.0000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1281  Haem oxygenase-like protein  35.63 
 
 
222 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0716575  normal  0.0716923 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7208  haem oxygenase-like protein  31.41 
 
 
191 aa  62.4  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1985  Haem oxygenase  33.1 
 
 
219 aa  61.6  0.000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3915  Heme oxygenase  32.5 
 
 
185 aa  61.2  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.238149 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0358  Heme oxygenase  32.65 
 
 
219 aa  57  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0149  bacteriophytochrome heme oxygenase  25.61 
 
 
188 aa  53.5  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.542456  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3937  heme oxygenase  34.67 
 
 
200 aa  48.9  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4082  heme oxygenase  41.86 
 
 
185 aa  48.5  0.00007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4450  heme oxygenase-like protein  45.16 
 
 
185 aa  45.8  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4563  Haem oxygenase-like protein  44.23 
 
 
187 aa  42.7  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.330788  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1420  Heme oxygenase-like protein  33.33 
 
 
208 aa  42  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0422  heme oxygenase  26.9 
 
 
213 aa  41.6  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3722  heme oxygenase-like protein  34.52 
 
 
197 aa  41.6  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.110484 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>