31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_1675 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_1675  hypothetical protein  100 
 
 		 135 aa  266  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00331149  normal  0.0598838 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1319  Sel1 domain-containing protein  66.94 
 
 		 161 aa  170  6.999999999999999e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000280635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21860  hypothetical protein  64.8 
 
 		 159 aa  160  6e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0613288  hitchhiker  0.00166864 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1866  hypothetical protein  63.2 
 
 		 159 aa  140  6e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.030081  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3044  Sel1-like protein  39.83 
 
 		 169 aa  75.1  0.0000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0371  hypothetical protein  44.16 
 
 		 322 aa  45.4  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.140367  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2175  hypothetical protein  41.07 
 
 		 156 aa  43.9  0.0008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.340086  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1107  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.71 
 
 		 270 aa  43.1  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00367364  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1430  Sel1 domain-containing protein  31.25 
 
 		 942 aa  43.1  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.356598 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6466  Sel1 repeat-containing protein  41.75 
 
 		 258 aa  42.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3079  Sel1 domain-containing protein  41.77 
 
 		 384 aa  42.7  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0573421  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0920  Sel1 domain-containing protein  39.02 
 
 		 159 aa  42.4  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3053  Sel1 domain-containing protein  40.78 
 
 		 258 aa  41.6  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.417858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3115  Sel1 domain-containing protein  41.75 
 
 		 250 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.420121  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1998  Sel1 domain-containing protein  33.73 
 
 		 172 aa  41.6  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000269346  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3170  Sel1 domain-containing protein  40.78 
 
 		 260 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0384839  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2768  Sel1 domain-containing protein  41.49 
 
 		 403 aa  41.6  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2501  Sel1 repeat-containing protein  41.75 
 
 		 250 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3861  TPR repeat protein  31.36 
 
 		 445 aa  41.2  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.548914  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0448  hypothetical protein  35.4 
 
 		 295 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.325854  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4233  Sel1  37.84 
 
 		 315 aa  41.2  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0234  hypothetical protein  35.4 
 
 		 295 aa  40.8  0.006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3203  hypothetical protein  35.4 
 
 		 295 aa  40.8  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0429  hypothetical protein  35.4 
 
 		 295 aa  40.8  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.417467  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1359  hypothetical protein  35.4 
 
 		 295 aa  40.8  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.129573  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0068  hypothetical protein  35.4 
 
 		 294 aa  40.8  0.006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.329291  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1431  Sel1 domain-containing protein  31.2 
 
 		 817 aa  40.8  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.726695 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0610  hypothetical protein  35.96 
 
 		 294 aa  40.8  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.57 
 
 		 528 aa  40.8  0.007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3131  Sel1 domain-containing protein  40.78 
 
 		 250 aa  40.4  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.705283 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0191  Sel1 domain protein repeat-containing protein  35.09 
 
 		 1344 aa  40  0.01  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>