35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1319 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_1319  Sel1 domain-containing protein  100 
 
 		 161 aa  311  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000280635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21860  hypothetical protein  66.67 
 
 		 159 aa  199  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0613288  hitchhiker  0.00166864 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1866  hypothetical protein  65.38 
 
 		 159 aa  177  8e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.030081  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1675  hypothetical protein  66.94 
 
 		 135 aa  170  9e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00331149  normal  0.0598838 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3044  Sel1-like protein  37.91 
 
 		 169 aa  81.6  0.000000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4233  Sel1  42.31 
 
 		 315 aa  49.3  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1430  Sel1 domain-containing protein  36.61 
 
 		 942 aa  47.4  0.00009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.356598 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3079  Sel1 domain-containing protein  42.86 
 
 		 384 aa  46.6  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0573421  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0191  Sel1 domain protein repeat-containing protein  32.58 
 
 		 1344 aa  47  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1938  Sel1 repeat-containing protein  31.96 
 
 		 425 aa  45.1  0.0005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1207  Sel1 domain-containing protein  33.88 
 
 		 350 aa  44.7  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.838617  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1504  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.65 
 
 		 528 aa  44.3  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1617  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  33.64 
 
 		 798 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.154049  normal  0.123391 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0203  Sel1 domain-containing protein  41.98 
 
 		 358 aa  43.9  0.0009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6931  putative Beta-lactamase  34.86 
 
 		 368 aa  43.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.565773 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2996  Sel1 domain protein repeat-containing protein  28.45 
 
 		 485 aa  42.7  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1498  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.21 
 
 		 225 aa  42.7  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.464625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0738  Sel1  42.31 
 
 		 1105 aa  43.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1281  Sel1 domain protein repeat-containing protein  37.04 
 
 		 231 aa  43.1  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.151556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2457  Sel1  34.88 
 
 		 348 aa  42.4  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.392587  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0360  hypothetical protein  36.59 
 
 		 305 aa  42.4  0.003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.162937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0727  hypothetical protein  37.5 
 
 		 1366 aa  42.4  0.003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.989916 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0852  hypothetical protein  31.9 
 
 		 789 aa  42  0.003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159871 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0920  Sel1 domain-containing protein  47.76 
 
 		 159 aa  42  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1985  Sel1 domain-containing protein  32.26 
 
 		 557 aa  42  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000285463  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0854  hypothetical protein  32.11 
 
 		 684 aa  41.2  0.007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109274 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0697  sel1 repeat-containing family protein  39.44 
 
 		 331 aa  40.8  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.10663  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1987  Sel1 domain-containing protein  33.02 
 
 		 505 aa  40.8  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.461505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1251  hypothetical protein  30.39 
 
 		 985 aa  40.8  0.008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1106  TPR repeat- and Sel1 domain-containing protein  30.68 
 
 		 523 aa  40.8  0.008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1008  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.86 
 
 		 363 aa  40.8  0.008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1533  TPR repeat-containing protein  34 
 
 		 976 aa  40.8  0.008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3567  Sel1 domain protein repeat-containing protein  34.69 
 
 		 360 aa  40.8  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0755433 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4852  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  35.14 
 
 		 766 aa  40.4  0.01  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.771827 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0477  tetratricopeptide repeat protein  29.13 
 
 		 496 aa  40.4  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.486757  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>