More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1085 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1085  NADH-dependent butanol dehydrogenase I  100 
 
 		 341 aa  696    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1437  iron-containing alcohol dehydrogenase  75.95 
 
 		 383 aa  545  1e-154  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1157  iron-containing alcohol dehydrogenase  52.06 
 
 		 382 aa  380  1e-104  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00089596  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2599  iron-containing alcohol dehydrogenase  52.65 
 
 		 382 aa  375  1e-103  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2016  NADH-dependent butanol dehydrogenase a (bdh i)  53.39 
 
 		 381 aa  365  1e-100  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000217256  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1285  NADH-dependent butanol dehydrogenase a  51.03 
 
 		 381 aa  358  7e-98  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.16188  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1900  biotin carboxyl carrier protein  51.04 
 
 		 381 aa  351  1e-95  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0387598  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1382  iron-containing alcohol dehydrogenase  47.66 
 
 		 388 aa  343  2.9999999999999997e-93  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.422911  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0106  iron-containing alcohol dehydrogenase  44.79 
 
 		 395 aa  306  4.0000000000000004e-82  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00140728  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0107  iron-containing alcohol dehydrogenase  44.79 
 
 		 395 aa  306  5.0000000000000004e-82  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000469096  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0807  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.76 
 
 		 379 aa  286  4e-76  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2858  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.72 
 
 		 387 aa  268  1e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3479  NADH-dependent butanol dehydrogenase A  40.72 
 
 		 387 aa  267  2e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.029085  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1681  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.57 
 
 		 385 aa  267  2e-70  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3747  alcohol dehydrogenase, iron-containing  41.25 
 
 		 387 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0271369  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1483  alcohol dehydrogenase, iron-containing  40.95 
 
 		 387 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.575813  hitchhiker  0.00657917 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3770  alcohol dehydrogenase, iron-containing  41.25 
 
 		 387 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000615777  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3465  NADH-dependent butanol dehydrogenase A  40.95 
 
 		 387 aa  266  4e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3819  alcohol dehydrogenase, iron-containing  40.06 
 
 		 387 aa  265  8e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0980324  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3729  alcohol dehydrogenase, iron-containing  40.65 
 
 		 387 aa  265  1e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.11531e-21 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3485  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.65 
 
 		 387 aa  264  2e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1754  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.57 
 
 		 385 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0850  NADH-dependent butanol dehydrogenase  38.24 
 
 		 390 aa  254  2.0000000000000002e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.794812  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0842  NADH-dependent butanol dehydrogenase  39.69 
 
 		 390 aa  251  9.000000000000001e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.828301  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3004  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.22 
 
 		 387 aa  251  1e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0241  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.54 
 
 		 389 aa  250  2e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0910  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.24 
 
 		 388 aa  250  3e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.319675  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20310  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.07 
 
 		 387 aa  246  4e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000010752  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0101  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.29 
 
 		 389 aa  244  1.9999999999999999e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0640895  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1024  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.64 
 
 		 388 aa  240  2e-62  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0469  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.41 
 
 		 387 aa  236  6e-61  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0101789 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0781  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.94 
 
 		 395 aa  232  7.000000000000001e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2537  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.5 
 
 		 392 aa  232  9e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1626  NADH-dependent butanol dehydrogenase A  38.63 
 
 		 394 aa  230  3e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0834  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.59 
 
 		 395 aa  229  5e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1566  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.77 
 
 		 395 aa  227  2e-58  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1710  NADH-dependent butanol dehydrogenase  35.78 
 
 		 395 aa  226  5.0000000000000005e-58  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1915  alcohol dehydrogenase, iron-containing  34.78 
 
 		 391 aa  223  3e-57  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00162384  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2463  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.36 
 
 		 390 aa  222  8e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3337  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.51 
 
 		 391 aa  216  2.9999999999999998e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0808546  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2911  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.22 
 
 		 390 aa  217  2.9999999999999998e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1643  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.82 
 
 		 393 aa  215  8e-55  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00183527  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1095  NADH-dependent butanol dehydrogenase II  33.81 
 
 		 396 aa  209  5e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2513  alcohol dehydrogenase, NAD(P)-dependent, iron-containing  35.24 
 
 		 385 aa  208  1e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.330042  normal  0.498939 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3126  alcohol dehydrogenase, iron-containing  35.71 
 
 		 389 aa  207  3e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3824  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.75 
 
 		 386 aa  206  6e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1928  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.5 
 
 		 398 aa  202  5e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2489  Iron-containing alcohol dehydrogenase  34.48 
 
 		 384 aa  202  9.999999999999999e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.603522  normal  0.114465 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3537  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.34 
 
 		 395 aa  199  6e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0946  NADH-dependent butanol dehydrogenase  33.44 
 
 		 395 aa  199  7e-50  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.00000000148725  normal  0.466249 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1872  Oxidoreductase  35.35 
 
 		 399 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.172761  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00850  Fe-dependent oxidoreductase, alcohol dehydrogenase  37.14 
 
 		 390 aa  196  5.000000000000001e-49  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1120  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.89 
 
 		 397 aa  191  2e-47  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000212  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.58 
 
 		 382 aa  190  2.9999999999999997e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0263  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.48 
 
 		 385 aa  189  5e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0050  alcohol dehydrogenase, iron-containing  33.75 
 
 		 414 aa  189  5e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0271  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.48 
 
 		 385 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0267  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.2 
 
 		 385 aa  189  7e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3566  NADH-dependent butanol dehydrogenase A, C-terminus  39.84 
 
 		 270 aa  189  8e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0377  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.8 
 
 		 385 aa  188  9e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07410  Fe-dependent oxidoreductase, alcohol dehydrogenase  31.32 
 
 		 402 aa  188  1e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01218  Iron-containing alcohol dehydrogenase  33.54 
 
 		 384 aa  187  3e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0286  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.86 
 
 		 385 aa  187  3e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000194898 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0223  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.69 
 
 		 382 aa  186  7e-46  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0271  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.91 
 
 		 385 aa  185  9e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2033  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.86 
 
 		 385 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.200015  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2492  butanol dehydrogenase, NADH-dependent, putative  34.08 
 
 		 385 aa  183  3e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1700  putative oxidoreductase  33.02 
 
 		 384 aa  183  3e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1094  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.02 
 
 		 382 aa  183  4.0000000000000006e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0017  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.73 
 
 		 386 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1035  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.28 
 
 		 385 aa  182  6e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00140437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1126  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.88 
 
 		 386 aa  181  2e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.293164 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0640  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.24 
 
 		 382 aa  179  9e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05947  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.33 
 
 		 397 aa  177  2e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0261  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.64 
 
 		 385 aa  176  4e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.883451  hitchhiker  0.00000170112 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4469  alcohol dehydrogenase, iron-containing  33.54 
 
 		 385 aa  175  9e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3672  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.43 
 
 		 381 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1151  alcohol dehydrogenase, iron-containing  31.55 
 
 		 382 aa  173  2.9999999999999996e-42  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3761  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.91 
 
 		 385 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0260  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.59 
 
 		 385 aa  172  6.999999999999999e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000464229 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0107  alcohol dehydrogenase, iron-containing  33.12 
 
 		 385 aa  172  9e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1107  alcohol dehydrogenase, iron-containing  33.12 
 
 		 385 aa  172  9e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.719096  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1276  alcohol dehydrogenase, iron-containing  33.12 
 
 		 385 aa  172  9e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1779  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.12 
 
 		 385 aa  172  9e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0587  alcohol dehydrogenase, iron-containing  33.67 
 
 		 385 aa  172  1e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1693  alcohol dehydrogenase, iron-containing  33.12 
 
 		 540 aa  171  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.821786  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0271  alcohol dehydrogenase, iron-containing  33.67 
 
 		 385 aa  172  1e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0668  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.67 
 
 		 385 aa  172  1e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0317  alcohol dehydrogenase, iron-containing  33.12 
 
 		 513 aa  171  1e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0260  alcohol dehydrogenase, iron-containing  33.12 
 
 		 521 aa  171  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.668846  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3925  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.33 
 
 		 385 aa  171  2e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0760  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.36 
 
 		 385 aa  170  3e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.473992  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2347  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.64 
 
 		 386 aa  170  3e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.820905  normal  0.1074 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1107  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.25 
 
 		 396 aa  169  5e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000979723  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1511  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.39 
 
 		 390 aa  169  6e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3111  alcohol dehydrogenase, iron-containing  33.02 
 
 		 385 aa  168  2e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0053  alcohol dehydrogenase, iron-containing  32.28 
 
 		 380 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4215  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.99 
 
 		 387 aa  167  2.9999999999999998e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3422  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.96 
 
 		 387 aa  165  1.0000000000000001e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3349  alcohol dehydrogenase, iron-containing  31.6 
 
 		 385 aa  165  1.0000000000000001e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0753084  normal  0.450631 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>