17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_21860 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_21860  hypothetical protein  100 
 
 		 159 aa  308  2e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0613288  hitchhiker  0.00166864 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1866  hypothetical protein  94.97 
 
 		 159 aa  277  5e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.030081  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1319  Sel1 domain-containing protein  66.67 
 
 		 161 aa  199  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000280635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1675  hypothetical protein  64.8 
 
 		 135 aa  160  8.000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00331149  normal  0.0598838 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3044  Sel1-like protein  39.71 
 
 		 169 aa  77.4  0.00000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1617  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  36.97 
 
 		 798 aa  48.5  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.154049  normal  0.123391 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  30.56 
 
 		 528 aa  46.2  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1430  Sel1 domain-containing protein  34.09 
 
 		 942 aa  43.5  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.356598 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1281  Sel1 domain protein repeat-containing protein  36.92 
 
 		 231 aa  43.9  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.151556  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  29.01 
 
 		 789 aa  43.5  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1251  hypothetical protein  32.79 
 
 		 985 aa  43.5  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1277  Sel1 domain protein repeat-containing protein  29.31 
 
 		 481 aa  43.1  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4233  Sel1  39 
 
 		 315 aa  42.7  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0851  hypothetical protein  31.1 
 
 		 961 aa  42.7  0.002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00404215 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2003  Sel1 domain-containing protein  28.93 
 
 		 831 aa  42.4  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0515794  normal  0.0202924 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6931  putative Beta-lactamase  32.14 
 
 		 368 aa  42  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.565773 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1498  Sel1 domain protein repeat-containing protein  40.19 
 
 		 225 aa  42.4  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.464625  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>