More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_3337 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_3337  iron-containing alcohol dehydrogenase  100 
 
 
391 aa  809    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0808546  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1566  iron-containing alcohol dehydrogenase  57.8 
 
 
395 aa  463  1e-129  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0241  iron-containing alcohol dehydrogenase  55.87 
 
 
389 aa  439  9.999999999999999e-123  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0469  iron-containing alcohol dehydrogenase  55.61 
 
 
387 aa  436  1e-121  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0101789 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0101  iron-containing alcohol dehydrogenase  53.96 
 
 
389 aa  434  1e-120  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0640895  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1024  iron-containing alcohol dehydrogenase  52.93 
 
 
388 aa  429  1e-119  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0842  NADH-dependent butanol dehydrogenase  51.53 
 
 
390 aa  404  1e-111  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.828301  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0850  NADH-dependent butanol dehydrogenase  51.02 
 
 
390 aa  401  9.999999999999999e-111  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.794812  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2911  iron-containing alcohol dehydrogenase  44.44 
 
 
390 aa  343  4e-93  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2858  iron-containing alcohol dehydrogenase  44.47 
 
 
387 aa  326  5e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00850  Fe-dependent oxidoreductase, alcohol dehydrogenase  43.29 
 
 
390 aa  326  5e-88  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1626  NADH-dependent butanol dehydrogenase A  45.38 
 
 
394 aa  323  4e-87  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3004  iron-containing alcohol dehydrogenase  43.96 
 
 
387 aa  321  9.999999999999999e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3819  alcohol dehydrogenase, iron-containing  43.96 
 
 
387 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0980324  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3485  iron-containing alcohol dehydrogenase  43.96 
 
 
387 aa  320  3.9999999999999996e-86  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1483  alcohol dehydrogenase, iron-containing  42.93 
 
 
387 aa  319  7e-86  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.575813  hitchhiker  0.00657917 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3465  NADH-dependent butanol dehydrogenase A  43.96 
 
 
387 aa  318  1e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3729  alcohol dehydrogenase, iron-containing  43.7 
 
 
387 aa  318  1e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.11531e-21 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3479  NADH-dependent butanol dehydrogenase A  43.7 
 
 
387 aa  317  3e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.029085  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3770  alcohol dehydrogenase, iron-containing  43.7 
 
 
387 aa  316  3e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000615777  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3747  alcohol dehydrogenase, iron-containing  43.44 
 
 
387 aa  316  5e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0271369  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1754  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.43 
 
 
385 aa  309  5.9999999999999995e-83  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20310  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.9 
 
 
387 aa  308  1.0000000000000001e-82  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000010752  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0910  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.79 
 
 
388 aa  303  2.0000000000000002e-81  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.319675  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1120  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.81 
 
 
397 aa  298  1e-79  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2463  iron-containing alcohol dehydrogenase  43.25 
 
 
390 aa  294  2e-78  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0807  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.89 
 
 
379 aa  291  1e-77  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07410  Fe-dependent oxidoreductase, alcohol dehydrogenase  38.42 
 
 
402 aa  287  2.9999999999999996e-76  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3824  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.77 
 
 
386 aa  284  2.0000000000000002e-75  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1915  alcohol dehydrogenase, iron-containing  39.24 
 
 
391 aa  281  2e-74  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00162384  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0106  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.75 
 
 
395 aa  280  4e-74  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00140728  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0107  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.75 
 
 
395 aa  279  5e-74  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000469096  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1107  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.05 
 
 
396 aa  276  4e-73  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000979723  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1382  iron-containing alcohol dehydrogenase  40.61 
 
 
388 aa  270  4e-71  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.422911  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2537  iron-containing alcohol dehydrogenase  37.63 
 
 
392 aa  269  5.9999999999999995e-71  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1710  NADH-dependent butanol dehydrogenase  37.28 
 
 
395 aa  265  1e-69  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1681  iron-containing alcohol dehydrogenase  39.75 
 
 
385 aa  264  2e-69  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1872  Oxidoreductase  39.29 
 
 
399 aa  259  7e-68  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.172761  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1643  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.95 
 
 
393 aa  250  4e-65  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00183527  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1900  biotin carboxyl carrier protein  36.96 
 
 
381 aa  249  5e-65  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0387598  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1095  NADH-dependent butanol dehydrogenase II  38.25 
 
 
396 aa  247  3e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1157  iron-containing alcohol dehydrogenase  38.4 
 
 
382 aa  246  4e-64  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00089596  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0223  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.98 
 
 
382 aa  246  6.999999999999999e-64  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2599  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.89 
 
 
382 aa  242  7.999999999999999e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0834  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.5 
 
 
395 aa  242  9e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1285  NADH-dependent butanol dehydrogenase a  36.15 
 
 
381 aa  241  1e-62  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.16188  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0781  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.25 
 
 
395 aa  239  5e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2016  NADH-dependent butanol dehydrogenase a (bdh i)  35.07 
 
 
381 aa  236  4e-61  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000217256  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1437  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.55 
 
 
383 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3479  alcohol dehydrogenase yqhD  35.25 
 
 
387 aa  233  5e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02884  alcohol dehydrogenase, NAD(P)-dependent  35.25 
 
 
387 aa  232  7.000000000000001e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0688  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.25 
 
 
387 aa  232  7.000000000000001e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02834  hypothetical protein  35.25 
 
 
387 aa  232  7.000000000000001e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3188  alcohol dehydrogenase yqhD  35.25 
 
 
387 aa  232  7.000000000000001e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0685  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.25 
 
 
387 aa  232  7.000000000000001e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3296  alcohol dehydrogenase yqhD  35.25 
 
 
387 aa  232  7.000000000000001e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.495379 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3439  alcohol dehydrogenase yqhD  35.25 
 
 
387 aa  232  7.000000000000001e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3537  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.82 
 
 
395 aa  231  2e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4322  alcohol dehydrogenase yqhD  34.97 
 
 
387 aa  231  2e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1928  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.81 
 
 
398 aa  229  7e-59  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0377  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.71 
 
 
385 aa  228  9e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1559  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.99 
 
 
390 aa  228  1e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000187518  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0946  NADH-dependent butanol dehydrogenase  33.84 
 
 
395 aa  228  1e-58  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.00000000148725  normal  0.466249 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0263  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.44 
 
 
385 aa  228  1e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0271  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.44 
 
 
385 aa  227  2e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0267  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.44 
 
 
385 aa  228  2e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2489  Iron-containing alcohol dehydrogenase  35.43 
 
 
384 aa  227  3e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.603522  normal  0.114465 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3419  alcohol dehydrogenase YqhD  35.12 
 
 
387 aa  227  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3514  alcohol dehydrogenase YqhD  35.12 
 
 
387 aa  227  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3413  alcohol dehydrogenase YqhD  35.12 
 
 
387 aa  226  5.0000000000000005e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3348  alcohol dehydrogenase YqhD  35.12 
 
 
387 aa  226  5.0000000000000005e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.838329  normal  0.712665 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3339  alcohol dehydrogenase YqhD  35.12 
 
 
387 aa  226  5.0000000000000005e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2347  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.14 
 
 
386 aa  226  5.0000000000000005e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.820905  normal  0.1074 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3422  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.88 
 
 
387 aa  226  6e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1096  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.5 
 
 
402 aa  226  7e-58  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.149705  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2513  alcohol dehydrogenase, NAD(P)-dependent, iron-containing  37.43 
 
 
385 aa  226  7e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.330042  normal  0.498939 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0271  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.16 
 
 
385 aa  223  3e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2033  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.28 
 
 
385 aa  223  4e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.200015  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01218  Iron-containing alcohol dehydrogenase  35.01 
 
 
384 aa  223  4.9999999999999996e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1511  iron-containing alcohol dehydrogenase  35.64 
 
 
390 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4215  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.24 
 
 
387 aa  220  3e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0760  iron-containing alcohol dehydrogenase  36.09 
 
 
385 aa  218  1e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.473992  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1085  NADH-dependent butanol dehydrogenase I  35.51 
 
 
341 aa  216  4e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3765  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.79 
 
 
387 aa  217  4e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0337  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.91 
 
 
387 aa  216  5e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0668  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.9 
 
 
385 aa  216  5.9999999999999996e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0587  alcohol dehydrogenase, iron-containing  32.9 
 
 
385 aa  216  5.9999999999999996e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0271  alcohol dehydrogenase, iron-containing  32.9 
 
 
385 aa  216  5.9999999999999996e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1107  alcohol dehydrogenase, iron-containing  33.9 
 
 
385 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.719096  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0286  iron-containing alcohol dehydrogenase  34.77 
 
 
385 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000194898 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1779  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.9 
 
 
385 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1276  alcohol dehydrogenase, iron-containing  33.9 
 
 
385 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0107  alcohol dehydrogenase, iron-containing  33.9 
 
 
385 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3603  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 
387 aa  213  3.9999999999999995e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.424043  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0317  alcohol dehydrogenase, iron-containing  33.9 
 
 
513 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0380  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.52 
 
 
387 aa  213  5.999999999999999e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.302694  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1013  iron-containing alcohol dehydrogenase  32 
 
 
406 aa  213  5.999999999999999e-54  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3925  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.52 
 
 
385 aa  213  7e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1693  alcohol dehydrogenase, iron-containing  33.9 
 
 
540 aa  212  7e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.821786  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0260  alcohol dehydrogenase, iron-containing  33.9 
 
 
521 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.668846  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>